64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2571 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0881  von Willebrand factor type A  54.97 
 
 
1077 aa  955    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2571  Ig domain protein group 2 domain protein  100 
 
 
942 aa  1922    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  31.96 
 
 
1300 aa  68.6  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  31.18 
 
 
1821 aa  65.9  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  31.55 
 
 
4630 aa  64.7  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.64 
 
 
723 aa  61.2  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0685  Ig domain protein group 2 domain protein  32.28 
 
 
437 aa  60.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  35.77 
 
 
725 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0484  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.98 
 
 
622 aa  58.2  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.417075  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4136  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.59 
 
 
1362 aa  57.4  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332177 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  31.43 
 
 
761 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  36.89 
 
 
738 aa  57  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  36.13 
 
 
732 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0242423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  32.54 
 
 
459 aa  55.8  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.16 
 
 
751 aa  55.5  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.16 
 
 
755 aa  55.1  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  33.61 
 
 
755 aa  55.1  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  30.98 
 
 
981 aa  55.1  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  33.83 
 
 
523 aa  54.7  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  32.12 
 
 
819 aa  54.3  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.16 
 
 
759 aa  54.3  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  38.3 
 
 
556 aa  53.9  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  36.71 
 
 
1048 aa  54.3  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0766  von Willebrand factor type A  35.82 
 
 
536 aa  54.3  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  39.76 
 
 
570 aa  53.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  44.93 
 
 
526 aa  53.5  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  31.08 
 
 
760 aa  52.8  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.61 
 
 
712 aa  52.4  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  33.33 
 
 
755 aa  51.6  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  45.76 
 
 
2638 aa  51.6  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  32.23 
 
 
430 aa  51.2  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0362  Ig-like domain-containing protein  30.43 
 
 
647 aa  51.2  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.318383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  42.25 
 
 
1418 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.57 
 
 
771 aa  50.8  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  24.04 
 
 
691 aa  50.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  32 
 
 
774 aa  49.7  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  31.01 
 
 
1831 aa  49.7  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.81 
 
 
772 aa  48.9  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1325  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.36 
 
 
812 aa  48.9  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000380778  hitchhiker  0.00814208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3212  von Willebrand factor type A  30.16 
 
 
514 aa  48.5  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0502803  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0497  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.11 
 
 
580 aa  48.5  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0152251  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  32.31 
 
 
543 aa  48.1  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2026  von Willebrand factor type A  25.73 
 
 
599 aa  48.1  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  34.11 
 
 
592 aa  48.1  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0140  hypothetical protein  29.41 
 
 
711 aa  47.8  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0386904  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  42.37 
 
 
1009 aa  47.8  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  28.22 
 
 
757 aa  47.8  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  33.62 
 
 
750 aa  47.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  30.97 
 
 
763 aa  47.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1988  hypothetical protein  34.72 
 
 
554 aa  47.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00985126  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  30.25 
 
 
418 aa  47  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.43 
 
 
740 aa  47  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1536  von Willebrand factor domain-containing protein  29.56 
 
 
920 aa  46.2  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5161  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.9 
 
 
729 aa  45.8  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.997936  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00090  Mg-chelatase subunit ChlD  32.33 
 
 
2281 aa  45.8  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.4181 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  32.79 
 
 
571 aa  45.8  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  27.83 
 
 
1556 aa  45.8  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4515  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  24.85 
 
 
795 aa  45.8  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1637  von Willebrand factor (vWF) domain containing protein  28.83 
 
 
794 aa  45.8  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  28.81 
 
 
903 aa  45.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  27.27 
 
 
771 aa  45.4  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.27 
 
 
772 aa  45.1  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  30.37 
 
 
609 aa  44.7  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  29.79 
 
 
345 aa  44.7  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>