More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3422 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  100 
 
 		 224 aa  454  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  95.54 
 
 		 224 aa  436  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  74.32 
 
 		 223 aa  338  5e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  73.54 
 
 		 225 aa  328  4e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  72.07 
 
 		 224 aa  324  5e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3016  ABC transporter related  65.32 
 
 		 227 aa  293  2e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  63.68 
 
 		 230 aa  288  4e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1250  putative ATP-binding component of a transport system  56.62 
 
 		 227 aa  263  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.40949e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1139  ABC transporter-related protein  58.56 
 
 		 225 aa  255  5e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1208  ABC transporter related  58.56 
 
 		 225 aa  255  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  54.55 
 
 		 233 aa  254  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  54.55 
 
 		 233 aa  254  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  54.55 
 
 		 233 aa  254  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  54.55 
 
 		 233 aa  254  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  54.55 
 
 		 233 aa  254  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2845  ABC transporter-related protein  56.74 
 
 		 246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3973  ABC transporter related protein  58.77 
 
 		 275 aa  250  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.39 
 
 		 238 aa  248  7e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  53.18 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  53.18 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.18 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  53.18 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  53.18 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  53.18 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  53.18 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  53.18 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  53.18 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.04 
 
 		 233 aa  244  4.9999999999999997e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  53.64 
 
 		 229 aa  244  4.9999999999999997e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2361  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.35 
 
 		 227 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0014315  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  52.73 
 
 		 233 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3744  ABC transporter related  55.5 
 
 		 230 aa  243  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.319618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  50.89 
 
 		 235 aa  241  5e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1119  ABC transporter related  57.21 
 
 		 224 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.986751  normal  0.0229909 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.51 
 
 		 231 aa  240  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0982  ABC transporter related protein  51.82 
 
 		 220 aa  240  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.452379 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53 
 
 		 231 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  51.34 
 
 		 238 aa  239  4e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  50.45 
 
 		 228 aa  238  4e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.94 
 
 		 236 aa  238  4e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  50.45 
 
 		 235 aa  238  4e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3382  ABC transporter related  52.68 
 
 		 225 aa  238  5e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1034  ABC transporter related  54.75 
 
 		 232 aa  238  5e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1796  ABC transporter related protein  56.56 
 
 		 229 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2202  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.61 
 
 		 227 aa  238  5.999999999999999e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.15426 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2784  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  52.27 
 
 		 235 aa  238  5.999999999999999e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0359571  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  54.34 
 
 		 225 aa  238  6.999999999999999e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711904  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  51.79 
 
 		 234 aa  238  8e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  51.6 
 
 		 230 aa  237  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  52.23 
 
 		 235 aa  236  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5400  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.97 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  51.34 
 
 		 234 aa  236  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.15 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  51.34 
 
 		 234 aa  235  3e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.6 
 
 		 236 aa  235  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2094  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.39 
 
 		 225 aa  235  3e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0980636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  51.34 
 
 		 234 aa  235  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.68 
 
 		 253 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  52.73 
 
 		 226 aa  234  6e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.68 
 
 		 253 aa  234  6e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.68 
 
 		 253 aa  234  6e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1692  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 219 aa  233  1.0000000000000001e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.623229 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  51.13 
 
 		 227 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.13 
 
 		 227 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0612  ABC transporter related  50.89 
 
 		 228 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0037706  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  49.55 
 
 		 227 aa  231  5e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4461  ABC transporter related  51.36 
 
 		 247 aa  231  5e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.856819  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  49.77 
 
 		 242 aa  230  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00596  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.78 
 
 		 236 aa  230  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.68 
 
 		 230 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  50.23 
 
 		 227 aa  229  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (lipoprotein)  51.33 
 
 		 229 aa  229  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00216433  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0920  ABC transporter related  51.36 
 
 		 228 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  50.23 
 
 		 227 aa  229  3e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0699  ABC transporter related  51.36 
 
 		 229 aa  228  6e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 227 aa  228  6e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3012  ABC transporter related  50.91 
 
 		 217 aa  228  7e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.134737 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1042  ABC transporter related  50.67 
 
 		 229 aa  228  7e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2233  ABC-type lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.75 
 
 		 201 aa  228  7e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3478  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  48.65 
 
 		 258 aa  228  8e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.741929  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2392  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.07 
 
 		 231 aa  227  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000179176  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1955  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.07 
 
 		 231 aa  227  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00212141  normal  0.0513198 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.07 
 
 		 231 aa  227  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.214498  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1649  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50.45 
 
 		 235 aa  227  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2403  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.07 
 
 		 231 aa  227  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.017802  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2039  ABC transporter related  51.64 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1118  lipoprotein releasing system ATP-binding ABC transporter  50.23 
 
 		 244 aa  226  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107348  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0776  ABC lipoprotein efflux transporter, ATPase subunit, LolD  52.68 
 
 		 224 aa  226  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2863  ABC transporter related  51.85 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.479401  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0943  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.66 
 
 		 227 aa  226  2e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2735  ABC transporter related  53.15 
 
 		 223 aa  226  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.31749  normal  0.728727 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1373  ABC transporter related  50.23 
 
 		 227 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  48.66 
 
 		 235 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3587  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 		 232 aa  224  6e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.32 
 
 		 233 aa  224  6e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1905  ABC transporter  50.68 
 
 		 232 aa  224  8e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.030671  hitchhiker  0.00477686 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2599  ABC transporter related  51.39 
 
 		 232 aa  224  9e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.215852  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 		 232 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  49.1 
 
 		 228 aa  223  1e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>