More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2555 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2555  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 234 aa  473  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.249679  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0977  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  39.74 
 
 		 266 aa  205  5e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.245429  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  39.57 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  36.05 
 
 		 282 aa  145  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  33.76 
 
 		 270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  33.05 
 
 		 272 aa  122  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  31.78 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  30.67 
 
 		 286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  31.36 
 
 		 281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  30.96 
 
 		 270 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6102  alpha/beta hydrolase fold  33.76 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 267 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  31.2 
 
 		 425 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 270 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 270 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 		 270 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  33.05 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  32.91 
 
 		 279 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 271 aa  102  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3907  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 269 aa  99.8  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804884  normal  0.943348 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4021  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 		 269 aa  99.8  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.000000197083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  30.21 
 
 		 270 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 		 283 aa  95.9  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  27.16 
 
 		 283 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  31.33 
 
 		 282 aa  89  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  27.35 
 
 		 277 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1790  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 287 aa  86.7  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.333084  hitchhiker  0.00365614 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 277 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  29.72 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  25.2 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3365  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.6363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0882  alpha/beta hydrolase fold  29.49 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.663068  normal  0.16136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5414  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.82 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  29.72 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  27.94 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  29.03 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3027  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 282 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1287  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 		 255 aa  81.6  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00130508  normal  0.0205637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  27.15 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  24.41 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4536  alpha/beta hydrolase fold protein  26.39 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.0123379 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  28.23 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3219  alpha/beta hydrolase fold protein  32.06 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  32.82 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1299  hypothetical protein  23.36 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000570356  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  25.7 
 
 		 262 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 		 272 aa  75.1  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 270 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0653  alpha/beta hydrolase fold protein  29.26 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.754721  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  26.11 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  26.29 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  26.94 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3606  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3391  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 336 aa  72.4  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445153  normal  0.48468 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  24.19 
 
 		 284 aa  72  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.466438 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4208  alpha/beta hydrolase fold protein  28.35 
 
 		 268 aa  72  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3601  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 		 264 aa  71.6  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.229176 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  27.6 
 
 		 284 aa  71.6  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5224  alpha/beta hydrolase fold protein  27.85 
 
 		 269 aa  71.6  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164951  normal  0.667008 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  25.79 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  22.98 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  22.98 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  27.15 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  28.22 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  22.58 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  23.67 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  22.58 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  24.14 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1465  alpha/beta hydrolase fold protein  26.3 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.647363  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0737  alpha/beta hydrolase fold protein  26.14 
 
 		 273 aa  68.6  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.755425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0186  alpha/beta hydrolase fold protein  26.59 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  29.17 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3585  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 		 270 aa  68.6  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1067  alpha/beta hydrolase fold protein  21.79 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  29.91 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0099  alpha/beta fold family hydrolase  23.7 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000675213 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  25 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  29.8 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  25 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1509  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.725835  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  26.32 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  26.32 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0502  alpha/beta hydrolase fold  24.79 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1019  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.154023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2025  alpha/beta hydrolase fold protein  24.7 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4138  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 268 aa  65.1  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.651356 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  27.71 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>