More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1414 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1414  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
233 aa  479  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.934542  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2183  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.93 
 
 
249 aa  119  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.508042  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.02 
 
 
266 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0991034  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.63 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.58 
 
 
246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
248 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2807  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 
253 aa  113  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.45 
 
 
261 aa  113  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.49 
 
 
239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.58 
 
 
246 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
255 aa  110  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  0.349855 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.71 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0974  acetoin reductase  31.58 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.81 
 
 
224 aa  109  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4586  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.15 
 
 
284 aa  109  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3459  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 
249 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0175  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.23 
 
 
247 aa  107  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3899  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 
284 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.190456 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 
253 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1785  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  30.29 
 
 
250 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.95 
 
 
247 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.63 
 
 
246 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.29 
 
 
246 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.05 
 
 
248 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1561  short chain dehydrogenase  35.34 
 
 
516 aa  106  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.636243  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3393  2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase  34.6 
 
 
248 aa  106  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.453301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
288 aa  106  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
261 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0523  acetoin reductase  31.73 
 
 
254 aa  105  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0841243  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.43 
 
 
248 aa  106  4e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
244 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000616439 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 
248 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 
248 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.470556  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 
255 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.276621 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0664  cylG protein  30.08 
 
 
240 aa  105  6e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 
248 aa  105  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
258 aa  105  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal  0.023925 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
248 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  30.54 
 
 
286 aa  105  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 
236 aa  105  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05081  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  29.88 
 
 
250 aa  105  7e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.162194 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1154  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  30.2 
 
 
253 aa  105  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000294561  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1363  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.89 
 
 
254 aa  105  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000027503  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.71 
 
 
248 aa  105  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3889  Short-chain dehydrogenase/reductase  33.76 
 
 
236 aa  104  9e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.521289  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.67 
 
 
248 aa  105  9e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.348466  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4150  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.76 
 
 
236 aa  105  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.639156 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.51 
 
 
257 aa  105  9e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.74 
 
 
233 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 
253 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.145372 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6108  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
255 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.11 
 
 
242 aa  104  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.99 
 
 
246 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282314 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.4 
 
 
254 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1503  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.88 
 
 
248 aa  104  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 
248 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.997672 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5123  acetoacetyl-CoA reductase  30.89 
 
 
248 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
250 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0124  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
252 aa  104  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.087431  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0991  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  29.8 
 
 
253 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 
246 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
249 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.728081  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.58 
 
 
240 aa  103  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.45 
 
 
251 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.780011 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.57 
 
 
229 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.352475  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 
251 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2925  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.61 
 
 
296 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.15 
 
 
285 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0246755  normal  0.0427159 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10890  putative short-chain dehydrogenase  32.2 
 
 
241 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0306888  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4009  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 
240 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.15 
 
 
285 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.11398  normal  0.546447 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2691  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 
257 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.03 
 
 
282 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01070  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.18 
 
 
238 aa  103  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.256883 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3321  hypothetical protein  32.38 
 
 
258 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 
282 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1589  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  30.21 
 
 
243 aa  103  3e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.511722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 
282 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
233 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981974  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4376  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.44 
 
 
285 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2429  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  30.04 
 
 
247 aa  102  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047151  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.77 
 
 
244 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06461  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) reductase  30.99 
 
 
239 aa  102  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 
256 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.165575  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.57 
 
 
229 aa  102  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
254 aa  102  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2799  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.4 
 
 
246 aa  102  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.786413  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11380  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.23 
 
 
247 aa  102  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.833794 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.91 
 
 
255 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.07 
 
 
248 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 
256 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
285 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0516293 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.83 
 
 
284 aa  102  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.361211  hitchhiker  0.00000740353 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1614  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.84 
 
 
253 aa  102  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0547221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0655  short chain dehydrogenase  28.93 
 
 
288 aa  102  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000332724  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.23 
 
 
250 aa  102  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46093  decreased coverage  0.00000100027 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.1 
 
 
286 aa  102  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.984934 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>