61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5753 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5753  CHAD domain-containing protein  100 
 
 		 291 aa  562  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718185  hitchhiker  0.00000000000775092 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5247  CHAD domain containing protein  41.69 
 
 		 539 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0011816  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4030  adenylate cyclase  38.6 
 
 		 518 aa  145  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274894  normal  0.848067 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1449  adenylate cyclase  30.8 
 
 		 519 aa  143  4e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3610  adenylate cyclase  40.86 
 
 		 498 aa  119  6e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0101894 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1628  adenylate cyclase  26.76 
 
 		 518 aa  92  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0327322 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1861  adenylate cyclase  25.7 
 
 		 518 aa  89  8e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0847952 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  29.3 
 
 		 494 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0670  CHAD domain containing protein  29.87 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.159134  hitchhiker  0.00700724 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1159  adenylate cyclase  31.07 
 
 		 512 aa  75.9  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.964289  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  33.03 
 
 		 596 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  33.19 
 
 		 504 aa  65.9  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  33.6 
 
 		 511 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  32.89 
 
 		 490 aa  64.3  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  29.91 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  28.92 
 
 		 508 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  31.05 
 
 		 588 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  28.52 
 
 		 508 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  30.58 
 
 		 540 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  30.58 
 
 		 540 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  30.58 
 
 		 540 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  33.46 
 
 		 512 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  29.3 
 
 		 543 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  31.65 
 
 		 487 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  33.46 
 
 		 512 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  32.13 
 
 		 512 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3986  CHAD domain-containing protein  32.05 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000415563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  29.21 
 
 		 545 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  27.46 
 
 		 543 aa  57  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  29.67 
 
 		 545 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1549  adenylate cyclase  29.89 
 
 		 489 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196996 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1874  adenylate cyclase  29.89 
 
 		 489 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  28 
 
 		 555 aa  54.7  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  28.93 
 
 		 513 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  27.69 
 
 		 521 aa  53.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3325  CHAD domain containing protein  29.92 
 
 		 286 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000007321  normal  0.186572 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  30.9 
 
 		 329 aa  52.8  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  28.26 
 
 		 522 aa  52.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2764  hypothetical protein  31.65 
 
 		 308 aa  52.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.538661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  28.62 
 
 		 358 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2063  CHAD domain-containing protein  31.15 
 
 		 285 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.599842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  28.63 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3433  CHAD domain containing protein  29.15 
 
 		 598 aa  50.1  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.478083  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0409  hypothetical protein  30.77 
 
 		 292 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  27.43 
 
 		 508 aa  49.7  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2332  CHAD domain-containing protein  29 
 
 		 283 aa  49.3  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  29.68 
 
 		 510 aa  48.9  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  30.38 
 
 		 505 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  30.84 
 
 		 327 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6748  CHAD domain containing protein  30.08 
 
 		 325 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  25.85 
 
 		 523 aa  48.1  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17860  CHAD domain superfamily protein  33.5 
 
 		 253 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3092  CHAD domain containing protein  28.37 
 
 		 496 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0279278  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0589  CHAD domain-contain protein  31.09 
 
 		 577 aa  46.2  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  32.56 
 
 		 510 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1491  CHAD domain containing protein  30.56 
 
 		 490 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143999  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0338  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.08 
 
 		 445 aa  43.1  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.864147  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  29.46 
 
 		 304 aa  42.7  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  29.3 
 
 		 329 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  30.91 
 
 		 511 aa  42.7  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0259  CHAD  29.3 
 
 		 522 aa  42.4  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.822007 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>