223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1796 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1796  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 619 aa  1278    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3220  Rhs element Vgr protein  82.88 
 
 		 618 aa  1051    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  29.18 
 
 		 615 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  28.68 
 
 		 617 aa  224  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0660  hypothetical protein  28.47 
 
 		 605 aa  203  7e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.279373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3931  Rhs element Vgr protein  27.77 
 
 		 616 aa  197  6e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.410968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  28.2 
 
 		 602 aa  191  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3589  Rhs element Vgr protein  28.4 
 
 		 612 aa  186  8e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.512863 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4015  Rhs element Vgr protein  27.15 
 
 		 602 aa  178  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211679  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4864  Rhs element Vgr protein  26.67 
 
 		 599 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0846936  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4109  Rhs element Vgr protein  25.61 
 
 		 576 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0273732 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  24.61 
 
 		 697 aa  91.7  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  21.74 
 
 		 643 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  21.95 
 
 		 646 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  20.86 
 
 		 668 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  22.92 
 
 		 593 aa  81.3  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  21.92 
 
 		 565 aa  79.7  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  23.12 
 
 		 589 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  21.67 
 
 		 668 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  23.71 
 
 		 589 aa  78.2  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  23.53 
 
 		 596 aa  77.4  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  21.86 
 
 		 574 aa  77.4  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  22.92 
 
 		 589 aa  77.4  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  21.47 
 
 		 668 aa  77.4  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  22.73 
 
 		 578 aa  74.7  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  23 
 
 		 576 aa  74.7  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0838  Rhs element Vgr protein  22.17 
 
 		 697 aa  74.3  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  23.25 
 
 		 592 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0153  Rhs element Vgr protein  20 
 
 		 689 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  22.02 
 
 		 669 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  23.93 
 
 		 596 aa  70.9  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  19.3 
 
 		 741 aa  70.5  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  27.83 
 
 		 248 aa  70.5  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  27.32 
 
 		 218 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3666  Rhs element Vgr protein  29.15 
 
 		 226 aa  68.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408922  decreased coverage  0.0000749166 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  20.73 
 
 		 689 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  22.38 
 
 		 709 aa  67.8  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3849  Rhs element Vgr protein  20.73 
 
 		 675 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3482  Rhs element Vgr protein  22.54 
 
 		 675 aa  67.4  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0192027  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  20.65 
 
 		 714 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7056  vgrG protein  22.13 
 
 		 741 aa  67  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0833871  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  20.87 
 
 		 741 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  22.68 
 
 		 680 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2151  Rhs element Vgr protein  22.06 
 
 		 706 aa  66.2  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2513  type VI secretion system Vgr family protein  21.82 
 
 		 682 aa  66.2  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  21.68 
 
 		 595 aa  65.5  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0454  Rhs element Vgr protein  20.89 
 
 		 671 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  21.1 
 
 		 741 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1538  two component LuxR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 621 aa  65.1  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1234  Vgr family type VI secretion system  22.28 
 
 		 704 aa  64.3  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.270466 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3719  Rhs element Vgr protein  21.9 
 
 		 723 aa  64.3  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331309  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3155  Rhs element Vgr protein  21.74 
 
 		 581 aa  63.9  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  21.14 
 
 		 724 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  22.36 
 
 		 785 aa  62  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5597  Rhs element Vgr protein  25.82 
 
 		 1118 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  21.07 
 
 		 907 aa  61.6  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1155  type VI secretion system Vgr family protein  20.6 
 
 		 706 aa  61.6  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0542625  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1638  type VI secretion system Vgr family protein  22.03 
 
 		 702 aa  61.2  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.674786  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2565  Rhs element Vgr protein  21.85 
 
 		 687 aa  61.2  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125293  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2572  Rhs element Vgr protein  21.85 
 
 		 687 aa  61.2  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0544876  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2579  Rhs element Vgr protein  21.85 
 
 		 687 aa  61.2  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472026  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2094  Rhs element Vgr protein  24.55 
 
 		 646 aa  61.2  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.730907  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3684  Rhs element Vgr protein  27.05 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149401  hitchhiker  0.000521794 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1114  type VI secretion system Vgr family protein  21.03 
 
 		 713 aa  60.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  21.78 
 
 		 610 aa  60.8  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  19.92 
 
 		 689 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  25.69 
 
 		 616 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2202  type VI secretion system Vgr family protein  22.03 
 
 		 702 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0264417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  19.78 
 
 		 755 aa  60.1  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  24.8 
 
 		 602 aa  60.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1726  Rhs element Vgr protein  21.66 
 
 		 642 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2044  Rhs element Vgr protein  21.32 
 
 		 680 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.909849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2595  Rhs element Vgr protein  20.91 
 
 		 912 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.43186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  20.75 
 
 		 796 aa  59.3  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2064  type VI secretion system Vgr family protein  21.91 
 
 		 702 aa  58.9  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0713545 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67230  hypothetical protein  19.7 
 
 		 790 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  20.21 
 
 		 756 aa  58.9  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0531  type VI secretion system Vgr family protein  24.23 
 
 		 1003 aa  58.2  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  22.13 
 
 		 596 aa  58.2  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  22.14 
 
 		 730 aa  58.2  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  22.36 
 
 		 901 aa  57.4  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3927  Rhs element Vgr protein  22.2 
 
 		 604 aa  57.4  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00332693  hitchhiker  0.00450013 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0243  type VI secretion system Vgr family protein  22.76 
 
 		 713 aa  57.4  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  26.48 
 
 		 598 aa  57.4  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  21.05 
 
 		 780 aa  57.4  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  21.13 
 
 		 771 aa  57  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4257  type VI secretion system Vgr family protein  19.5 
 
 		 610 aa  56.6  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  25.06 
 
 		 641 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2821  Rhs element protein VgrE  21.04 
 
 		 690 aa  55.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3949  Rhs element Vgr protein  22.49 
 
 		 691 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0245  type VI secretion system Vgr family protein  22.55 
 
 		 713 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0345  type VI secretion system Vgr family protein  21.12 
 
 		 619 aa  55.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  22.2 
 
 		 777 aa  55.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0251  type VI secretion system Vgr family protein  20.93 
 
 		 713 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830075 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  25 
 
 		 618 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5574  Rhs element Vgr protein  20.78 
 
 		 741 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0043  Rhs element Vgr protein  24.74 
 
 		 320 aa  55.1  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0650  Rhs element Vgr protein  23.91 
 
 		 727 aa  55.1  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0732792  normal  0.0253872 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  20.7 
 
 		 735 aa  54.7  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  21.17 
 
 		 794 aa  54.7  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>