More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3959 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0409  ABC transporter, ATP-binding subunit  60.43 
 
 		 596 aa  638    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.722245  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3959  ABC transporter related  100 
 
 		 612 aa  1186    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0772  ABC transporter related  72.85 
 
 		 632 aa  829    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0513  ABC transporter related protein  58.64 
 
 		 592 aa  645    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0493  ABC transporter related protein  58.6 
 
 		 602 aa  625  1e-178  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.518307  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8452  ABC transporter related  56.28 
 
 		 608 aa  622  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.030329  decreased coverage  0.00000193115 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0784  ABC transporter related  57.67 
 
 		 598 aa  618  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0650  ABC transporter related  59.22 
 
 		 590 aa  617  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0728  ABC transporter related  57.35 
 
 		 598 aa  612  9.999999999999999e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3161  ABC transporter-like protein  59.71 
 
 		 608 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.970833 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3947  ABC transporter related protein  56.84 
 
 		 601 aa  604  1.0000000000000001e-171  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3996  ABC transporter related protein  58.31 
 
 		 592 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2963  ABC transporter related  53.5 
 
 		 600 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.616286  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3007  ABC transporter related  53.5 
 
 		 600 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333265  normal  0.911038 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0990  ABC transporter related protein  58.44 
 
 		 588 aa  601  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8616  ABC transporter ATP-binding protein  57.43 
 
 		 602 aa  589  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0865  ABC transporter related protein  60.26 
 
 		 608 aa  585  1e-166  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.380755  normal  0.901463 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3854  ABC transporter related  54 
 
 		 611 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.53962  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1285  ABC transporter related  52.5 
 
 		 610 aa  579  1e-164  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000856042 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05410  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  54.21 
 
 		 613 aa  577  1.0000000000000001e-163  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0302406  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3518  ABC transporter related  55.17 
 
 		 587 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284469  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32430  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  54.98 
 
 		 600 aa  568  1e-161  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.775156  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1215  ABC transporter related  51.79 
 
 		 608 aa  561  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.207938  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03410  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  51.91 
 
 		 628 aa  556  1e-157  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1047  ABC transporter related  58.29 
 
 		 606 aa  543  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1950  ABC transporter related  50.08 
 
 		 615 aa  543  1e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.975434 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1521  ABC transporter related protein  51.7 
 
 		 601 aa  539  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0493324  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2978  ABC transporter related  50.89 
 
 		 596 aa  523  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.013676  decreased coverage  0.00456661 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2744  ABC transporter related  47.82 
 
 		 609 aa  522  1e-147  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30250  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  51.18 
 
 		 572 aa  520  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.24394 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2722  ABC transporter related protein  48.27 
 
 		 631 aa  520  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11685  macrolide ABC transporter ATP-binding protein  49.51 
 
 		 591 aa  513  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.819157 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3302  ABC transporter-related protein  48.89 
 
 		 606 aa  512  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15000  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  46.57 
 
 		 600 aa  511  1e-143  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0302703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4554  ABC transporter related  51.76 
 
 		 617 aa  502  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0977  ABC transporter related  51.13 
 
 		 616 aa  498  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.126442  hitchhiker  0.00329401 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13340  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  55.44 
 
 		 630 aa  492  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0691975  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0736  ABC transporter related  43.13 
 
 		 630 aa  470  1.0000000000000001e-131  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08180  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  43.31 
 
 		 632 aa  460  9.999999999999999e-129  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.195035 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  36.64 
 
 		 653 aa  410  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  35.31 
 
 		 639 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  35.71 
 
 		 629 aa  403  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  36.63 
 
 		 642 aa  403  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  35.66 
 
 		 631 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  35.66 
 
 		 631 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  35.66 
 
 		 631 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  36.63 
 
 		 642 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  35.5 
 
 		 631 aa  396  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  35.66 
 
 		 631 aa  397  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  35.81 
 
 		 631 aa  397  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  35.35 
 
 		 631 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  35.35 
 
 		 631 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  35.51 
 
 		 632 aa  394  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  35.66 
 
 		 631 aa  395  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  35.35 
 
 		 631 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  33.7 
 
 		 636 aa  390  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  35.85 
 
 		 631 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  39.73 
 
 		 630 aa  385  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  36.38 
 
 		 632 aa  382  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0123  ABC transporter related  34.36 
 
 		 643 aa  383  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  33.64 
 
 		 642 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  38.01 
 
 		 630 aa  381  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  37.5 
 
 		 626 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3020  ABC transporter-like  35.63 
 
 		 646 aa  379  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  33.64 
 
 		 642 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4406  ABC transporter related protein  35.12 
 
 		 630 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  32.39 
 
 		 622 aa  374  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  32.08 
 
 		 621 aa  375  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 629 aa  375  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0375  ATPase  37.01 
 
 		 631 aa  371  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  35.76 
 
 		 613 aa  371  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1225  ABC transporter, ATP-binding protein  35.28 
 
 		 623 aa  368  1e-100  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  34.06 
 
 		 630 aa  368  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  31.77 
 
 		 620 aa  365  2e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  33.38 
 
 		 642 aa  363  6e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3225  ABC transporter related protein  52.75 
 
 		 377 aa  360  3e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.704476  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  34.54 
 
 		 625 aa  357  3.9999999999999996e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  34.54 
 
 		 625 aa  357  3.9999999999999996e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  34.34 
 
 		 630 aa  355  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  33.23 
 
 		 644 aa  354  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0383  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 627 aa  353  5e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.386036  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0800  ABC transporter, ATP-binding protein  34.35 
 
 		 622 aa  352  1e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285677 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  33.91 
 
 		 620 aa  351  3e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3547  ABC transporter-like protein protein  36 
 
 		 640 aa  347  3e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1381  ATPase  38.23 
 
 		 641 aa  345  2e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.981261  normal  0.290816 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1278  ABC transporter ATPase  33.28 
 
 		 625 aa  344  2e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.760109  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1340  ABC transporter, ATP-binding protein  35.82 
 
 		 622 aa  343  5e-93  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6107  ABC transporter related protein  41.52 
 
 		 653 aa  342  1e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0950  ATPase  32.82 
 
 		 641 aa  335  1e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.61977  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18141  hypothetical protein  36.06 
 
 		 641 aa  333  6e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0376333  normal  0.70207 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0514  ATPase  35.55 
 
 		 633 aa  327  5e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11743  normal  0.506629 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.4 
 
 		 559 aa  325  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1058  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.55 
 
 		 560 aa  323  7e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  34.22 
 
 		 634 aa  323  8e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.7 
 
 		 561 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03991  ABC transporter ATP-binding protein  37.97 
 
 		 652 aa  320  6e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1822  ATPase  34.1 
 
 		 631 aa  319  1e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1137  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.24 
 
 		 560 aa  318  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000210355  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0661  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.57 
 
 		 560 aa  318  2e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1998  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.26 
 
 		 563 aa  316  6e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.237018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>