More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6810 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
169 aa  335  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7135  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.83 
 
 
254 aa  222  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0065631  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.09 
 
 
244 aa  142  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.64 
 
 
247 aa  139  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.75 
 
 
239 aa  127  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.75 
 
 
244 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0663055  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.75 
 
 
244 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.932372  normal  0.125579 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19640  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  39.3 
 
 
261 aa  127  9.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.44 
 
 
239 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.44 
 
 
239 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.76 
 
 
239 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.97 
 
 
271 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.08 
 
 
244 aa  125  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.18 
 
 
238 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.539797 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3563  p-cumic alcohol dehydrogenase (CymB)  38.74 
 
 
252 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.822337  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.5 
 
 
257 aa  111  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0613473  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5170  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.5 
 
 
257 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.5 
 
 
246 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.1 
 
 
255 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.78 
 
 
249 aa  108  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
276 aa  108  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185872  hitchhiker  0.0000125896 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 
257 aa  108  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.612868  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 
251 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 
251 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.83 
 
 
246 aa  108  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2068  putative L-2,3-butanediol dehydrogenase  36.65 
 
 
261 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000343042  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 
258 aa  105  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  34.54 
 
 
249 aa  104  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0232  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.43 
 
 
251 aa  104  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 
253 aa  103  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.18 
 
 
247 aa  103  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 
250 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 
251 aa  103  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1255  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.78 
 
 
247 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
245 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  36.07 
 
 
254 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2225  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.79 
 
 
267 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 
269 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 
254 aa  102  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.487626 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4047  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.42 
 
 
249 aa  102  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.45 
 
 
253 aa  102  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
251 aa  102  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 
251 aa  102  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
250 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767599  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 
252 aa  101  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.44 
 
 
255 aa  101  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 
254 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.66 
 
 
254 aa  101  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.247602  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.81 
 
 
260 aa  102  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 
257 aa  101  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1164  gluconate 5-dehydrogenase  33.86 
 
 
263 aa  101  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
252 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.432541  normal  0.506504 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
257 aa  100  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000680094  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1150  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.66 
 
 
253 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0549  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  38.62 
 
 
248 aa  100  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.613292 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
250 aa  100  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0489  sorbitol dehydrogenase  33.5 
 
 
260 aa  100  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000937678  hitchhiker  0.00159634 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3095  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.84 
 
 
246 aa  100  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.025547 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
252 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.69 
 
 
244 aa  100  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0719  sorbitol dehydrogenase  33.5 
 
 
260 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000035805  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5146  short chain dehydrogenase  39.57 
 
 
249 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.485132 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
259 aa  99.8  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0259011  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
248 aa  99.8  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.574158  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6404  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.86 
 
 
246 aa  99.4  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 
257 aa  99.4  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3247  sorbitol dehydrogenase  33.5 
 
 
260 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0320221  normal  0.626785 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 
246 aa  99  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.86578  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3057  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.35 
 
 
246 aa  99.4  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.030998  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3289  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 
272 aa  99.4  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2858  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.35 
 
 
246 aa  99  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 
262 aa  99  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.95 
 
 
250 aa  98.6  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
245 aa  98.6  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
255 aa  98.6  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
263 aa  98.2  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.13 
 
 
239 aa  98.2  5e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.91 
 
 
249 aa  97.8  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.69 
 
 
244 aa  97.8  6e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.63 
 
 
248 aa  97.8  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.81 
 
 
258 aa  97.8  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549001  normal  0.44275 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4625  short chain dehydrogenase  37.57 
 
 
249 aa  97.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402352  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 
257 aa  97.8  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.67 
 
 
246 aa  97.4  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
257 aa  97.4  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 
259 aa  97.4  8e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332234  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
247 aa  97.4  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7084  gluconate 5-dehydrogenase  35.45 
 
 
255 aa  97.4  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 
248 aa  97.1  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1904  gluconate 5-dehydrogenase  31.77 
 
 
270 aa  97.1  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000312184  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 
245 aa  97.1  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0298  sorbitol dehydrogenase  35.98 
 
 
262 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514875  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.83 
 
 
257 aa  96.7  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
253 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.83 
 
 
246 aa  96.7  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00235885 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 
251 aa  97.1  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.05 
 
 
255 aa  96.7  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.64 
 
 
247 aa  96.7  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.7 
 
 
279 aa  96.7  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
263 aa  96.3  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>