More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0796 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
293 aa  570  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  0.058004 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3934  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.29 
 
 
261 aa  336  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.58 
 
 
280 aa  188  8e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.45 
 
 
254 aa  183  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.44 
 
 
247 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 
227 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0180181  normal  0.277757 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6051  short chain dehydrogenase  35.14 
 
 
221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0202908  normal  0.993323 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0854  short chain dehydrogenase  34.48 
 
 
225 aa  113  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0159157 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.27 
 
 
245 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.553727  normal  0.0273902 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.47 
 
 
251 aa  112  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.59 
 
 
230 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0974  short chain dehydrogenase  33.84 
 
 
230 aa  108  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0177058  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0676  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
254 aa  106  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00917144  normal  0.0792915 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.23 
 
 
225 aa  105  8e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5952  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.33 
 
 
250 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.76 
 
 
260 aa  102  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.52 
 
 
248 aa  99.8  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.31881  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
232 aa  99.8  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.91873  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1729  short chain dehydrogenase  34.23 
 
 
227 aa  99.8  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.94 
 
 
240 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00293136  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0397  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 
254 aa  96.7  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4316  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.07 
 
 
267 aa  96.3  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.691417  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 
257 aa  95.9  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5072  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.04 
 
 
285 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443386  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09810  short-chain alcohol dehydrogenase  31.34 
 
 
261 aa  95.1  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0913042  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0635  putative short-chain dehydrogenase/reductase  29.26 
 
 
246 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.660542  normal  0.0297002 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.17 
 
 
242 aa  95.1  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.186526  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0991  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.35 
 
 
284 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1009  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.35 
 
 
284 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1019  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.35 
 
 
284 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.945266 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.12 
 
 
255 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.91 
 
 
231 aa  94.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2091  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.11 
 
 
258 aa  94.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.91 
 
 
231 aa  94.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 
254 aa  94.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23940  short-chain alcohol dehydrogenase  33.21 
 
 
280 aa  93.6  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.393654  normal  0.784232 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0194  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.44 
 
 
233 aa  93.6  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5387  short chain dehydrogenase  30.27 
 
 
222 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.09 
 
 
252 aa  92.8  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0691773  normal  0.0221679 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5476  short chain dehydrogenase  30.27 
 
 
222 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0679291  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5763  short chain dehydrogenase  30.27 
 
 
222 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.19 
 
 
241 aa  92.8  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.116852  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 
261 aa  92.8  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7025  short chain dehydrogenase  34.75 
 
 
229 aa  92.4  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.15 
 
 
239 aa  92.4  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420603  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 
249 aa  92.4  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.88 
 
 
250 aa  92  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2737  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31 
 
 
245 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 
249 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.731962 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.45 
 
 
231 aa  91.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.55 
 
 
239 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.175599  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.45 
 
 
262 aa  91.3  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
243 aa  90.9  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000379715  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1286  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.31 
 
 
285 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0358069  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3917  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.36 
 
 
260 aa  90.5  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.283072  normal  0.0412818 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4636  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.94 
 
 
254 aa  90.5  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.34 
 
 
238 aa  90.1  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.25 
 
 
247 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.340445  normal  0.365193 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.46 
 
 
244 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
252 aa  90.1  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.48 
 
 
238 aa  89.4  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.14 
 
 
252 aa  89.4  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10701  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.57 
 
 
275 aa  89  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39280  short chain dehydrogenase  32.31 
 
 
230 aa  88.2  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0955  short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  32.85 
 
 
245 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.23 
 
 
255 aa  88.6  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.86 
 
 
273 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 
248 aa  88.6  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
269 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148918 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.36 
 
 
248 aa  87.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  hitchhiker  0.00314525 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.16 
 
 
247 aa  87.8  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.269971  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.95 
 
 
281 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.255746 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.48 
 
 
261 aa  88.2  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.82 
 
 
264 aa  87.4  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  30.37 
 
 
247 aa  87  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.95 
 
 
249 aa  87.4  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.78 
 
 
245 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.09 
 
 
261 aa  86.7  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0587036  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25540  short-chain alcohol dehydrogenase  30.89 
 
 
255 aa  86.7  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.83 
 
 
248 aa  86.7  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1968  glucose/ribitol dehydrogenase  25.28 
 
 
250 aa  86.7  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000140483 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.54 
 
 
258 aa  86.3  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.65 
 
 
250 aa  85.9  7e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0530041  hitchhiker  0.00231678 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 
244 aa  85.9  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1701  3-hydroxy acid dehydrogenase  24.72 
 
 
248 aa  85.9  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000649919  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01498  L-allo-threonine dehydrogenase, NAD(P)-binding  24.72 
 
 
248 aa  85.5  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000675994  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.72 
 
 
248 aa  85.5  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000149507  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2119  3-hydroxy acid dehydrogenase  24.72 
 
 
248 aa  85.5  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000142813  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1748  3-hydroxy acid dehydrogenase  24.72 
 
 
248 aa  85.5  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124318  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1629  3-hydroxy acid dehydrogenase  24.72 
 
 
248 aa  85.5  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.5514199999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01509  hypothetical protein  24.72 
 
 
248 aa  85.5  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000865743  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00230  short-chain alcohol dehydrogenase  34.11 
 
 
223 aa  85.5  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1864  3-hydroxy acid dehydrogenase  28.16 
 
 
249 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.612513  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1626  3-hydroxy acid dehydrogenase  24.72 
 
 
248 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000177661  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.27 
 
 
246 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3121  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
267 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5631  putative short-chain dehydrogenase  26.12 
 
 
253 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2155  3-hydroxy acid dehydrogenase  24.35 
 
 
248 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000180953  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1976  3-hydroxy acid dehydrogenase  28.16 
 
 
249 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>