More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0886 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0886  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 916 aa  1688    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.421013 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3830  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  62.66 
 
 		 515 aa  347  7e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778945  normal  0.0341938 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7239  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  49.04 
 
 		 569 aa  265  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  46.88 
 
 		 423 aa  248  4e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.37 
 
 		 579 aa  247  9e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1398  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.11 
 
 		 349 aa  241  5.999999999999999e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3684  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.63 
 
 		 518 aa  239  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.358044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8413  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  44.41 
 
 		 527 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0353  trypsin-like serine protease  43.72 
 
 		 583 aa  238  5.0000000000000005e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.326819  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1186  HtrA2 peptidase  50 
 
 		 597 aa  235  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.934322  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2919  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.79 
 
 		 558 aa  230  9e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  hitchhiker  0.00800528 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1008  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.57 
 
 		 487 aa  229  2e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4062  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.45 
 
 		 524 aa  228  4e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.18 
 
 		 417 aa  227  9e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.63894  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.46 
 
 		 674 aa  226  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32730  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  45.9 
 
 		 443 aa  224  4.9999999999999996e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0705  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.12 
 
 		 439 aa  224  7e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1593  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.86 
 
 		 512 aa  223  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421913  normal  0.822638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3273  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  46.48 
 
 		 485 aa  220  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25880  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  43.59 
 
 		 537 aa  220  8.999999999999998e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0813  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.76 
 
 		 485 aa  218  2.9999999999999998e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11001  serine protease pepD  47.7 
 
 		 464 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000053367  normal  0.424973 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.1 
 
 		 545 aa  215  2.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331753  normal  0.316507 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0459  2-alkenal reductase  42.19 
 
 		 584 aa  215  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4679  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.79 
 
 		 440 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0383364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4299  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.79 
 
 		 440 aa  214  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4385  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.79 
 
 		 440 aa  214  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2158  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.24 
 
 		 507 aa  214  5.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0489221  normal  0.0113989 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3284  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.61 
 
 		 420 aa  209  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.71487  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0797  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.01 
 
 		 512 aa  208  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10940  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  40.48 
 
 		 539 aa  207  5e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000345024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1153  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.06 
 
 		 436 aa  207  6e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  normal  0.0134445 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1212  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.08 
 
 		 471 aa  207  7e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152583  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1889  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.93 
 
 		 515 aa  206  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06450  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  44.24 
 
 		 517 aa  204  9e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5199  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.5 
 
 		 640 aa  203  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.219359  normal  0.800514 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24150  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  41.9 
 
 		 515 aa  201  5e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  47.69 
 
 		 508 aa  201  6e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1125  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.24 
 
 		 523 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33278  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0658  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  49.48 
 
 		 434 aa  200  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3234  2-alkenal reductase  45.45 
 
 		 575 aa  200  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222667  normal  0.0363808 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1859  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.66 
 
 		 544 aa  197  8.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.308507  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2743  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  37.65 
 
 		 545 aa  197  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5142  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  41.06 
 
 		 614 aa  196  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309432  normal  0.441282 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07340  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  44.63 
 
 		 552 aa  195  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.191801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3992  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.47 
 
 		 501 aa  195  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4066  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.47 
 
 		 501 aa  195  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4006  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.36 
 
 		 497 aa  194  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  36.83 
 
 		 389 aa  194  8e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.36 
 
 		 486 aa  193  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21640  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  43.48 
 
 		 417 aa  193  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00345268  normal  0.0571371 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  36.55 
 
 		 453 aa  191  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11247  serine protease htrA  40.07 
 
 		 528 aa  191  5.999999999999999e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.039312  hitchhiker  0.00292251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2202  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.03 
 
 		 497 aa  188  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.718376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  44.22 
 
 		 475 aa  187  7e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0507  trypsin-like serine protease  44.62 
 
 		 489 aa  187  8e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  40 
 
 		 393 aa  187  9e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  36.79 
 
 		 471 aa  186  2.0000000000000003e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  44.6 
 
 		 393 aa  186  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1344  trypsin  38.96 
 
 		 594 aa  185  3e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0379667 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4494  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.16 
 
 		 496 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.18457  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  40.97 
 
 		 500 aa  184  9.000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.22 
 
 		 423 aa  184  9.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3107  protease Do  42.25 
 
 		 504 aa  183  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  42.34 
 
 		 452 aa  182  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3888  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.85 
 
 		 506 aa  182  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4915  2-alkenal reductase  43.15 
 
 		 385 aa  182  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128637  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02461  serine protease  42.86 
 
 		 395 aa  182  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4842  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.17 
 
 		 456 aa  182  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369386 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1456  PDZ/DHR/GLGF  38.87 
 
 		 392 aa  182  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1353  trypsin-like serine protease  40.19 
 
 		 673 aa  182  2.9999999999999997e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  39.79 
 
 		 484 aa  182  2.9999999999999997e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01581  serine protease  38.87 
 
 		 392 aa  182  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.84 
 
 		 386 aa  182  2.9999999999999997e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  40.21 
 
 		 503 aa  181  4e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  38.95 
 
 		 467 aa  181  4e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  41.97 
 
 		 459 aa  181  5.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0073  2-alkenal reductase  41.7 
 
 		 459 aa  181  8e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0754695 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  37.76 
 
 		 472 aa  181  8e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  42.01 
 
 		 503 aa  180  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  39.5 
 
 		 396 aa  180  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  41.61 
 
 		 459 aa  179  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0856  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.97 
 
 		 475 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0131628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0850  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.97 
 
 		 475 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0867  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.97 
 
 		 475 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  41.92 
 
 		 493 aa  179  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  42.96 
 
 		 485 aa  179  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  41.81 
 
 		 387 aa  179  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  40 
 
 		 453 aa  178  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3889  protease Do  38.1 
 
 		 524 aa  178  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42007  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0885  PDZ/DHR/GLGF  39.02 
 
 		 375 aa  178  4e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  42.09 
 
 		 525 aa  178  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0972  PDZ/DHR/GLGF  39.7 
 
 		 392 aa  178  5e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.160353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  41.67 
 
 		 395 aa  177  7e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.02 
 
 		 385 aa  177  8e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  39.79 
 
 		 415 aa  177  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  36.86 
 
 		 535 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2320  PDZ/DHR/GLGF  43.07 
 
 		 351 aa  176  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1890  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.25 
 
 		 521 aa  177  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.206887  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4344  2-alkenal reductase  37.07 
 
 		 382 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>