173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6368 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
214 aa  422  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4740  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.22 
 
 
285 aa  176  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0344  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.45 
 
 
278 aa  166  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0130127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.28 
 
 
205 aa  156  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.235405 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.58 
 
 
279 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.288274  normal  0.29741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.55 
 
 
306 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.53 
 
 
262 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 
257 aa  55.8  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 
226 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2257  acetoin reductase  34.78 
 
 
262 aa  53.1  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7025  short chain dehydrogenase  37.82 
 
 
229 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2719  putative 3-oxoacyl-(Acyl-carrier protein)reductase  30.4 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114569  normal  0.0868503 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 
264 aa  52  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55836  hitchhiker  0.00258136 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  29.59 
 
 
255 aa  52  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0339  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
265 aa  51.6  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1639  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.9 
 
 
274 aa  50.8  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4257  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.53 
 
 
262 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2840  short chain dehydrogenase  38.89 
 
 
302 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28747  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0396  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.52 
 
 
265 aa  50.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39280  short chain dehydrogenase  32.19 
 
 
230 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.53 
 
 
244 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0334  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.4 
 
 
268 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.77 
 
 
246 aa  49.7  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282314 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 
257 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.11 
 
 
254 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4672  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.05 
 
 
253 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.572467  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.04 
 
 
261 aa  49.3  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.51 
 
 
266 aa  48.9  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0031  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.14 
 
 
250 aa  48.9  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.8 
 
 
305 aa  48.9  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623354  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.18 
 
 
262 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0028  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.14 
 
 
250 aa  48.9  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0543061  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 
274 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.686827  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.65 
 
 
252 aa  48.5  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7070  short chain dehydrogenase  32.03 
 
 
282 aa  48.5  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.347938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1778  oxidoreductase, short chain dehydrogenase  32.06 
 
 
228 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0974  acetoin reductase  36.17 
 
 
253 aa  48.1  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
272 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.93 
 
 
266 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.64422 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.4 
 
 
275 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.79 
 
 
280 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.439013  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.94 
 
 
268 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 
592 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 
268 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1557  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.45 
 
 
253 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.530107  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2451  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.85 
 
 
247 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26523  normal  0.621505 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3121  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.03 
 
 
267 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3953  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.36 
 
 
292 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.19 
 
 
260 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.071685 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12873  short chain dehydrogenase  30.61 
 
 
258 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3597  short chain dehydrogenase  35.51 
 
 
259 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475551  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.31 
 
 
244 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.86 
 
 
259 aa  46.6  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.42 
 
 
251 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.36 
 
 
257 aa  46.2  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.2 
 
 
260 aa  46.6  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 
288 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0728851  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6250  short chain dehydrogenase  35.63 
 
 
258 aa  46.6  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
248 aa  46.6  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.56 
 
 
277 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0429275  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.73 
 
 
294 aa  46.2  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000507932  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.52 
 
 
252 aa  46.2  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.367974  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.32 
 
 
262 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
252 aa  46.2  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28720  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  36.72 
 
 
259 aa  46.2  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.382061  normal  0.0594101 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5231  short chain dehydrogenase  30.77 
 
 
252 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0476444  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 
245 aa  45.8  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0724281  normal  0.787081 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.31 
 
 
275 aa  45.8  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.454392 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
268 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1857  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.97 
 
 
245 aa  45.4  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.678216  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0047  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  46.97 
 
 
277 aa  45.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.14 
 
 
251 aa  45.4  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475602  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.91 
 
 
242 aa  45.1  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.35 
 
 
250 aa  45.1  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.117153  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
269 aa  45.1  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421935 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 
277 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.3 
 
 
239 aa  45.1  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.640458 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
255 aa  45.1  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245481  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1414  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.86 
 
 
233 aa  45.1  0.0009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.934542  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
257 aa  45.1  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00108701 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
250 aa  44.3  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.76 
 
 
266 aa  44.7  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.471953 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.37 
 
 
247 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.264049  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3057  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.48 
 
 
246 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.030998  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 
267 aa  44.7  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.38 
 
 
262 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3473  short chain dehydrogenase  31.78 
 
 
259 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.639698 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.53 
 
 
276 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00568978  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43336  Glucose 1-dehydrogenase peroxisomal 2,4- dienoyl-CoA reductase  29.17 
 
 
253 aa  44.7  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3786  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.45 
 
 
247 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3752  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.68 
 
 
268 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.56 
 
 
257 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563434  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0676  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 
254 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00917144  normal  0.0792915 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.43 
 
 
239 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0175  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.87 
 
 
247 aa  43.9  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.69 
 
 
246 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0117  acetoin reductase  30.63 
 
 
258 aa  43.9  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.713741  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4577  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
250 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684715  normal  0.235979 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2127  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.73 
 
 
250 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.94 
 
 
271 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>