45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3976 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3976  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 376 aa  739    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4281  glycoside hydrolase family protein  42.28 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394059  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  35.5 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  31.69 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  31.12 
 
 		 345 aa  117  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  31.44 
 
 		 348 aa  106  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  28.9 
 
 		 495 aa  84  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2698  glycoside hydrolase family 43  26.45 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  0.338928 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  27.39 
 
 		 456 aa  72.8  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  27.35 
 
 		 472 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  27.41 
 
 		 505 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  30.32 
 
 		 487 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  27.73 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  25.96 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4087  glycoside hydrolase family 43  29.12 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  26.15 
 
 		 509 aa  56.6  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  25.71 
 
 		 1338 aa  54.7  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  23.88 
 
 		 324 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  25.61 
 
 		 348 aa  53.1  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  23.73 
 
 		 524 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  22.12 
 
 		 325 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1928  Carbohydrate-binding CenC domain protein  24.62 
 
 		 712 aa  50.4  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  24.71 
 
 		 315 aa  50.1  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  24.09 
 
 		 522 aa  50.1  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  26.9 
 
 		 464 aa  50.1  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  31.01 
 
 		 510 aa  49.7  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  28.17 
 
 		 310 aa  48.9  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  22.63 
 
 		 393 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 		 323 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  25.69 
 
 		 383 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  24.11 
 
 		 535 aa  47.4  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  24.19 
 
 		 319 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  24.5 
 
 		 341 aa  46.6  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  24.03 
 
 		 450 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  29.79 
 
 		 618 aa  45.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1323  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.92 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  28 
 
 		 468 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  26.82 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  20.71 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  25.6 
 
 		 357 aa  43.9  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1660  carbohydrate binding domain/beta-xylosidase family protein  25.78 
 
 		 667 aa  43.5  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4511  glycoside hydrolase family protein  28.06 
 
 		 341 aa  43.9  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1998  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.9 
 
 		 344 aa  43.5  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0823  glycoside hydrolase family 43  25.49 
 
 		 302 aa  43.1  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.328209 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  29.8 
 
 		 527 aa  43.1  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>