268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3887 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3803  transglutaminase domain protein  91.63 
 
 		 478 aa  843    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3887  transglutaminase domain protein  100 
 
 		 478 aa  969    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.978849 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4178  transglutaminase domain-containing protein  55.56 
 
 		 485 aa  548  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00683366  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0053  transglutaminase-like  52.43 
 
 		 484 aa  478  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.538035 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3361  transglutaminase domain-containing protein  48.28 
 
 		 515 aa  449  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3240  transglutaminase domain-containing protein  44.28 
 
 		 492 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3615  transglutaminase domain protein  42.6 
 
 		 485 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.859951  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0148  transglutaminase domain-containing protein  29.26 
 
 		 495 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4224  transglutaminase domain protein  26.41 
 
 		 515 aa  97.8  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.849724  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4075  transglutaminase-like  26.68 
 
 		 515 aa  97.8  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0348  transglutaminase domain-containing protein  27.35 
 
 		 510 aa  96.7  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.024702  normal  0.159475 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4199  transglutaminase domain protein  26.62 
 
 		 515 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.148466  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  36.3 
 
 		 1305 aa  84.7  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3474  transglutaminase domain-containing protein  30.27 
 
 		 528 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.934792  normal  0.0999002 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0784  transglutaminase domain protein  32.35 
 
 		 525 aa  70.1  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5617  transglutaminase domain protein  44.16 
 
 		 517 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0710722 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  32.26 
 
 		 634 aa  65.5  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0089  transglutaminase-like domain-containing protein  32.17 
 
 		 559 aa  64.7  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.890892  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3413  transglutaminase-like  33.33 
 
 		 523 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3562  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 		 523 aa  63.2  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.209631  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3494  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 		 523 aa  63.2  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.764922  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  26.04 
 
 		 266 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 		 314 aa  63.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0587  transglutaminase domain-containing protein  28.89 
 
 		 571 aa  61.6  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110498  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  27.16 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2177  transglutaminase domain-containing protein  27.97 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1888  transglutaminase domain-containing protein  27.97 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0165  transglutaminase domain protein  27.59 
 
 		 436 aa  59.3  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  28.86 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  26.63 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  29.71 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  28.46 
 
 		 286 aa  57  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  29.63 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  27.42 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  33.71 
 
 		 269 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  30.43 
 
 		 266 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1555  transglutaminase-like  35.04 
 
 		 500 aa  56.2  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.047572  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00820  Transglutaminase-like Super Family Protein  43.24 
 
 		 313 aa  56.2  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  28.97 
 
 		 266 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  32.74 
 
 		 276 aa  56.2  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11690  hypothetical protein  29.63 
 
 		 310 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.556512  normal  0.379907 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0177  transglutaminase-like protein  50 
 
 		 324 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  36.56 
 
 		 275 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  29.05 
 
 		 631 aa  55.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  37.88 
 
 		 265 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0562  transglutaminase domain protein  28.87 
 
 		 398 aa  55.1  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.567565  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  31.5 
 
 		 281 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  28.48 
 
 		 274 aa  54.7  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4075  transglutaminase domain-containing protein  40.26 
 
 		 287 aa  54.3  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5097  hypothetical protein  38.96 
 
 		 297 aa  54.3  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3081  transglutaminase-like protein  26.56 
 
 		 280 aa  54.3  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  29.7 
 
 		 263 aa  53.9  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  31.63 
 
 		 293 aa  53.5  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  34.44 
 
 		 274 aa  53.5  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  32.04 
 
 		 298 aa  53.5  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  26.6 
 
 		 254 aa  53.5  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5604  transglutaminase domain-containing protein  40 
 
 		 309 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.639349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2064  DNA-binding response regulator  28.42 
 
 		 359 aa  53.5  0.000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2638  transglutaminase-like  34.51 
 
 		 299 aa  52.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.947389  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1984  transglutaminase-like  36.78 
 
 		 291 aa  53.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  29.13 
 
 		 274 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 		 260 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4917  transglutaminase domain-containing protein  29.5 
 
 		 794 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.428939  normal  0.508817 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  34.52 
 
 		 260 aa  52.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  26.62 
 
 		 281 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0645  transglutaminase domain protein  31 
 
 		 288 aa  52.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  29.3 
 
 		 280 aa  52.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  35.37 
 
 		 268 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  35 
 
 		 258 aa  52.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  28.87 
 
 		 286 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0168  transglutaminase-like  46.34 
 
 		 326 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.867096  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  29.03 
 
 		 274 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4565  GCN5-related N-acetyltransferase  29.6 
 
 		 366 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  28.57 
 
 		 284 aa  51.6  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  35.64 
 
 		 316 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  35.37 
 
 		 268 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1814  transglutaminase domain protein  37.66 
 
 		 290 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.070269  hitchhiker  0.00579618 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2008  transglutaminase domain protein  37.66 
 
 		 290 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200502 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0177  transglutaminase domain protein  39.34 
 
 		 327 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.745602  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  32.43 
 
 		 276 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  32.43 
 
 		 276 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1738  transglutaminase-like cysteine protease  31.31 
 
 		 266 aa  50.8  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3992  hypothetical protein  25.12 
 
 		 1055 aa  50.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00061561  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4135  transglutaminase-like  33.82 
 
 		 304 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0188  transglutaminase domain protein  39.34 
 
 		 327 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00321272  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3166  transglutaminase domain protein  24.2 
 
 		 286 aa  50.4  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2469  transglutaminase domain-containing protein  33.04 
 
 		 313 aa  50.1  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.451679 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  32.14 
 
 		 298 aa  50.1  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  28.17 
 
 		 286 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2753  transglutaminase-like  36.17 
 
 		 288 aa  50.1  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.251215  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1555  transglutaminase domain-containing protein  35 
 
 		 290 aa  50.1  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2177  transglutaminase domain protein  27.67 
 
 		 336 aa  50.1  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  35.94 
 
 		 266 aa  50.1  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  25.54 
 
 		 285 aa  50.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  33.33 
 
 		 282 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2051  Protein of unknown function DUF2126  36 
 
 		 1078 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.86109  normal  0.238647 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0103  transglutaminase domain protein  25.88 
 
 		 343 aa  49.7  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  32.88 
 
 		 259 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  24.8 
 
 		 321 aa  50.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  34 
 
 		 265 aa  49.7  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>