More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2193 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2193  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  100 
 
 		 497 aa  1026    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0436  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  61.01 
 
 		 503 aa  616  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3805  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.83 
 
 		 509 aa  479  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000127885  hitchhiker  1.2294e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1366  ATP-dependent DNA helicase Q  47.44 
 
 		 509 aa  475  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000433489  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1646  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.44 
 
 		 509 aa  475  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1394  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.64 
 
 		 509 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000165058  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1367  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.44 
 
 		 509 aa  474  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1505  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.64 
 
 		 509 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000020318  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.44 
 
 		 509 aa  474  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50409e-40 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1540  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.44 
 
 		 509 aa  473  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1208  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.03 
 
 		 515 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000154408  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1407  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.12 
 
 		 509 aa  464  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000181661  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0760  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.83 
 
 		 479 aa  371  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462487  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0011  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.19 
 
 		 793 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00580778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.35 
 
 		 620 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.33 
 
 		 602 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6833  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.16 
 
 		 708 aa  303  5.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0326  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.22 
 
 		 626 aa  303  6.000000000000001e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.149933  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.6 
 
 		 611 aa  299  7e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.8 
 
 		 707 aa  299  7e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1049  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.99 
 
 		 459 aa  297  3e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.397749  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.64 
 
 		 608 aa  292  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.66 
 
 		 611 aa  291  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  45.56 
 
 		 611 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  45.56 
 
 		 611 aa  291  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.56 
 
 		 609 aa  291  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.35 
 
 		 608 aa  291  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.56 
 
 		 611 aa  291  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.695622 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  45.56 
 
 		 609 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.56 
 
 		 609 aa  291  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.56 
 
 		 609 aa  290  3e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00344  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.77 
 
 		 625 aa  290  3e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1538  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.4 
 
 		 459 aa  290  4e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1569  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.4 
 
 		 459 aa  290  4e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.56 
 
 		 609 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1920  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.07 
 
 		 563 aa  289  8e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000199537  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0332  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.07 
 
 		 613 aa  289  8e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2792  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.88 
 
 		 552 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3474  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.8 
 
 		 610 aa  288  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.73 
 
 		 607 aa  288  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0391  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.58 
 
 		 607 aa  287  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000840098 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0224  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.49 
 
 		 611 aa  288  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.29 
 
 		 646 aa  287  2.9999999999999996e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1318  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.71 
 
 		 419 aa  287  4e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.227704  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.1 
 
 		 599 aa  286  5e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.42 
 
 		 721 aa  286  5.999999999999999e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.61 
 
 		 599 aa  286  7e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.48 
 
 		 607 aa  286  8e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00196  ATP-dependent DNA helicase  44.51 
 
 		 613 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0333  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.51 
 
 		 607 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4296  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.44 
 
 		 715 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0839194  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3974  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.51 
 
 		 609 aa  285  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.172016  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0137  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.37 
 
 		 631 aa  285  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.837204  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4797  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.36 
 
 		 590 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3998  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.05 
 
 		 597 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0373347  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0327  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.2 
 
 		 724 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.946569  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.18 
 
 		 603 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.05 
 
 		 610 aa  284  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4241  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.78 
 
 		 607 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0555  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.05 
 
 		 610 aa  284  3.0000000000000004e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3822  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.44 
 
 		 615 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01900  ATP-dependent DNA helicase recQ  40.45 
 
 		 698 aa  283  5.000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.490742  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4552  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.24 
 
 		 608 aa  282  9e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645821 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.64 
 
 		 615 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2808  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.69 
 
 		 705 aa  281  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4285  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.64 
 
 		 615 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.362747 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.41 
 
 		 714 aa  281  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.55 
 
 		 709 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1919  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.26 
 
 		 706 aa  281  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77164  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.26 
 
 		 705 aa  280  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.26 
 
 		 705 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  42.26 
 
 		 705 aa  280  4e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1413  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.84 
 
 		 594 aa  280  4e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4345  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.64 
 
 		 615 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.13 
 
 		 614 aa  280  4e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.486098  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4187  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.64 
 
 		 615 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  42.26 
 
 		 705 aa  280  5e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.26 
 
 		 705 aa  280  5e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4166  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.64 
 
 		 615 aa  280  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2826  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.14 
 
 		 705 aa  280  5e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.46 
 
 		 593 aa  279  7e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.46 
 
 		 593 aa  279  7e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.41 
 
 		 607 aa  279  8e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0083  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.75 
 
 		 615 aa  279  9e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0383  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.87 
 
 		 607 aa  279  9e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0443  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.11 
 
 		 685 aa  279  9e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.84 
 
 		 705 aa  279  9e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2627  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.26 
 
 		 705 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.87 
 
 		 607 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.93 
 
 		 601 aa  278  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2818  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.26 
 
 		 705 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.01256  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.87 
 
 		 607 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1056  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.93 
 
 		 584 aa  279  1e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.3 
 
 		 599 aa  278  1e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0366  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.41 
 
 		 607 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0409  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.87 
 
 		 607 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000268253 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3763  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.69 
 
 		 607 aa  279  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.228349 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2543  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.04 
 
 		 543 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.8 
 
 		 596 aa  277  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.35 
 
 		 602 aa  277  3e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>