More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4674 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4674  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 255 aa  486  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  34.03 
 
 		 259 aa  125  7e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3215  transcriptional regulator, DeoR family  30.13 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  30.08 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  34.71 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  29.72 
 
 		 257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 266 aa  113  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  31.25 
 
 		 254 aa  112  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  36.11 
 
 		 260 aa  112  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 253 aa  112  6e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1675  DeoR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 266 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00609311  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  38.86 
 
 		 253 aa  111  9e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2055  DeoR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0500413 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  40.95 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  38.26 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0841  transcriptional regulator, DeoR family  28.45 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1115  DeoR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 286 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3687  regulatory protein, DeoR  36.29 
 
 		 259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.300297  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1862  DeoR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.553225  hitchhiker  0.0000200167 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2071  DeoR family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 254 aa  108  8.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.128442  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 253 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.17 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4851  DeoR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1875  transcriptional regulator, DeoR family  32.92 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1758  regulatory protein DeoR  33.78 
 
 		 249 aa  107  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.299089  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0609  DeoR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143813 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  34.02 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01739  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.67 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.17 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4338  DeoR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  30.17 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1074  DeoR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4303  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.8 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.922526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  27.85 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1854  DeoR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0330559  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  30.17 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4258  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.8 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4414  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.8 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4236  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.8 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.627699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.17 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01727  hypothetical protein  30.67 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4349  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.8 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.17 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1421  DeoR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.17 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2494  transcriptional regulator, DeoR family  30.67 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3906  regulatory protein, DeoR  32.13 
 
 		 251 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.543533  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4533  DeoR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 251 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350133  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4169  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.13 
 
 		 251 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45720  glycerol-3-phosphate regulon repressor protein GlpR  33.18 
 
 		 251 aa  105  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1103  DeoR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 251 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0678  regulatory protein DeoR  30.42 
 
 		 247 aa  105  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.275525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1446  L-fucose operon activator  33.05 
 
 		 250 aa  105  9e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000392431  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  32.37 
 
 		 258 aa  105  9e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  36.64 
 
 		 289 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  27 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  34.05 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 259 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 288 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4889  transcriptional regulator, DeoR family  37.4 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.585335  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.75 
 
 		 269 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  34.2 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4407  DeoR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03769  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.67 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.723341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4102  transcriptional regulator, DeoR family  30.67 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5331  transcriptional regulator, DeoR/GntR family  30.67 
 
 		 269 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.464213 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03718  hypothetical protein  30.67 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0377  DeoR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4269  DeoR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  37.39 
 
 		 253 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2752  transcriptional regulator, DeoR family  34.29 
 
 		 258 aa  102  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  31.36 
 
 		 255 aa  102  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 258 aa  102  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1994  DeoR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 252 aa  102  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  29.82 
 
 		 258 aa  102  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  29.82 
 
 		 258 aa  102  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1872  transcriptional regulator, DeoR family  29.06 
 
 		 252 aa  102  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0191084  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  29.1 
 
 		 259 aa  102  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  35.74 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  34.4 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3432  transcriptional regulator, DeoR family  29.29 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5351  transcriptional regulator, DeoR family  29.39 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.382698  normal  0.4107 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1427  DeoR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.847076  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  37.09 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4658  transcriptional regulator, DeoR family  29.03 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0287988  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  25.78 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2362  transcriptional regulator, DeoR family  34.92 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12916  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  28.69 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  28.69 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.839673 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>