204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4725 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4725  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  620  1e-177  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3085  hypothetical protein  33.79 
 
 		 299 aa  176  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1770  hypothetical protein  32.15 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  30.9 
 
 		 292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  33.11 
 
 		 293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  30.9 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  31.19 
 
 		 294 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  31.53 
 
 		 294 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16260  hypothetical protein  32.9 
 
 		 295 aa  122  7e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  31.19 
 
 		 294 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  31.19 
 
 		 294 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  32.18 
 
 		 294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  30.64 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  31 
 
 		 297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  33 
 
 		 296 aa  119  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  32.4 
 
 		 297 aa  118  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3285  hypothetical protein  30.74 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  31.86 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1340  protein of unknown function DUF849  33.33 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  32.89 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  30.56 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2917  hypothetical protein  33.22 
 
 		 295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.041062  normal  0.0930195 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3825  hypothetical protein  30.06 
 
 		 303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  28.21 
 
 		 290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  31.44 
 
 		 297 aa  116  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5231  hypothetical protein  31.72 
 
 		 295 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225304  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5233  hypothetical protein  30.42 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2128  hypothetical protein  32.12 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  29.29 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  28.99 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0368988 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3316  hypothetical protein  30.42 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0677839  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  30.95 
 
 		 311 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5051  hypothetical protein  30.42 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.5247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0851  hypothetical protein  32.12 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0491  hypothetical protein  31.79 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0612  hypothetical protein  30.42 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0690  hypothetical protein  31.79 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3968  hypothetical protein  31.79 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0986  hypothetical protein  31.79 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1958  hypothetical protein  31.79 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  28.24 
 
 		 301 aa  113  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0761  hypothetical protein  31.79 
 
 		 309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  27.8 
 
 		 275 aa  112  6e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2188  hypothetical protein  31.01 
 
 		 305 aa  112  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1848  hypothetical protein  30.42 
 
 		 309 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  29.15 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2173  hypothetical protein  29.11 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  28.03 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  28.57 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831805 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3589  hypothetical protein  31.02 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.72078  normal  0.726481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  29.62 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4509  protein of unknown function DUF849  29.77 
 
 		 309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  28.39 
 
 		 326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3295  hypothetical protein  29.21 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4459  hypothetical protein  30.65 
 
 		 309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0689248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0827  hypothetical protein  29.45 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4979  hypothetical protein  30.65 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  26.21 
 
 		 312 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6459  protein of unknown function DUF849  28.95 
 
 		 299 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  28 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6431  protein of unknown function DUF849  29.52 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  27.04 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  29.59 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  27.27 
 
 		 273 aa  107  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  27.18 
 
 		 296 aa  106  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4492  protein of unknown function DUF849  28.16 
 
 		 300 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  28.28 
 
 		 272 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  27.15 
 
 		 310 aa  105  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1601  hypothetical protein  26.92 
 
 		 334 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  28.47 
 
 		 273 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  28.85 
 
 		 298 aa  103  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  27.78 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  28.16 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5071  hypothetical protein  27.71 
 
 		 295 aa  102  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  26.78 
 
 		 293 aa  102  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0500  hypothetical protein  29.83 
 
 		 294 aa  102  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71150  hypothetical protein  29.9 
 
 		 294 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.185944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6173  hypothetical protein  29.9 
 
 		 294 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2778  hypothetical protein  32.06 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1017  protein of unknown function DUF849  28.75 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000125138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  27.46 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  28.62 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3578  hypothetical protein  30.07 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  27.95 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  28.28 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2423  hypothetical protein  31.08 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  29.3 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3440  protein of unknown function DUF849  28.67 
 
 		 296 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0074  protein of unknown function DUF849  27.6 
 
 		 308 aa  99.4  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  29.25 
 
 		 310 aa  98.2  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0426  hypothetical protein  29.07 
 
 		 321 aa  97.8  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  27.81 
 
 		 321 aa  97.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  30.64 
 
 		 295 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1700  hypothetical protein  27.48 
 
 		 308 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3694  protein of unknown function DUF849  27.65 
 
 		 309 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0103  hypothetical protein  28.16 
 
 		 312 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.109916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  26.6 
 
 		 310 aa  93.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4641  hypothetical protein  27.97 
 
 		 309 aa  94  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.719101  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3905  hypothetical protein  28.38 
 
 		 310 aa  92.4  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.251797 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  26.67 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197144  normal  0.584863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>