88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0670 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0670  CHAD domain containing protein  100 
 
 
292 aa  584  1e-166  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.159134  hitchhiker  0.00700724 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  33.11 
 
 
504 aa  155  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  37.41 
 
 
596 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  34.59 
 
 
487 aa  125  9e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  30.58 
 
 
318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  31.27 
 
 
513 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  37.01 
 
 
511 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  31.45 
 
 
508 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  31.1 
 
 
508 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  30.31 
 
 
508 aa  100  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  26.78 
 
 
519 aa  90.9  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  29.86 
 
 
510 aa  89  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  32.87 
 
 
512 aa  89  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  36.29 
 
 
512 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  34.82 
 
 
512 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  34.46 
 
 
511 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  28.16 
 
 
494 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  35.37 
 
 
494 aa  73.9  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  27.66 
 
 
523 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  29.3 
 
 
499 aa  71.6  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  30.23 
 
 
505 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  32.62 
 
 
490 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  29.51 
 
 
540 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  29.51 
 
 
540 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  29.51 
 
 
540 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  29.96 
 
 
545 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  28.57 
 
 
543 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  26.85 
 
 
555 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  31.03 
 
 
588 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  29.96 
 
 
545 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0409  hypothetical protein  28 
 
 
292 aa  62.4  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0589  CHAD domain-contain protein  32.03 
 
 
577 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2063  CHAD domain-containing protein  27.21 
 
 
285 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.599842  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3325  CHAD domain containing protein  28.28 
 
 
286 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000007321  normal  0.186572 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5753  CHAD domain-containing protein  29.55 
 
 
291 aa  60.5  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718185  hitchhiker  0.00000000000775092 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1086  adenylate cyclase  29.15 
 
 
540 aa  59.3  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  30.47 
 
 
543 aa  59.3  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0293  hypothetical protein  31.97 
 
 
688 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2473  hypothetical protein  26.03 
 
 
289 aa  57.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  27.4 
 
 
522 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0325  CHAD domain-containing protein  31.97 
 
 
640 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1670  hypothetical protein  31.97 
 
 
640 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1473  CHAD domain-containing protein  31.97 
 
 
640 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57083  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  28.8 
 
 
920 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  26.97 
 
 
524 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  29.3 
 
 
329 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0872  CHAD domain-contain protein  32.74 
 
 
691 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  29.24 
 
 
328 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2434  CHAD domain-containing protein  32.74 
 
 
649 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967661  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000059  hypothetical protein  26.5 
 
 
309 aa  55.8  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.480452  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  28.51 
 
 
310 aa  55.8  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  25.68 
 
 
523 aa  55.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  27.42 
 
 
558 aa  55.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  25.78 
 
 
304 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2764  hypothetical protein  30.38 
 
 
308 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.538661  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  25.32 
 
 
327 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1914  CHAD  25.63 
 
 
313 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0216561  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  26.67 
 
 
505 aa  53.9  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  29.92 
 
 
719 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  27.81 
 
 
329 aa  52  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2570  CHAD domain-contain protein  33.19 
 
 
643 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  32.8 
 
 
508 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  25.27 
 
 
505 aa  50.4  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6748  CHAD domain containing protein  27.97 
 
 
325 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4897  CHAD domain-containing protein  22.99 
 
 
338 aa  50.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3043  hypothetical protein  29.71 
 
 
285 aa  50.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1449  adenylate cyclase  21.58 
 
 
519 aa  50.1  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3986  CHAD domain-containing protein  27.68 
 
 
277 aa  49.7  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000415563  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  26.67 
 
 
721 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2332  CHAD domain-containing protein  27.9 
 
 
283 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0977  hypothetical protein  25.1 
 
 
517 aa  47.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0637  hypothetical protein  27.88 
 
 
291 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  29.22 
 
 
521 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  31.03 
 
 
514 aa  47.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4307  CHAD domain containing protein  27.19 
 
 
293 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.948471  normal  0.595233 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5247  CHAD domain containing protein  28.39 
 
 
539 aa  46.2  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0011816  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  28.05 
 
 
358 aa  46.2  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  26.57 
 
 
512 aa  45.8  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  33.05 
 
 
509 aa  45.8  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3610  adenylate cyclase  29.18 
 
 
498 aa  45.8  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0101894 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  30.5 
 
 
510 aa  45.8  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1673  CHAD domain-contain protein  26.53 
 
 
467 aa  45.1  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1549  adenylate cyclase  25.37 
 
 
489 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196996 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1874  adenylate cyclase  25.37 
 
 
489 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2978  CHAD domain containing protein  27.88 
 
 
344 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000170033  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  26.67 
 
 
495 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3457  hypothetical protein  29.28 
 
 
265 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8613  hypothetical protein  30.71 
 
 
492 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>