282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1605 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 415 aa  844    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1480  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 442 aa  333  2e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.227708  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1520  radical SAM domain-containing protein  42.9 
 
 		 311 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  26.39 
 
 		 447 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  28.37 
 
 		 400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0142  Radical SAM domain protein  26.51 
 
 		 477 aa  108  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  28.08 
 
 		 449 aa  102  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  25.26 
 
 		 434 aa  101  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  23.5 
 
 		 510 aa  100  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  25.93 
 
 		 394 aa  99  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  25.06 
 
 		 450 aa  99.4  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  24.21 
 
 		 432 aa  97.1  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  24.93 
 
 		 447 aa  95.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  23.45 
 
 		 429 aa  94.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0870  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  23.31 
 
 		 483 aa  94.4  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  23.04 
 
 		 474 aa  93.6  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  23.68 
 
 		 440 aa  93.2  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  22.82 
 
 		 468 aa  92.8  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  25.58 
 
 		 439 aa  92.4  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  25.13 
 
 		 442 aa  91.3  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  25.13 
 
 		 442 aa  91.3  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  26.13 
 
 		 461 aa  90.9  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 436 aa  90.1  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  24.94 
 
 		 489 aa  89.4  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  22.81 
 
 		 443 aa  88.2  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  26.36 
 
 		 452 aa  89  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  26.07 
 
 		 459 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  25.49 
 
 		 446 aa  87.8  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0076  Radical SAM domain protein  24.77 
 
 		 444 aa  87  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  20.21 
 
 		 486 aa  85.5  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  23.33 
 
 		 434 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  22.61 
 
 		 445 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1501  radical SAM domain-containing protein  24.38 
 
 		 454 aa  84.3  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1456  radical SAM domain-containing protein  24.38 
 
 		 454 aa  84.3  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  23.41 
 
 		 453 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  24.4 
 
 		 457 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  24.4 
 
 		 450 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  26.02 
 
 		 450 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  25.44 
 
 		 447 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  24.63 
 
 		 463 aa  80.9  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  25.3 
 
 		 489 aa  80.1  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  24.28 
 
 		 455 aa  79.3  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0042  radical SAM family protein  22.35 
 
 		 452 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  24.41 
 
 		 477 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  20.66 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  22 
 
 		 450 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  30.34 
 
 		 464 aa  76.3  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  21.99 
 
 		 484 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2284  Radical SAM domain protein  24.34 
 
 		 444 aa  74.3  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00108467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  24.78 
 
 		 460 aa  73.9  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  22.19 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  22.92 
 
 		 473 aa  71.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  22.58 
 
 		 485 aa  70.9  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0478  radical SAM family protein  20.9 
 
 		 448 aa  70.5  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  26.98 
 
 		 486 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0897  Radical SAM domain protein  23.08 
 
 		 454 aa  70.1  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07060  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  23.71 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  23.55 
 
 		 450 aa  69.7  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1369  radical SAM domain-containing protein  22.78 
 
 		 454 aa  69.3  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  30.97 
 
 		 462 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  22.75 
 
 		 458 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  28.14 
 
 		 460 aa  68.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  21.87 
 
 		 455 aa  67.4  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  22.05 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  22.59 
 
 		 476 aa  66.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  22.07 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1340  radical SAM domain-containing protein  24.59 
 
 		 467 aa  65.9  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4676  Radical SAM domain-containing protein  22.26 
 
 		 434 aa  66.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100099  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  30.67 
 
 		 481 aa  65.1  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  21.39 
 
 		 449 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  26.35 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  23.24 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  27.88 
 
 		 462 aa  64.3  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3364  radical SAM domain-containing protein  33.08 
 
 		 484 aa  63.5  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.155713  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  27.08 
 
 		 465 aa  63.5  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  28.67 
 
 		 728 aa  63.2  0.000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3987  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  24.4 
 
 		 383 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  21.11 
 
 		 476 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  23.76 
 
 		 438 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  22.35 
 
 		 456 aa  62  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  21.11 
 
 		 476 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  19.54 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  22.69 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  22.12 
 
 		 476 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  19.54 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  28.08 
 
 		 464 aa  60.8  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2880  radical SAM family protein  27.11 
 
 		 383 aa  60.8  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  20.94 
 
 		 476 aa  61.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  19.54 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  22.91 
 
 		 800 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  20.58 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  23.3 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  26.53 
 
 		 460 aa  60.5  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  20.64 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1401  Radical SAM domain protein  22.04 
 
 		 356 aa  59.3  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6334  Radical SAM domain protein  20.56 
 
 		 419 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0725918  hitchhiker  0.00194618 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  29.35 
 
 		 565 aa  59.7  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  21.18 
 
 		 484 aa  58.9  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1270  radical SAM domain-containing protein  20.77 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>