More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0899 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0541  molybdopterin oxidoreductase  48.45 
 
 		 755 aa  706    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2375  molybdopterin oxidoreductase  58.25 
 
 		 747 aa  938    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1880  Formate dehydrogenase  75.24 
 
 		 744 aa  1196    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2377  Formate dehydrogenase  47.84 
 
 		 791 aa  723    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0899  Formate dehydrogenase  100 
 
 		 756 aa  1569    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1904  molydopterin dinucleotide-binding region  44.56 
 
 		 753 aa  617  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2511  molybdopterin oxidoreductase  44.18 
 
 		 776 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2365  molybdopterin oxidoreductase  43.87 
 
 		 777 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1907  molybdopterin oxidoreductase  41.97 
 
 		 794 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  34.71 
 
 		 729 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  32.8 
 
 		 745 aa  350  4e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1484  Nitrate reductase  32.83 
 
 		 739 aa  341  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  31.82 
 
 		 698 aa  332  2e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  32.98 
 
 		 747 aa  327  7e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2753  molydopterin dinucleotide-binding region  31.56 
 
 		 749 aa  307  4.0000000000000004e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.28964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  31.63 
 
 		 1135 aa  306  1.0000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  31.85 
 
 		 711 aa  295  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  31.11 
 
 		 726 aa  290  6e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  31.01 
 
 		 700 aa  290  7e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1006  molybdopterin oxidoreductase  30.88 
 
 		 761 aa  287  4e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.249803 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0930  molybdopterin oxidoreductase  31.27 
 
 		 731 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.99852  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2013  molybdopterin oxidoreductase  30.56 
 
 		 1055 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  29.32 
 
 		 1139 aa  282  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  29.73 
 
 		 1143 aa  278  4e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  31.61 
 
 		 891 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3092  molybdopterin oxidoreductase  27.23 
 
 		 791 aa  263  8.999999999999999e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  28.11 
 
 		 692 aa  229  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1580  molybdopterin oxidoreductase  27.64 
 
 		 694 aa  224  6e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  29.34 
 
 		 691 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  28.63 
 
 		 734 aa  221  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  28.61 
 
 		 691 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  28.51 
 
 		 691 aa  220  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  28.51 
 
 		 691 aa  220  6e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  28.51 
 
 		 691 aa  220  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  28.47 
 
 		 691 aa  220  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  29.28 
 
 		 692 aa  219  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  28.47 
 
 		 691 aa  220  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  28.84 
 
 		 691 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  28.36 
 
 		 691 aa  218  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  28.16 
 
 		 692 aa  218  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  28.61 
 
 		 670 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  28.97 
 
 		 691 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  29.03 
 
 		 708 aa  214  7e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  27.76 
 
 		 718 aa  212  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  28.06 
 
 		 698 aa  212  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  27.76 
 
 		 718 aa  212  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  29.32 
 
 		 690 aa  211  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  29.58 
 
 		 688 aa  210  7e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  28.73 
 
 		 708 aa  210  9e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  27.78 
 
 		 698 aa  208  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  27.08 
 
 		 718 aa  208  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.25 
 
 		 879 aa  207  8e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.32 
 
 		 893 aa  206  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3287  molybdopterin oxidoreductase  26.9 
 
 		 781 aa  206  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239512  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.29 
 
 		 893 aa  205  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  26.75 
 
 		 728 aa  206  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  27.19 
 
 		 666 aa  205  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  28.32 
 
 		 759 aa  204  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  27.24 
 
 		 739 aa  204  6e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  27.76 
 
 		 685 aa  203  9e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  27.73 
 
 		 703 aa  203  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  28.82 
 
 		 712 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  29.81 
 
 		 709 aa  202  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  28.26 
 
 		 720 aa  201  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  28.74 
 
 		 703 aa  201  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  27.51 
 
 		 692 aa  201  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  28.22 
 
 		 730 aa  200  7.999999999999999e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  27.79 
 
 		 701 aa  200  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  28.51 
 
 		 688 aa  197  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  28.51 
 
 		 688 aa  196  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  27.43 
 
 		 698 aa  196  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0336  molybdopterin oxidoreductase  27.47 
 
 		 695 aa  195  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0620  twin-arginine translocation pathway signal  27.64 
 
 		 741 aa  194  5e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.390565  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  27.72 
 
 		 899 aa  194  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.11 
 
 		 676 aa  193  1e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  26.7 
 
 		 726 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  28.92 
 
 		 697 aa  191  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  26.7 
 
 		 726 aa  191  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  26.22 
 
 		 758 aa  191  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0664  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  27.32 
 
 		 759 aa  190  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  26.22 
 
 		 758 aa  190  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  26.22 
 
 		 758 aa  190  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.27 
 
 		 900 aa  190  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  27.25 
 
 		 732 aa  189  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0723  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  27.18 
 
 		 759 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  26.97 
 
 		 722 aa  189  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1282  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.56 
 
 		 933 aa  189  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.402771 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  26.22 
 
 		 758 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  27.03 
 
 		 673 aa  188  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.97 
 
 		 676 aa  188  3e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2859  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.67 
 
 		 808 aa  188  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.960143 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.65 
 
 		 676 aa  188  3e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  27.93 
 
 		 684 aa  188  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  26.43 
 
 		 745 aa  187  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2235  thiosulfate reductase  25.95 
 
 		 758 aa  187  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209797  normal  0.286987 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.19 
 
 		 668 aa  187  6e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3266  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.18 
 
 		 988 aa  187  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271284  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.61 
 
 		 724 aa  187  8e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  25.47 
 
 		 760 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  26.12 
 
 		 727 aa  186  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>