More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6472 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 254 aa  504  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.32 
 
 		 280 aa  253  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3934  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.64 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.45 
 
 		 293 aa  183  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  0.058004 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1729  short chain dehydrogenase  41.2 
 
 		 227 aa  142  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0974  short chain dehydrogenase  41.99 
 
 		 230 aa  142  6e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0177058  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39280  short chain dehydrogenase  40.61 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 		 227 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0180181  normal  0.277757 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.94 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.91873  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7025  short chain dehydrogenase  41.03 
 
 		 229 aa  128  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6051  short chain dehydrogenase  35.81 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0202908  normal  0.993323 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.61 
 
 		 238 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0854  short chain dehydrogenase  34.78 
 
 		 225 aa  122  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0159157 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.77 
 
 		 248 aa  116  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.31881  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.24 
 
 		 225 aa  115  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.67 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 		 272 aa  113  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25540  short-chain alcohol dehydrogenase  38.26 
 
 		 255 aa  112  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4049  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.3 
 
 		 238 aa  112  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.76 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.186526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.22 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.62 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 		 249 aa  109  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.92 
 
 		 274 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.44 
 
 		 264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0676  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 		 254 aa  108  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00917144  normal  0.0792915 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.86 
 
 		 285 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1778  oxidoreductase, short chain dehydrogenase  38.43 
 
 		 228 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 		 231 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.44 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 249 aa  107  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 		 231 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.93 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.47 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.78 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00230  short-chain alcohol dehydrogenase  38.56 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1596  short chain dehydrogenase  33.91 
 
 		 245 aa  106  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.184756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.62 
 
 		 275 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5763  short chain dehydrogenase  32.77 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5387  short chain dehydrogenase  32.77 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 		 260 aa  105  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5476  short chain dehydrogenase  32.77 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0679291  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.22 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.13 
 
 		 264 aa  105  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200417  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 		 246 aa  105  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0101774  normal  0.961149 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  32.92 
 
 		 1270 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.33 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.640458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 		 248 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172179  normal  0.840489 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1826  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.22 
 
 		 239 aa  102  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3588  short chain dehydrogenase  31.4 
 
 		 267 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.22 
 
 		 242 aa  102  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0438  short chain dehydrogenase  31.4 
 
 		 267 aa  102  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.22 
 
 		 242 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.22 
 
 		 242 aa  102  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.22 
 
 		 242 aa  102  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.22 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.591310000000001e-44 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.22 
 
 		 242 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.22 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.22 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.22 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0437  short chain dehydrogenase  31.4 
 
 		 267 aa  102  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.87 
 
 		 248 aa  102  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.18 
 
 		 226 aa  102  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3918  short chain dehydrogenase  30.99 
 
 		 267 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 		 248 aa  102  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.933884  hitchhiker  0.00557136 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.78 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4040  short chain dehydrogenase  30.99 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3844  short chain dehydrogenase  30.99 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000447473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1751  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4285  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.91 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.5 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0441  short chain dehydrogenase  30.99 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0416  short chain dehydrogenase  30.99 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2536  short chain dehydrogenase  30.04 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0635  putative short-chain dehydrogenase/reductase  34.32 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.660542  normal  0.0297002 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0481676 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.13 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0293  short chain dehydrogenase  29.24 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5800  short chain dehydrogenase  33.5 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.12 
 
 		 238 aa  99.8  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3866  short chain dehydrogenase  33.5 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4503  short chain dehydrogenase  33.5 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 		 239 aa  99.4  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.175599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1347  short chain dehydrogenase  34.01 
 
 		 258 aa  99  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.371645 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3589  hypothetical protein  31.95 
 
 		 242 aa  99  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00166037  normal  0.283325 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 		 254 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 		 285 aa  99  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.300574 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3404  short chain dehydrogenase  30.58 
 
 		 267 aa  98.6  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.23 
 
 		 338 aa  98.6  8e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.6 
 
 		 241 aa  97.8  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 		 254 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.99 
 
 		 253 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.49 
 
 		 300 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>