84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1110 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 		 158 aa  309  1e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  48.48 
 
 		 125 aa  98.6  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  39.29 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0740  preprotein translocase, SecE subunit  48.87 
 
 		 125 aa  94  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  40.44 
 
 		 136 aa  94  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0949  preprotein translocase subunit SecE  39.1 
 
 		 147 aa  91.3  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1233  preprotein translocase subunit SecE  42.03 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0938  preprotein translocase subunit SecE  38.35 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0921  preprotein translocase subunit SecE  38.35 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613648  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  59.68 
 
 		 168 aa  87  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  46.24 
 
 		 82 aa  80.9  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3939  preprotein translocase, SecE subunit  68.75 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2996  preprotein translocase subunit SecE  58.33 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10651  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0332132 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03620  preprotein translocase, SecE subunit  38.14 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4357  preprotein translocase, SecE subunit  49.37 
 
 		 84 aa  76.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  42.68 
 
 		 89 aa  76.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29890  preprotein translocase, SecE subunit  51.32 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.449965 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2708  preprotein translocase subunit SecE  53.23 
 
 		 89 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0212735 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5966  preprotein translocase SecE subunit  46.55 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.741704  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2660  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  55.56 
 
 		 81 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220907  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24000  preprotein translocase, SecE subunit  50.75 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224762  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0293  preprotein translocase subunit SecE  55.56 
 
 		 87 aa  72.4  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.970466 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3163  preprotein translocase, SecE subunit  52.38 
 
 		 87 aa  72.4  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.635579  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0610  preprotein translocase, SecE subunit  52.31 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4526  preprotein translocase, SecE subunit  48.84 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  43.01 
 
 		 85 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1621  preprotein translocase subunit SecE  38.71 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00100647  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4006  preprotein translocase, SecE subunit  44.07 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.031669 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21040  preprotein translocase, SecE subunit  38.1 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.245157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2678  preprotein translocase, SecE subunit  55.38 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5108  preprotein translocase, SecE subunit  57.41 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502951  normal  0.432233 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1218  preprotein translocase, SecE subunit  38.1 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000979518 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17310  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  44.12 
 
 		 83 aa  53.5  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6063  preprotein translocase, SecE subunit  53.12 
 
 		 87 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.962239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0567  SecE subunit of protein translocation complex  55.36 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  62.5 
 
 		 79 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  30.83 
 
 		 130 aa  50.4  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  44.44 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1445  SecE subunit of protein translocation complex  40.38 
 
 		 126 aa  49.7  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.716956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  39.66 
 
 		 127 aa  48.1  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0674  preprotein translocase, SecE subunit  54.24 
 
 		 77 aa  47.8  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0712566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0694  preprotein translocase, SecE subunit  48.28 
 
 		 81 aa  47.8  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0361  preprotein translocase, SecE subunit  35.09 
 
 		 72 aa  47.4  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000000871663  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0574  preprotein translocase, SecE subunit  39.8 
 
 		 96 aa  47.4  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.881053  hitchhiker  0.0062556 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  37.93 
 
 		 127 aa  47  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  41.51 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  51.06 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  31.71 
 
 		 83 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0741  preprotein translocase, SecE subunit  42.86 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0155553 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0282  SecE subunit of protein translocation complex  40.82 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632695  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0333  preprotein translocase subunit SecE  42.11 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.06103  normal  0.779327 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0347  preprotein translocase subunit SecE  42.11 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.423362  normal  0.683866 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1705  preprotein translocase subunit SecE  42.11 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.431782  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0559  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  46 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2561  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  44.23 
 
 		 65 aa  43.9  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2348  preprotein translocase subunit SecE  45.1 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00842063  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1931  preprotein translocase, SecE subunit  51.06 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000112962  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1321  preprotein translocase, SecE subunit  37.04 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  46.34 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0445  preprotein translocase subunit SecE  45.24 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2548  preprotein translocase subunit SecE  38.6 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2869  preprotein translocase subunit SecE  44.68 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.07093  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0385  preprotein translocase, SecE subunit  37.5 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.985835  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1533  preprotein translocase, SecE subunit  42.22 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000234675  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2168  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  42.22 
 
 		 86 aa  43.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.124432  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  42.55 
 
 		 82 aa  43.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2990  preprotein translocase subunit SecE  40.82 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0688  putative SecE preprotein translocase subunit  46.15 
 
 		 62 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.8362399999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0995  preprotein translocase subunit SecE  41.3 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000327583  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0886  preprotein translocase subunit SecE  41.3 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0831  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  40.38 
 
 		 64 aa  42  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1416  preprotein translocase subunit SecE  52.5 
 
 		 66 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.970626  normal  0.402516 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1893  preprotein translocase, SecE subunit  35.14 
 
 		 103 aa  42  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024176  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  46.15 
 
 		 80 aa  41.2  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4322  preprotein translocase, SecE subunit  45 
 
 		 84 aa  41.2  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2724  preprotein translocase subunit SecE  45.83 
 
 		 131 aa  41.2  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108515  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002167  preprotein translocase subunit SecE  43.75 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000092259  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_867  preprotein translocase SecE subunit  41.3 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000768713  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4477  preprotein translocase, SecE subunit  37.04 
 
 		 126 aa  40.8  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0226  preprotein translocase subunit SecE  43.86 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.33445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3324  preprotein translocase, SecE subunit  42.5 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00139323  normal  0.104735 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0636  preprotein translocase subunit SecE  33.82 
 
 		 81 aa  40.4  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0853  preprotein translocase, SecE subunit  47.37 
 
 		 51 aa  40.4  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000244118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>