More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0559 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_0559  DNA-binding response regulator CreB  100 
 
 		 229 aa  469  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04274  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with CreC  77.88 
 
 		 229 aa  367  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3658  DNA-binding response regulator CreB  77.88 
 
 		 229 aa  367  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04239  hypothetical protein  77.88 
 
 		 229 aa  367  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3599  two component transcriptional regulator, winged helix family  77.43 
 
 		 229 aa  365  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5913  DNA-binding response regulator CreB  77.43 
 
 		 229 aa  364  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4949  DNA-binding response regulator CreB  76.99 
 
 		 229 aa  363  1e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4634  DNA-binding response regulator CreB  76.99 
 
 		 229 aa  362  2e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4997  DNA-binding response regulator CreB  76.55 
 
 		 229 aa  361  6e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4946  DNA-binding response regulator CreB  76.15 
 
 		 221 aa  344  6e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4912  DNA-binding response regulator CreB  76.55 
 
 		 229 aa  342  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5000  DNA-binding response regulator CreB  76.55 
 
 		 229 aa  342  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4839  DNA-binding response regulator CreB  76.11 
 
 		 229 aa  340  8e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.877159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4946  DNA-binding response regulator CreB  76.11 
 
 		 229 aa  340  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4998  DNA-binding response regulator CreB  76.11 
 
 		 229 aa  339  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.866584 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0878  DNA-binding response regulator CreB  64.91 
 
 		 232 aa  284  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0875  DNA-binding response regulator CreB  64.91 
 
 		 232 aa  283  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3843  DNA-binding response regulator CreB  64.47 
 
 		 232 aa  281  5.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.980313 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3896  DNA-binding response regulator CreB  67.84 
 
 		 231 aa  271  4.0000000000000004e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.49169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0912  DNA-binding response regulator CreB  55.74 
 
 		 236 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0185  DNA-binding response regulator CreB  54.82 
 
 		 226 aa  240  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3569  DNA-binding response regulator CreB  54.24 
 
 		 237 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0155325  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4798  DNA-binding response regulator CreB  54.24 
 
 		 237 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5485  DNA-binding response regulator CreB  54.24 
 
 		 237 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.631221 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1652  DNA-binding response regulator CreB  53.91 
 
 		 232 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2656  two component transcriptional regulator  51.33 
 
 		 226 aa  227  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.311089  normal  0.831438 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0135  two component transcriptional regulator  51.87 
 
 		 251 aa  222  4e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.134918  normal  0.276067 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4120  DNA-binding response regulator CreB  52.7 
 
 		 226 aa  221  7e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5196  DNA-binding response regulator CreB  52.44 
 
 		 226 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0360  DNA-binding response regulator CreB  52.02 
 
 		 226 aa  218  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.48199  normal  0.18469 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1317  two component transcriptional regulator  50.63 
 
 		 240 aa  217  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.886781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0568  DNA-binding response regulator CreB  52.02 
 
 		 229 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391692  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0357  DNA-binding response regulator CreB  52.65 
 
 		 226 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.501858  normal  0.680539 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4871  DNA-binding response regulator CreB  52.91 
 
 		 226 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608103  normal  0.305164 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3176  DNA-binding response regulator CreB  52.44 
 
 		 226 aa  215  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0027  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.2 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0030  two component transcriptional regulator  48.78 
 
 		 282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.815374  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06060  DNA-binding response regulator CreB  51.57 
 
 		 229 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519358 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1204  DNA-binding response regulator CreB  51.53 
 
 		 242 aa  206  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.155073 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5423  two component transcriptional regulator  46.93 
 
 		 239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3904  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.4 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1992  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.9 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.703312  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0237  two component transcriptional regulator  47.19 
 
 		 226 aa  188  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0402  two component transcriptional regulator  43.16 
 
 		 235 aa  178  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.344138  normal  0.0526207 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2441  two component transcriptional regulator  41.15 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4990  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.866601  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1681  two-component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 		 237 aa  176  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1884  two component transcriptional regulator  42.17 
 
 		 233 aa  175  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3557  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  43.3 
 
 		 239 aa  175  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0314  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 233 aa  175  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.765921 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4477  response regulator receiver  44.14 
 
 		 228 aa  175  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1461  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.05 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.616357  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.65 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0536  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1485  response regulator receiver  42.29 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.236897  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2590  two component transcriptional regulator  38.91 
 
 		 230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0968  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 		 227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.00000000899876  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2047  two component transcriptional regulator  42.42 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.50343  normal  0.117999 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0212  two component transcriptional regulator  40.53 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2261  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  42.73 
 
 		 240 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.806239  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3305  DNA-binding response regulator BaeR  40.61 
 
 		 232 aa  172  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.304306  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2361  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  42.73 
 
 		 240 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2477  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  42.73 
 
 		 240 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2368  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  42.73 
 
 		 240 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.531777  normal  0.413146 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 		 230 aa  171  9e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  41.07 
 
 		 231 aa  171  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05646  two-component response regulator transcription regulator protein  40.99 
 
 		 219 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 234 aa  170  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  41.18 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2317  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  42.29 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.539006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2281  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.331932  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  41.07 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2972  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  41.59 
 
 		 242 aa  169  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 236 aa  169  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2476  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 241 aa  169  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000027247 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4585  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 234 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.209184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2689  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  42.53 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6330  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.65 
 
 		 234 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000626879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0318  two component transcriptional regulator  47.79 
 
 		 227 aa  169  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1307  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  40.87 
 
 		 242 aa  168  6e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.89 
 
 		 226 aa  168  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.34 
 
 		 226 aa  168  7e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1316  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.99 
 
 		 232 aa  168  7e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 236 aa  168  8e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1257  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 229 aa  168  8e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.536699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 228 aa  168  8e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 230 aa  167  8e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 228 aa  168  8e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 228 aa  168  8e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1924  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 230 aa  167  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.399122 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.05 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4718  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  45.22 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.220817 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3969  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.162736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5185  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  45.22 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.89 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>