70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1950 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1950  glutaredoxin  100 
 
 
80 aa  169  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000181605  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  48.68 
 
 
82 aa  79  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11170  glutaredoxin  47.44 
 
 
78 aa  78.6  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  47.22 
 
 
105 aa  75.9  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07400  glutaredoxin-like protein  47.44 
 
 
82 aa  72  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1084  glutaredoxin  44.87 
 
 
103 aa  70.5  0.000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1387  glutaredoxin  40.74 
 
 
77 aa  65.1  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.252635  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1103  glutaredoxin family protein  50.63 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000207624  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1540  ATP-dependent helicase HrpB  42.5 
 
 
121 aa  60.8  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  45.83 
 
 
118 aa  60.1  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2758  glutaredoxin  45.33 
 
 
118 aa  58.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.334545  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  45.83 
 
 
118 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2487  glutaredoxin  45.83 
 
 
118 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0780124  normal  0.16751 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2417  glutaredoxin  45.83 
 
 
118 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.656384  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1562  glutaredoxin  44.16 
 
 
118 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001457  glutaredoxin  39.51 
 
 
119 aa  56.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  45.83 
 
 
118 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05393  hypothetical protein  38.27 
 
 
119 aa  56.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1688  glutaredoxin  45.83 
 
 
118 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1710  glutaredoxin  44.44 
 
 
118 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.506968 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2669  glutaredoxin  44.44 
 
 
118 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0368347  normal  0.0510929 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1673  glutaredoxin  44.44 
 
 
118 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  41.67 
 
 
123 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1032  glutaredoxin  43.24 
 
 
130 aa  55.5  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.783959  normal  0.67876 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1594  glutaredoxin  42.67 
 
 
118 aa  53.9  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  40.51 
 
 
118 aa  53.9  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1598  glutaredoxin  40.54 
 
 
118 aa  53.9  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328495  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  39.29 
 
 
123 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3634  hypothetical protein  38.46 
 
 
124 aa  52  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3222  glutaredoxin  37.18 
 
 
115 aa  50.8  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2005  glutaredoxin  43.06 
 
 
118 aa  51.2  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.916013  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1501  glutaredoxin  42.25 
 
 
118 aa  50.8  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.676522  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0167  glutaredoxin family protein  43.24 
 
 
130 aa  50.4  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.08495 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0816  putative glutaredoxin  38.67 
 
 
119 aa  50.1  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2379  glutaredoxin family protein  40.51 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.272824  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3628  glutaredoxin  40 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0827  putative glutaredoxin  40.26 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1899  glutaredoxin  36.59 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2745  glutaredoxin  41.33 
 
 
122 aa  47  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0841717  normal  0.856746 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0406  glutaredoxin  32.47 
 
 
86 aa  47  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.394009  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0951  glutaredoxin  35.53 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.40724  normal  0.0261252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1430  glutaredoxin  38.36 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11658  normal  0.297548 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2784  glutaredoxin  38.98 
 
 
84 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.420129  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  35.8 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4059  glutaredoxin  34.18 
 
 
130 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2946  glutaredoxin  31.17 
 
 
78 aa  43.5  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.758078  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1400  glutaredoxin  39.73 
 
 
123 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111122  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2107  glutaredoxin  30.67 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.367569  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0048  glutaredoxin  31.08 
 
 
105 aa  42.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  30.99 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1822  glutaredoxin  39.73 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0545572  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2410  glutaredoxin  32.93 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3889  glutaredoxin  39.73 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.280842 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3209  glutaredoxin 3  29.73 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1714  hypothetical protein  40 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0886  glutaredoxin  33.78 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1712  glutaredoxin  31.08 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266402  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0554  glutaredoxin  35.53 
 
 
78 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2053  hypothetical protein  29.76 
 
 
87 aa  41.6  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01251  putative glutathione S-transferase  30.56 
 
 
241 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.621374 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  29.58 
 
 
84 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0256  glutaredoxin  33.73 
 
 
86 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.296093  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2449  hypothetical protein  31.75 
 
 
79 aa  40.8  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  33.33 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2075  glutaredoxin  31.75 
 
 
79 aa  40.8  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1250  glutaredoxin  27.78 
 
 
83 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.461543  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3472  glutaredoxin family protein  28.99 
 
 
243 aa  40.8  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.99974  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2034  hypothetical protein  41.03 
 
 
125 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144107  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0127  glutaredoxin GrxC  32 
 
 
91 aa  40.4  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0333761  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29383  predicted protein  37.33 
 
 
309 aa  40.4  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.066564  normal  0.454968 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>