More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0449 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0449  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  496  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.766898  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1553  protein of unknown function DUF140  66.53 
 
 
245 aa  353  1e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00323252  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07665  hypothetical protein  71.55 
 
 
233 aa  350  1e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.232914  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5158  protein of unknown function DUF140  45.87 
 
 
243 aa  232  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0739546  normal  0.291471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3461  protein of unknown function DUF140  44.81 
 
 
244 aa  222  4e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0854516 
 
 
-
 
NC_002950  PG1033  hypothetical protein  46.19 
 
 
248 aa  219  1.9999999999999999e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000157108 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3962  protein of unknown function DUF140  45.04 
 
 
242 aa  210  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1211  protein of unknown function DUF140  43.32 
 
 
247 aa  209  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.304372  hitchhiker  0.00000000370263 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2194  ABC transporter, permease  44.64 
 
 
243 aa  201  9e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00800733 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1030  hypothetical protein  42.36 
 
 
229 aa  182  3e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2342  protein of unknown function DUF140  38.33 
 
 
253 aa  166  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.913392  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  33.2 
 
 
256 aa  126  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  31.84 
 
 
258 aa  122  8e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  35.87 
 
 
247 aa  118  7.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  31.15 
 
 
250 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  30.99 
 
 
260 aa  113  3e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  29.67 
 
 
257 aa  113  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0050  hypothetical protein  31.82 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  29.96 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  32.93 
 
 
256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  33.33 
 
 
263 aa  108  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  29.75 
 
 
257 aa  108  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  34.1 
 
 
261 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0084  hypothetical protein  33.64 
 
 
275 aa  107  2e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.485873  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  33.33 
 
 
413 aa  105  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1524  hypothetical protein  35.78 
 
 
261 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0162884  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  31.82 
 
 
251 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  31.43 
 
 
251 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  31.43 
 
 
251 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  30.98 
 
 
267 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  29.8 
 
 
266 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  26.77 
 
 
264 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  34.27 
 
 
267 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  34.15 
 
 
380 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  27.76 
 
 
266 aa  100  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2277  protein of unknown function DUF140  28.51 
 
 
371 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  29.84 
 
 
258 aa  99  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  30.04 
 
 
382 aa  99  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  31.88 
 
 
260 aa  99  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  34.98 
 
 
263 aa  98.2  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  27.92 
 
 
263 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0208  protein of unknown function DUF140  28.51 
 
 
268 aa  97.4  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00143644  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  31.94 
 
 
256 aa  97.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  29.18 
 
 
255 aa  97.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  27.92 
 
 
263 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  29.66 
 
 
382 aa  97.4  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3314  protein of unknown function DUF140  32.67 
 
 
245 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  30.93 
 
 
373 aa  96.7  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1915  ABC transporter permease  30 
 
 
381 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  29.11 
 
 
267 aa  96.3  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22680  putative permease of ABC transporter  29.87 
 
 
381 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590843 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  30.42 
 
 
258 aa  95.9  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  28.63 
 
 
250 aa  95.9  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  28.02 
 
 
257 aa  95.1  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  32.53 
 
 
270 aa  95.1  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  32 
 
 
264 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  31.31 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  30 
 
 
269 aa  94.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256221  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  32.18 
 
 
249 aa  93.6  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  31.31 
 
 
258 aa  94  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0449  putative ABC transporter, permease protein YrbE  27.07 
 
 
260 aa  92.8  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.487258  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1145  hypothetical protein  27.07 
 
 
260 aa  92.8  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  31.48 
 
 
257 aa  92.4  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0513  hypothetical protein  27.07 
 
 
260 aa  92.8  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2257  hypothetical protein  34.63 
 
 
265 aa  92.4  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218555  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1852  protein of unknown function DUF140  29.11 
 
 
261 aa  92.4  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2096  hypothetical protein  27.35 
 
 
249 aa  92.4  7e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.738909  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1952  hypothetical protein  30.05 
 
 
384 aa  92  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0257894  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  29.11 
 
 
377 aa  92  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  29.3 
 
 
384 aa  91.7  9e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  30.48 
 
 
264 aa  91.7  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0023  transporter, putative  28.1 
 
 
250 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4256  hypothetical protein  30.22 
 
 
265 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  30.28 
 
 
260 aa  90.5  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0798  protein of unknown function DUF140  30.45 
 
 
378 aa  90.1  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.737521  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  30.99 
 
 
377 aa  90.1  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0648  ABC transporter, permease protein, putative  30.45 
 
 
378 aa  90.1  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  30.52 
 
 
252 aa  90.1  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0966  hypothetical protein  30.22 
 
 
265 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  27.76 
 
 
260 aa  90.1  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  26.67 
 
 
270 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  27.76 
 
 
260 aa  90.1  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  28.7 
 
 
385 aa  89.7  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  30.99 
 
 
377 aa  90.1  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0980  hypothetical protein  27.48 
 
 
261 aa  89.4  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  28.16 
 
 
260 aa  89.7  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1738  hypothetical protein  30.95 
 
 
260 aa  89.7  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.025954  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0998  hypothetical protein  30.22 
 
 
265 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0851  protein of unknown function DUF140  30.56 
 
 
381 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0891  hypothetical protein  30.56 
 
 
382 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.250825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0864  hypothetical protein  28.11 
 
 
265 aa  89  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12860  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, permease component  29.02 
 
 
265 aa  88.6  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4359  hypothetical protein  28.21 
 
 
260 aa  88.6  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.775319  normal  0.0567326 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5027  ABC transporter permease  27.68 
 
 
265 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0959  hypothetical protein  29.78 
 
 
266 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  25.6 
 
 
269 aa  88.6  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5085  hypothetical protein  30.66 
 
 
377 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57870  ABC transporter permease  27.68 
 
 
265 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0282  hypothetical protein  26.69 
 
 
260 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0289  protein of unknown function DUF140  26.69 
 
 
260 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.16381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>