262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5373 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5373  NmrA family protein  100 
 
 		 318 aa  625  1e-178  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.764024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9088  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  51.06 
 
 		 304 aa  222  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  31.36 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12330  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  35.07 
 
 		 278 aa  97.4  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  31.71 
 
 		 287 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  30.2 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  34.04 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  31.35 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  31.74 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  30.95 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  28.4 
 
 		 284 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  33.74 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  29 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  30.08 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  30.08 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2286  NmrA family protein  30.14 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159289  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  30.43 
 
 		 287 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  27.4 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  30.38 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  31.17 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2208  NmrA family protein  30.65 
 
 		 316 aa  67  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4346  NmrA family protein  28.05 
 
 		 292 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182028  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  26.24 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  33.04 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  29.8 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  31.98 
 
 		 281 aa  65.5  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1828  NmrA family protein  26.5 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  32.92 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  33.55 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3888  NmrA family protein  27.8 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203916  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1006  NmrA family protein  29.29 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  28 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1172  NmrA family protein  28.32 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.349492  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1768  hypothetical protein  25 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.35 
 
 		 459 aa  61.6  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0520232 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2074  NmrA family protein  26.67 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  28.57 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  26.09 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  26.9 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.012562 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2598  hypothetical protein  24.89 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2652  hypothetical protein  24.89 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  31.39 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1053  NmrA-like protein  27.91 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1069  NmrA family protein  27.91 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  27.63 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  26.43 
 
 		 351 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  28.95 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  30.53 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.28 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  30.43 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1674  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.2 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117563  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1975  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.74 
 
 		 336 aa  57  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  24 
 
 		 291 aa  57  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  24.79 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0144299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7062  NmrA family protein  28.57 
 
 		 512 aa  55.8  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  29.24 
 
 		 584 aa  55.8  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1080  NmrA family protein  26.69 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.803259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  31.14 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1068  NmrA family protein  27.16 
 
 		 311 aa  55.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.746478  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4540  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.96 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.96 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4923  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.96 
 
 		 325 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 285 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2683  NmrA family protein  32.23 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5255  NmrA family protein  31.91 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  29.95 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  29.24 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  27.59 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2059  NmrA family protein  27.47 
 
 		 287 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.50688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 285 aa  54.3  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 		 318 aa  54.3  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.52 
 
 		 328 aa  54.3  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.39 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4022  NmrA family protein  31.77 
 
 		 297 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  29.22 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.08 
 
 		 291 aa  53.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  28.87 
 
 		 279 aa  53.1  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 		 305 aa  53.1  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  25.87 
 
 		 288 aa  52.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  28.88 
 
 		 283 aa  52.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3410  NmrA-like  27.43 
 
 		 285 aa  52.8  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.630504  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4635  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.52 
 
 		 375 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  25.17 
 
 		 301 aa  53.1  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  29.32 
 
 		 283 aa  52.8  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2126  NmrA family protein  25.77 
 
 		 329 aa  52.8  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2013  NmrA family protein  32.22 
 
 		 285 aa  52.8  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  22.73 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0228  NmrA family protein  27.63 
 
 		 255 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1166  hypothetical protein  27.54 
 
 		 207 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22916  normal  0.184887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  31.54 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  27.48 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  27.46 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3622  NmrA family protein  31.22 
 
 		 289 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0098  NmrA family protein  28.66 
 
 		 278 aa  50.8  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153556  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  30.08 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0444  hypothetical protein  25.7 
 
 		 281 aa  50.8  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0456  hypothetical protein  25.7 
 
 		 281 aa  50.8  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.425134  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4065  NmrA family protein  25.49 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>