152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3736 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3736  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 263 aa  525  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2830  ABC transporter, DrrB efflux protein  41.53 
 
 		 269 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578929  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2874  multidrug ABC transporter inner membrane protein  41.53 
 
 		 269 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.189586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2859  multidrug ABC transporter inner membrane protein  41.53 
 
 		 269 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.464408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3121  multidrug ABC transporter inner membrane protein  39.08 
 
 		 274 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.656441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3388  ABC-2 type transporter  40.61 
 
 		 282 aa  167  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12951  daunorubicin-dim-transport integral membrane protein ABC transporter drrB  34.92 
 
 		 289 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4328  ABC-2 type transporter  39.18 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0654  ABC-2 type transporter  34.57 
 
 		 270 aa  128  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122619  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  33.2 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  32.95 
 
 		 264 aa  99.4  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  32.62 
 
 		 247 aa  92  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  28 
 
 		 269 aa  88.6  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  28.77 
 
 		 267 aa  85.9  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0959  ABC-2 type transporter  30.58 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00197586  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  28.33 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  26.89 
 
 		 273 aa  82  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  28.81 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  28.52 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  29.32 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  28.39 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  28.39 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  28.39 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  28.39 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  26.91 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0895  ABC-2 type transporter  26.87 
 
 		 266 aa  79  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  29.69 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3106  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3166  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  28.76 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3212  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  28.81 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  27.54 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  28.22 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  30.89 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  28.32 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  28.32 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3120  multidrug ABC transporter inner membrane protein  27.62 
 
 		 284 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.561291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  28.32 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1258  ABC-2 type transporter  25.27 
 
 		 300 aa  75.5  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  30.72 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3016  ABC-2 type transporter  29.96 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.021308 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  27.32 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3446  ABC transporter, efflux permease protein  27.97 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00692281  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3986  ABC-2 type transporter  28 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3147  ABC-2 type transporter  27.97 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145802  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  26.71 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  26.71 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  26.5 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  26.71 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3253  ABC transporter related  28.65 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00665342  normal  0.245763 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  27.91 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3438  ABC transporter, efflux permease protein  27.97 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  25.42 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  25.51 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3387  multidrug ABC transporter inner membrane protein  25.43 
 
 		 281 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.169242 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  28.43 
 
 		 264 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  27.16 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  28.92 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3718  ABC-2 type transporter  29.51 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1476  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8859  ABC transporter permease  30.53 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  33.15 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  29.33 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  27.63 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0598  ABC-2 type transporter  31.48 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  26.14 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  31.75 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  25.2 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  27.16 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  25.63 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.49 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.75 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  28.49 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1525  ABC-2 type transporter  30.53 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00118323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  23 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3737  ABC-2 type transporter  23.72 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4383  ABC-2 type transporter  29.26 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1684  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2829  daunorubicin resistance protein C  24.49 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2873  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit C  24.49 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.118774 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2858  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit C  24.49 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6375  ABC-2 type transporter  24.34 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0655  ABC-2 type transporter  25.73 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121363  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2100  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4190  ABC-2 type transporter  25.64 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4674  ABC-2 type transporter  26.59 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  25.5 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4874  ABC-2 type transporter  29.57 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5718  ABC-2 type transporter  29.19 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  32.54 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0451  ABC-type multidrug transport system, permease component  23.95 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0034336  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12952  daunorubicin-dim-transport integral membrane protein ABC transporter drrC  25.77 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1189  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000916915 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2086  ABC-2 type transporter  29.21 
 
 		 267 aa  62  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  29.09 
 
 		 285 aa  62  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>