155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4458 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4458  UspA domain protein  100 
 
 		 200 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0969362  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0420  UspA domain protein  48.05 
 
 		 164 aa  133  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.249948  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0218  UspA domain-containing protein  46.45 
 
 		 171 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0228  hypothetical protein  46.15 
 
 		 172 aa  132  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435291  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0238  UspA domain-containing protein  46.15 
 
 		 172 aa  132  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0416  UspA domain-containing protein  47.1 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0605514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0255  UspA domain-containing protein  45.22 
 
 		 162 aa  112  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951611 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8721  UspA domain protein  38.04 
 
 		 166 aa  94  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0485057  normal  0.0484371 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3100  UspA domain protein  32.48 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0512511  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 		 147 aa  61.2  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  30.32 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  26.67 
 
 		 296 aa  55.1  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  28.4 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  29.14 
 
 		 142 aa  53.9  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  33.12 
 
 		 155 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  28.66 
 
 		 151 aa  53.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  33.12 
 
 		 155 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  29.19 
 
 		 308 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  33.12 
 
 		 155 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  33.12 
 
 		 155 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  33.12 
 
 		 155 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  33.12 
 
 		 155 aa  52.4  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  29.61 
 
 		 163 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1740  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 159 aa  52  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0341137  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  38.27 
 
 		 145 aa  51.6  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  28.21 
 
 		 151 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4577  UspA domain-containing protein  29.61 
 
 		 294 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.309557  decreased coverage  0.000132557 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  38.37 
 
 		 145 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  49.3 
 
 		 298 aa  50.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  29.94 
 
 		 309 aa  50.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  27.39 
 
 		 157 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  27.74 
 
 		 150 aa  50.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0990  hypothetical protein  30.57 
 
 		 277 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1008  UspA domain-containing protein  30.57 
 
 		 277 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  32.48 
 
 		 155 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1018  UspA domain-containing protein  30.57 
 
 		 277 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  34.83 
 
 		 145 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  37.21 
 
 		 145 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  28.39 
 
 		 167 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  37.33 
 
 		 155 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  47.27 
 
 		 305 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  35.23 
 
 		 145 aa  49.7  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  41.1 
 
 		 164 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  50 
 
 		 298 aa  49.3  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  28.76 
 
 		 150 aa  49.3  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  41.1 
 
 		 164 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  37.88 
 
 		 145 aa  48.9  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  41.1 
 
 		 164 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  41.1 
 
 		 164 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  41.1 
 
 		 164 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  41.1 
 
 		 164 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0253  UspA domain-containing protein  24.83 
 
 		 130 aa  48.9  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.157205 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  28.86 
 
 		 141 aa  49.3  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  32.48 
 
 		 324 aa  49.3  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  29.75 
 
 		 162 aa  48.9  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  39.73 
 
 		 164 aa  48.1  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  30.19 
 
 		 390 aa  48.5  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  31.13 
 
 		 147 aa  48.5  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  29.63 
 
 		 151 aa  48.1  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3822  UspA domain protein  31.1 
 
 		 159 aa  47.8  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  27.92 
 
 		 154 aa  47.4  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  28.95 
 
 		 163 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  38.37 
 
 		 280 aa  47  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  29.11 
 
 		 159 aa  46.2  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  28.1 
 
 		 297 aa  46.2  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  46.15 
 
 		 156 aa  46.2  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  31.08 
 
 		 150 aa  46.6  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  24.36 
 
 		 139 aa  45.8  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  26.62 
 
 		 144 aa  45.8  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  24.26 
 
 		 164 aa  45.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  45.65 
 
 		 187 aa  45.1  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  44.19 
 
 		 341 aa  45.4  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  28.29 
 
 		 140 aa  45.4  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  33.64 
 
 		 151 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  32.45 
 
 		 140 aa  45.1  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  25 
 
 		 317 aa  45.1  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  41.89 
 
 		 280 aa  45.1  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  27.45 
 
 		 150 aa  45.1  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  28.05 
 
 		 158 aa  45.1  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  47.83 
 
 		 148 aa  45.1  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1268  universal stress protein  29.59 
 
 		 315 aa  44.7  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2428  universal stress protein  32.45 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  26.62 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2190  UspA domain-containing protein  30.32 
 
 		 148 aa  44.3  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1230  universal stress family protein  32.45 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296096  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1156  universal stress family protein  32.45 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  26.92 
 
 		 144 aa  44.3  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  25 
 
 		 140 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  34.29 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  31.48 
 
 		 148 aa  43.5  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  36.14 
 
 		 155 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  29.05 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  29.14 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  36.14 
 
 		 155 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  37.93 
 
 		 301 aa  43.5  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  40 
 
 		 152 aa  43.9  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  28.67 
 
 		 143 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  36.14 
 
 		 155 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  34.04 
 
 		 155 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>