More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3176 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3176  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 682 aa  1382    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.82825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0057  peptidoglycan glycosyltransferase  44.78 
 
 		 696 aa  488  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2241  peptidoglycan glycosyltransferase  43.58 
 
 		 646 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480711  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0956  peptidoglycan glycosyltransferase  43.06 
 
 		 599 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582613  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1850  peptidoglycan glycosyltransferase  40.17 
 
 		 614 aa  405  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2415  peptidoglycan glycosyltransferase  42.01 
 
 		 587 aa  399  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1045  penicillin-binding protein, transpeptidase  43.81 
 
 		 579 aa  385  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1273  peptidoglycan glycosyltransferase  43.22 
 
 		 585 aa  384  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.912676  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4054  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.79 
 
 		 584 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208935  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6180  division-specific transpeptidase, penicillin-binding protein  42.32 
 
 		 582 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2188  peptidoglycan glycosyltransferase  38.9 
 
 		 582 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.322833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3400  peptidoglycan glycosyltransferase  38.16 
 
 		 584 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210929  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2767  peptidoglycan glycosyltransferase  37.62 
 
 		 593 aa  363  7.0000000000000005e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29633  normal  0.967196 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1988  peptidoglycan glycosyltransferase  38.33 
 
 		 584 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3479  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.93 
 
 		 599 aa  356  1e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2013  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.88 
 
 		 574 aa  354  4e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.744065  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1738  peptidoglycan glycosyltransferase  40.31 
 
 		 594 aa  351  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.429704  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0686  peptidoglycan glycosyltransferase  36.43 
 
 		 614 aa  350  3e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5469  penicillin-binding protein transpeptidase  36.14 
 
 		 595 aa  348  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00596521  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5178  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.69 
 
 		 602 aa  348  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1437  penicillin-binding protein  37.5 
 
 		 607 aa  345  2e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.735736  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2600  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.05 
 
 		 586 aa  342  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595508  normal  0.773053 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4639  peptidoglycan glycosyltransferase  35.8 
 
 		 625 aa  342  1e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0570885 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1394  penicillin-binding protein  37.5 
 
 		 607 aa  342  1e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665563  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5102  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.8 
 
 		 625 aa  341  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0774  peptidoglycan glycosyltransferase  35.98 
 
 		 597 aa  342  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0631389  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2098  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  35.98 
 
 		 597 aa  342  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00289647  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2860  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.25 
 
 		 586 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49605  normal  0.0126787 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2088  peptidoglycan glycosyltransferase  36.41 
 
 		 582 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301383 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3953  peptidoglycan glycosyltransferase  39.57 
 
 		 579 aa  337  5e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.34165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0585  peptidoglycan glycosyltransferase  35.56 
 
 		 601 aa  336  7.999999999999999e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.821878  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2017  peptidoglycan glycosyltransferase  34.76 
 
 		 593 aa  335  2e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0685  peptidoglycan glycosyltransferase  34.77 
 
 		 597 aa  334  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146126  normal  0.329198 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2363  peptidoglycan glycosyltransferase  35.99 
 
 		 630 aa  330  4e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0360882 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2897  penicillin binding protein 2  38.78 
 
 		 583 aa  328  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0261  peptidoglycan glycosyltransferase  35.85 
 
 		 600 aa  326  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9532  penicillin-binding protein  35.9 
 
 		 585 aa  325  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110863  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2472  peptidoglycan synthetase ftsI precursor  38.79 
 
 		 597 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.431937  normal  0.436915 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  36.33 
 
 		 584 aa  319  1e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.765677  normal  0.258337 
 
 
-
 
NC_002978  WD1273  penicillin-binding protein  34.81 
 
 		 515 aa  317  4e-85  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.603055  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5367  peptidoglycan glycosyltransferase  34.55 
 
 		 577 aa  313  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.451655 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0953  putative penicillin binding protein  36.11 
 
 		 572 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.729723  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1887  peptidoglycan glycosyltransferase  35.78 
 
 		 562 aa  304  4.0000000000000003e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0305107 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1127  peptidoglycan glycosyltransferase  35.47 
 
 		 581 aa  297  4e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322887  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3673  peptidoglycan glycosyltransferase  36.96 
 
 		 584 aa  285  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165211  normal  0.119703 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  33.79 
 
 		 705 aa  244  5e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.74 
 
 		 614 aa  243  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.44 
 
 		 570 aa  238  4e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  32.93 
 
 		 622 aa  237  6e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  31.5 
 
 		 631 aa  234  4.0000000000000004e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  31.21 
 
 		 613 aa  229  2e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  31.32 
 
 		 578 aa  227  6e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  30.69 
 
 		 613 aa  226  1e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  31.16 
 
 		 580 aa  223  9e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  33.8 
 
 		 657 aa  220  5e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  30.9 
 
 		 576 aa  220  7e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  30.92 
 
 		 690 aa  219  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  31.09 
 
 		 575 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  29.95 
 
 		 646 aa  219  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  31.2 
 
 		 583 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  31.01 
 
 		 582 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  31.99 
 
 		 660 aa  216  7e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.26 
 
 		 657 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  31.75 
 
 		 579 aa  216  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.4 
 
 		 654 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  30.82 
 
 		 582 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  31.21 
 
 		 578 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  31.89 
 
 		 644 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  29.9 
 
 		 656 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  32.37 
 
 		 711 aa  213  7e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  30.3 
 
 		 695 aa  212  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.87 
 
 		 553 aa  212  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3524  peptidoglycan glycosyltransferase  29.29 
 
 		 587 aa  211  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.568102  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3393  penicillin-binding protein  29.29 
 
 		 587 aa  211  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2924  penicillin-binding protein 3  29.29 
 
 		 587 aa  211  5e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.15 
 
 		 662 aa  210  8e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  30.15 
 
 		 578 aa  210  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2565  stage V sporulation protein D  30.78 
 
 		 638 aa  209  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.18233  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  30.57 
 
 		 575 aa  209  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03264  peptidoglycan synthetase FtsI  30.75 
 
 		 585 aa  207  5e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  30.3 
 
 		 578 aa  207  5e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.42 
 
 		 645 aa  207  5e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  30.87 
 
 		 740 aa  206  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  31.06 
 
 		 570 aa  206  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  30.8 
 
 		 580 aa  206  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  30.49 
 
 		 579 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  29.48 
 
 		 586 aa  205  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  30.23 
 
 		 675 aa  205  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  29.82 
 
 		 578 aa  205  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  30.49 
 
 		 579 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  30.3 
 
 		 578 aa  204  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0755  peptidoglycan glycosyltransferase  28.83 
 
 		 587 aa  204  6e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0349  peptidoglycan glycosyltransferase  29.31 
 
 		 581 aa  203  8e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0139  peptidoglycan synthetase FtsI  28.22 
 
 		 588 aa  203  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0134  peptidoglycan synthetase FtsI  28.22 
 
 		 588 aa  203  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000490417 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0134  peptidoglycan synthetase FtsI  28.22 
 
 		 588 aa  203  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0138  peptidoglycan synthetase FtsI  28.22 
 
 		 588 aa  203  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.154008 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3516  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.42 
 
 		 588 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0092  peptidoglycan synthetase FtsI  30.42 
 
 		 588 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.948544 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0077  peptidoglycan synthetase FtsI  30.42 
 
 		 588 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>