229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0910 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0910  recombinase  100 
 
 		 743 aa  1515    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1430  Resolvase domain protein  38.38 
 
 		 607 aa  357  5e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2057  Resolvase domain protein  36.1 
 
 		 582 aa  329  1.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0536001  normal  0.0182288 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1250  resolvase  27.59 
 
 		 524 aa  155  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  27.73 
 
 		 494 aa  144  5e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  28.3 
 
 		 555 aa  130  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  26.83 
 
 		 525 aa  125  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  28.61 
 
 		 449 aa  124  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  28.29 
 
 		 510 aa  122  3e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  31.63 
 
 		 518 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  29.89 
 
 		 563 aa  119  3e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3963  recombinase  26.68 
 
 		 493 aa  118  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  26.05 
 
 		 537 aa  118  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  28.93 
 
 		 447 aa  117  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0320  resolvase domain-containing protein  25.43 
 
 		 531 aa  117  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  28.5 
 
 		 445 aa  117  8.999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  29.02 
 
 		 445 aa  117  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  29.72 
 
 		 443 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  25 
 
 		 462 aa  114  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  27.78 
 
 		 546 aa  114  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  25.49 
 
 		 554 aa  114  9e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  26.15 
 
 		 441 aa  113  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  28.53 
 
 		 546 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  25.6 
 
 		 542 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  29.77 
 
 		 550 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  26.42 
 
 		 441 aa  112  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  26.18 
 
 		 522 aa  112  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  25.24 
 
 		 550 aa  109  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  25.24 
 
 		 555 aa  109  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  28.23 
 
 		 613 aa  108  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  27.37 
 
 		 548 aa  108  5e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  28.83 
 
 		 532 aa  107  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  29.55 
 
 		 343 aa  107  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  29.24 
 
 		 415 aa  107  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  30.75 
 
 		 485 aa  106  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  30.15 
 
 		 462 aa  106  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  28.49 
 
 		 445 aa  106  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  25.15 
 
 		 565 aa  106  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  24.65 
 
 		 561 aa  104  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  30.12 
 
 		 506 aa  104  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  29.73 
 
 		 545 aa  104  7e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0231  resolvase domain-containing protein  22.49 
 
 		 519 aa  104  7e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.829739  normal  0.106092 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  29.25 
 
 		 459 aa  103  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  29.55 
 
 		 462 aa  103  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  28.28 
 
 		 540 aa  103  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  28.53 
 
 		 549 aa  103  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3109  resolvase  31.93 
 
 		 377 aa  102  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  29.82 
 
 		 509 aa  102  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  27.53 
 
 		 665 aa  101  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  25.62 
 
 		 547 aa  101  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  25.98 
 
 		 561 aa  101  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  27.74 
 
 		 500 aa  100  7e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  26.79 
 
 		 521 aa  100  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  30.19 
 
 		 544 aa  99.8  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  27.83 
 
 		 527 aa  99.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  25.68 
 
 		 517 aa  98.6  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3805  resolvase-like protein  24.08 
 
 		 526 aa  98.6  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296715  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  28.02 
 
 		 522 aa  98.2  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  28.76 
 
 		 525 aa  98.2  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  23.49 
 
 		 542 aa  96.7  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7140  recombinase  42.45 
 
 		 108 aa  96.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190883  normal  0.28367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  27.62 
 
 		 551 aa  95.5  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  26.92 
 
 		 489 aa  95.1  4e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  23.28 
 
 		 542 aa  95.1  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  23.28 
 
 		 542 aa  95.1  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  26.61 
 
 		 506 aa  94.7  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  27.41 
 
 		 590 aa  94.7  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  28.23 
 
 		 525 aa  94.4  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  26.76 
 
 		 528 aa  94.4  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2572  resolvase domain protein  28.99 
 
 		 539 aa  94  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  27.19 
 
 		 445 aa  93.6  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  26.76 
 
 		 528 aa  93.2  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  28.05 
 
 		 441 aa  93.6  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  27.51 
 
 		 441 aa  93.6  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  27.62 
 
 		 534 aa  92.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4205  resolvase domain protein  29.28 
 
 		 525 aa  93.2  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  25.25 
 
 		 511 aa  93.2  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  26.54 
 
 		 558 aa  92.4  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2591  Resolvase domain protein  27.03 
 
 		 490 aa  92  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0023015  hitchhiker  0.000000886482 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  23.89 
 
 		 558 aa  92  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  28.64 
 
 		 515 aa  91.3  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  27.57 
 
 		 460 aa  90.9  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0737  resolvase  23.55 
 
 		 542 aa  90.9  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0547783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 579 aa  89  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  27.62 
 
 		 534 aa  89  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  28.41 
 
 		 534 aa  89  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3523  resolvase domain protein  28.49 
 
 		 568 aa  88.6  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.876485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  26.74 
 
 		 534 aa  88.2  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  25.72 
 
 		 568 aa  88.2  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  28.12 
 
 		 537 aa  88.2  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  22.5 
 
 		 515 aa  87.8  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3232  Resolvase domain protein  26.99 
 
 		 474 aa  87.8  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  24.82 
 
 		 504 aa  87.4  9e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  28.45 
 
 		 526 aa  87  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  26.74 
 
 		 537 aa  86.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  25.59 
 
 		 586 aa  87  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  27.03 
 
 		 534 aa  86.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  23.5 
 
 		 546 aa  85.1  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0051  site-specific recombinase  27.43 
 
 		 513 aa  85.1  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169299  hitchhiker  0.000782563 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2975  resolvase domain-containing protein  29.33 
 
 		 516 aa  84.7  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.539501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>