More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3869 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3869  ABC transporter related  100 
 
 		 235 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166635  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3487  ABC transporter related protein  60 
 
 		 247 aa  270  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8311  ABC transporter related  61.97 
 
 		 236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.659744  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4015  ABC transporter related  54.78 
 
 		 235 aa  251  6e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2137  ABC transporter related protein  51.3 
 
 		 251 aa  205  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0427504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2953  ABC transporter related  50.66 
 
 		 249 aa  204  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.181983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  44.12 
 
 		 238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  46.78 
 
 		 234 aa  195  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  43.98 
 
 		 242 aa  195  6e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3396  ABC transporter related  44.98 
 
 		 229 aa  194  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4056  ABC transporter related  48.33 
 
 		 240 aa  194  8.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  46.84 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0796  ABC transporter related  48.1 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0844  ABC transporter related  47.41 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  46.38 
 
 		 238 aa  192  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  47.08 
 
 		 240 aa  192  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  45.38 
 
 		 240 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  40.43 
 
 		 236 aa  191  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2756  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.73 
 
 		 234 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.211076  normal  0.384438 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  48.07 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1086  ABC transporter related  46.98 
 
 		 237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0710157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6017  ABC transporter related  45.45 
 
 		 251 aa  189  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.896257  hitchhiker  0.00867061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4710  ABC transporter related protein  47.88 
 
 		 236 aa  187  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  48.11 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  45.61 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.11 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4737  ABC transporter related  48.29 
 
 		 940 aa  187  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  48.11 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  48.11 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  48.11 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  39.91 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  46.78 
 
 		 256 aa  186  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1908  ABC transporter related  47.44 
 
 		 254 aa  186  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.240732 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3709  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.85 
 
 		 244 aa  186  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0912  ABC transporter related  44.67 
 
 		 244 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.77 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2264  ABC transporter related  44.26 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0714908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  45.92 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0609  ABC transporter related  45.38 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6584  ABC transporter related  45.53 
 
 		 245 aa  185  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633643  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  47.64 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5343  ABC transporter related  42.37 
 
 		 235 aa  185  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  43.35 
 
 		 235 aa  185  6e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  44.49 
 
 		 247 aa  185  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  46.64 
 
 		 237 aa  185  6e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  44.49 
 
 		 247 aa  185  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  40.77 
 
 		 239 aa  185  7e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  47.17 
 
 		 233 aa  184  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  47.64 
 
 		 233 aa  184  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1520  ABC transporter related  45.33 
 
 		 234 aa  184  9e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000116911  normal  0.55124 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  49.52 
 
 		 242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  45.83 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  45.06 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  43.7 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  44.64 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  44.07 
 
 		 247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  46.23 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  43.51 
 
 		 239 aa  182  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  45.62 
 
 		 236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0762  ABC transporter-related protein  44.64 
 
 		 241 aa  181  8.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000284565 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  43.16 
 
 		 235 aa  180  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  45 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  39.91 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  43.4 
 
 		 237 aa  181  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4486  ABC transporter related  42.19 
 
 		 260 aa  179  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.064197  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  42.86 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  47.17 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1519  ABC transporter related  44.49 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3555  ABC transporter related  46.81 
 
 		 232 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.651056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1580  ABC transporter related  44.12 
 
 		 237 aa  179  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  45.19 
 
 		 238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  42.31 
 
 		 242 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  45.19 
 
 		 238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4379  ABC transporter related protein  44.87 
 
 		 240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.957322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3339  ABC transporter related  44.55 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4937  ABC transporter related  41.45 
 
 		 257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.45 
 
 		 233 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.45 
 
 		 233 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  44.24 
 
 		 236 aa  178  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0359  ABC transporter related  44.64 
 
 		 233 aa  177  9e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1722  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 		 248 aa  177  9e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  46.61 
 
 		 258 aa  177  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.11 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0601  ABC transporter  42.06 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.190896  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0556  ABC transporter-like  43.35 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000214193  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  41.2 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4655  ABC transporter related  42.49 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000808014  hitchhiker  0.00473023 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  40.6 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  42.98 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  46.19 
 
 		 238 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  42.45 
 
 		 239 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.6 
 
 		 238 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  46.19 
 
 		 238 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  44.02 
 
 		 235 aa  176  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  46.19 
 
 		 238 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4915  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.4 
 
 		 238 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0988  ABC transporter-like  40.93 
 
 		 247 aa  176  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0162069  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  46.38 
 
 		 237 aa  176  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  44.6 
 
 		 238 aa  176  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0899  ABC transporter related  44.26 
 
 		 238 aa  176  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>