80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1747 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1747  hypothetical protein  100 
 
 		 536 aa  1056    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0923  hypothetical protein  56.51 
 
 		 527 aa  538  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13428  hypothetical protein  55.49 
 
 		 527 aa  491  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1202  hypothetical protein  55.64 
 
 		 529 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.344019  normal  0.0467691 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1192  hypothetical protein  55.64 
 
 		 529 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1175  hypothetical protein  55.21 
 
 		 532 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.24995  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1523  hypothetical protein  55.99 
 
 		 522 aa  481  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4898  hypothetical protein  55.35 
 
 		 531 aa  474  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.834206  normal  0.0834013 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3156  UMUC domain protein DNA-repair protein  49.25 
 
 		 510 aa  412  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000974062  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3467  DNA-repair protein  46.9 
 
 		 528 aa  363  6e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  normal  0.0126488 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3240  hypothetical protein  47.51 
 
 		 524 aa  349  7e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488053  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2288  DNA-repair protein  42.43 
 
 		 562 aa  317  3e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2945  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  39.51 
 
 		 505 aa  298  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.000000598538  decreased coverage  0.00000434939 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0994  hypothetical protein  39.67 
 
 		 527 aa  297  4e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21280  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  42.59 
 
 		 553 aa  295  1e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00165363  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2039  hypothetical protein  40.07 
 
 		 581 aa  290  3e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.566112  normal  0.522751 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1896  putative DNA-directed DNA polymerase  38.31 
 
 		 520 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.582074  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1440  hypothetical protein  41.7 
 
 		 549 aa  259  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15750  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  35.14 
 
 		 589 aa  249  6e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0334276  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5241  hypothetical protein  37.36 
 
 		 535 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0112063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1186  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  32.55 
 
 		 549 aa  215  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00000707508  normal  0.0119021 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  24.4 
 
 		 479 aa  62.4  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2779  hypothetical protein  27 
 
 		 545 aa  59.3  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.989391 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4054  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  23.57 
 
 		 526 aa  57.8  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  29.89 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4948  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  26.9 
 
 		 519 aa  57.4  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.777522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1537  hypothetical protein  26.88 
 
 		 472 aa  56.6  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  23.21 
 
 		 409 aa  57  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5725  hypothetical protein  27.87 
 
 		 468 aa  54.7  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2986  putative DNA-directed DNA polymerase  26.84 
 
 		 529 aa  55.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  24.36 
 
 		 499 aa  53.9  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3073  DNA-directed DNA polymerase  26.24 
 
 		 414 aa  53.5  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2256  hypothetical protein  26.14 
 
 		 501 aa  53.5  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3205  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  26.03 
 
 		 527 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.663167  normal  0.015197 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  25.52 
 
 		 409 aa  52.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4497  hypothetical protein  29.32 
 
 		 472 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00039  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  21.57 
 
 		 484 aa  52  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000511104  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4046  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  25.49 
 
 		 495 aa  52  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4251  hypothetical protein  30.51 
 
 		 395 aa  51.6  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240238  normal  0.380401 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  30.42 
 
 		 410 aa  51.6  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  30.56 
 
 		 399 aa  51.2  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4575  hypothetical protein  28.41 
 
 		 500 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.782674  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0809  hypothetical protein  29.66 
 
 		 507 aa  48.9  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3150  hypothetical protein  27.41 
 
 		 471 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0176  hypothetical protein  26.95 
 
 		 433 aa  49.3  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.876193  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  26.39 
 
 		 413 aa  49.3  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2005  hypothetical protein  26.39 
 
 		 478 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3264  hypothetical protein  28.11 
 
 		 477 aa  48.5  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4462  hypothetical protein  25.21 
 
 		 525 aa  48.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2364  DNA-directed DNA polymerase  30 
 
 		 409 aa  48.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259486  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5394  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.07 
 
 		 503 aa  47.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280036  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1326  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  24.34 
 
 		 473 aa  47.8  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0055  hypothetical protein  26.18 
 
 		 536 aa  47.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3469  hypothetical protein  27.16 
 
 		 480 aa  47.8  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5156  hypothetical protein  29.67 
 
 		 472 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249554  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3022  hypothetical protein  24.86 
 
 		 471 aa  47.4  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.302557 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2530  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  25.85 
 
 		 548 aa  47.4  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397333 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3293  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  29.29 
 
 		 522 aa  47.4  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247641  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3146  hypothetical protein  26.81 
 
 		 507 aa  47  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41691  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  26.97 
 
 		 409 aa  47  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  23.26 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  30.52 
 
 		 430 aa  46.6  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0070  hypothetical protein  25.82 
 
 		 483 aa  45.8  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28877  DNA repair protein  25.41 
 
 		 1118 aa  45.1  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.765985 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1679  DNA polymerase IV  22.03 
 
 		 385 aa  45.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.452401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3235  DNA-directed DNA polymerase  26.01 
 
 		 380 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  27.59 
 
 		 407 aa  45.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3997  hypothetical protein  23.74 
 
 		 499 aa  44.7  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  27.46 
 
 		 395 aa  44.3  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  25.5 
 
 		 390 aa  44.3  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  30.04 
 
 		 419 aa  44.7  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6768  hypothetical protein  28.93 
 
 		 486 aa  44.3  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5035  hypothetical protein  30.1 
 
 		 467 aa  43.9  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.0411477 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6270  hypothetical protein  26.57 
 
 		 492 aa  43.9  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.656674 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  30.05 
 
 		 419 aa  43.9  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2165  hypothetical protein  29.89 
 
 		 492 aa  43.9  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5188  DNA polymerase IV  24.17 
 
 		 425 aa  43.5  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4919  DNA-directed DNA polymerase  21.66 
 
 		 416 aa  43.5  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2295  hypothetical protein  27.78 
 
 		 472 aa  43.5  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0080  hypothetical protein  24.27 
 
 		 489 aa  43.5  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>