224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4518 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4518  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 339 aa  674    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4969  aminoglycoside phosphotransferase  53.52 
 
 		 338 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5057  aminoglycoside phosphotransferase  53.52 
 
 		 338 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5350  aminoglycoside phosphotransferase  53.52 
 
 		 338 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13793  acyl-CoA dehydrogenase fadE36  50 
 
 		 351 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5603  aminoglycoside phosphotransferase  50.58 
 
 		 339 aa  323  4e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  50.3 
 
 		 347 aa  317  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1204  aminoglycoside phosphotransferase  50.29 
 
 		 340 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18680  predicted aminoglycoside phosphotransferase  47.11 
 
 		 357 aa  287  1e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.571289 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  45.48 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  43.03 
 
 		 338 aa  259  4e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  43.07 
 
 		 338 aa  255  7e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  43.29 
 
 		 341 aa  255  9e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  46.67 
 
 		 349 aa  248  8e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  42.14 
 
 		 344 aa  243  5e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3865  aminoglycoside phosphotransferase  44.58 
 
 		 350 aa  241  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  43.84 
 
 		 338 aa  238  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  40.37 
 
 		 315 aa  230  3e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  44.76 
 
 		 344 aa  229  6e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  40 
 
 		 354 aa  223  4e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  40.12 
 
 		 359 aa  216  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1831  aminoglycoside phosphotransferase  40.71 
 
 		 451 aa  216  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  39.94 
 
 		 353 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  39.38 
 
 		 356 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  40.37 
 
 		 343 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  38.65 
 
 		 343 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  39.76 
 
 		 357 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  39.42 
 
 		 347 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  40.26 
 
 		 349 aa  199  6e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  38.86 
 
 		 343 aa  199  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  38.86 
 
 		 343 aa  198  9e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  38.86 
 
 		 343 aa  198  9e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  38.86 
 
 		 343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  35.05 
 
 		 356 aa  196  5.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  36.77 
 
 		 344 aa  195  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  36.73 
 
 		 342 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  35.65 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  35.65 
 
 		 346 aa  193  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  35.19 
 
 		 343 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1149  aminoglycoside phosphotransferase  36.94 
 
 		 337 aa  190  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  35.4 
 
 		 358 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  34.88 
 
 		 343 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  33.63 
 
 		 358 aa  186  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  37.46 
 
 		 358 aa  186  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  33.95 
 
 		 364 aa  186  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  35.6 
 
 		 368 aa  186  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  35.76 
 
 		 350 aa  186  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  33.85 
 
 		 344 aa  186  7e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  33.55 
 
 		 348 aa  185  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  34.04 
 
 		 388 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  34.85 
 
 		 359 aa  184  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  34.58 
 
 		 352 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  33.13 
 
 		 354 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  36.82 
 
 		 352 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  35.29 
 
 		 368 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  33.04 
 
 		 362 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  34.37 
 
 		 362 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  35.64 
 
 		 391 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  32.59 
 
 		 354 aa  181  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  32.84 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  36.25 
 
 		 358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  34.91 
 
 		 361 aa  179  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  36.62 
 
 		 344 aa  179  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  36.42 
 
 		 344 aa  178  9e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  36.27 
 
 		 368 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  32.93 
 
 		 358 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  35.76 
 
 		 348 aa  176  6e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  33.23 
 
 		 337 aa  176  6e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 		 358 aa  175  9e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  34.05 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  35.43 
 
 		 353 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  34.67 
 
 		 368 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  35.85 
 
 		 357 aa  171  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  32.3 
 
 		 352 aa  172  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  31.85 
 
 		 351 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  33.23 
 
 		 352 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  34.37 
 
 		 368 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  34.37 
 
 		 368 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  34.37 
 
 		 368 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  34.37 
 
 		 368 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  34.37 
 
 		 368 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  34.21 
 
 		 353 aa  170  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  34.06 
 
 		 368 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  37.67 
 
 		 348 aa  169  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1805  aminoglycoside phosphotransferase  32.08 
 
 		 352 aa  169  6e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  33.75 
 
 		 368 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  33.02 
 
 		 353 aa  168  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  32.95 
 
 		 361 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  35.2 
 
 		 353 aa  166  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2960  aminoglycoside phosphotransferase  32.92 
 
 		 363 aa  166  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  32.83 
 
 		 361 aa  166  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  32.92 
 
 		 361 aa  166  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  37.19 
 
 		 355 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  33.23 
 
 		 361 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  31.74 
 
 		 361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  30.87 
 
 		 348 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  35.33 
 
 		 362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  33.75 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  37.63 
 
 		 339 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  34.93 
 
 		 355 aa  162  6e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>