More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6786 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6786  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 297 aa  576  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0625  alpha/beta hydrolase fold  69.06 
 
 		 423 aa  249  4e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6010  alpha/beta hydrolase fold  58.29 
 
 		 421 aa  208  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773155  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1142  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  48.33 
 
 		 390 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.152589  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  44.34 
 
 		 397 aa  160  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  48.89 
 
 		 350 aa  159  6e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.38332 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0901  alpha/beta hydrolase fold  52.05 
 
 		 360 aa  142  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0560  alpha/beta hydrolase fold protein  41.62 
 
 		 390 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04600  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  45.55 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.374511 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  42.19 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  42.19 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.428268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  42.19 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4266  alpha/beta hydrolase fold protein  43.75 
 
 		 364 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0879  alpha/beta hydrolase fold protein  44.07 
 
 		 349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6555  alpha/beta hydrolase fold protein  44.85 
 
 		 366 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381661  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1497  alpha/beta hydrolase fold protein  42.51 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0991  alpha/beta hydrolase fold protein  39.47 
 
 		 389 aa  125  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  hitchhiker  0.00638838 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1191  alpha/beta hydrolase fold protein  41.9 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4933  alpha/beta hydrolase fold  41.9 
 
 		 362 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1485  alpha/beta hydrolase fold  43.65 
 
 		 362 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.409347  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3856  alpha/beta hydrolase fold  41.67 
 
 		 364 aa  123  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775297  normal  0.514851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  48.23 
 
 		 304 aa  122  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0541  alpha/beta hydrolase fold protein  40.53 
 
 		 344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.271487 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  49.28 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3387  alpha/beta hydrolase fold  47.1 
 
 		 306 aa  115  8.999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1712  alpha/beta hydrolase fold protein  36.53 
 
 		 373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4246  alpha/beta hydrolase fold  41.88 
 
 		 364 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146629  hitchhiker  0.00549727 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  40.76 
 
 		 296 aa  102  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0254  alpha/beta hydrolase fold protein  39.88 
 
 		 348 aa  101  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0728  alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 		 336 aa  99.4  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000117195  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1699  putative hydrolase  33.94 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5476  alpha/beta hydrolase fold  37.36 
 
 		 333 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294136  normal  0.797092 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1555  alpha/beta hydrolase fold  39.73 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1579  alpha/beta hydrolase fold  39.73 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1525  alpha/beta hydrolase fold  39.73 
 
 		 318 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0190867  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4502  alpha/beta hydrolase fold  38.75 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.297988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13192  non-heme haloperoxidase hpx  36.67 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.305997 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4827  alpha/beta hydrolase fold protein  40.56 
 
 		 352 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.692638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1865  alpha/beta hydrolase fold  38 
 
 		 325 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0853648  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0457  alpha/beta hydrolase fold protein  38.82 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0777  alpha/beta hydrolase fold protein  37.74 
 
 		 347 aa  76.3  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3656  alpha/beta hydrolase fold protein  38.76 
 
 		 347 aa  72.4  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  29.51 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  34.88 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  42.72 
 
 		 568 aa  62.8  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  34.71 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3146  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  36.04 
 
 		 257 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2084  alpha/beta hydrolase fold protein  39.81 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2172  Alpha/beta hydrolase fold  32.88 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  32.77 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1844  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  0.0141832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  42.5 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07460  lysophospholipase  37.01 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  37.25 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  39.13 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1700  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148356  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3210  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.45774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7032  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  normal  0.207733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  36.75 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  35.09 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.94 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4592  alpha/beta hydrolase fold  36.29 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3626  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5684  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  34.11 
 
 		 280 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6048  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.850826 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4021  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.425727  normal  0.727928 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  32.46 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  38.6 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  30.65 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  34.92 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0704  alpha/beta hydrolase fold  36.54 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.166516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1812  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 		 276 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0465722  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7479  Alpha/beta hydrolase  30.14 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  25.68 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0315  alpha/beta hydrolase fold  36.29 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  32.87 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5598  alpha/beta hydrolase fold  37.25 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  37 
 
 		 602 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3995  chloroperoxidase precursor  31.51 
 
 		 276 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1463  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879851  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6365  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0929699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  35.82 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5814  alpha/beta hydrolase fold  37.25 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.086599  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  32.74 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0565  alpha/beta hydrolase fold protein  36.84 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.441314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  33.04 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  32.74 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  34.83 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  26.23 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  36.27 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29020  chloroperoxidase precursor  31.29 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.995557  hitchhiker  0.000198264 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>