More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2970 on replicon NC_008741
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008741  Dvul_2970  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  431  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0745  two component LuxR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2917  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.5 
 
 		 216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1122  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.58 
 
 		 234 aa  125  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.752968  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3668  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.78 
 
 		 213 aa  125  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1123  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.4 
 
 		 242 aa  121  9e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2227  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.21 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.632961  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1551  two component LuxR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 229 aa  115  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1595  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.5 
 
 		 203 aa  115  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.356259  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0304  two component LuxR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.103244 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2093  two component LuxR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 206 aa  111  9e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000328625  normal  0.180863 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.34 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4648  two component LuxR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3239  two component LuxR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 274 aa  108  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 233 aa  108  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3060  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.5 
 
 		 215 aa  108  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2966  two component LuxR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 218 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.288922 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3043  LuxR family DNA binding response regulator  33 
 
 		 209 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2855  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.85 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3100  two component LuxR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.650822  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2713  two component LuxR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4563  two component LuxR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0560765 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3829  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.04 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.026767 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5187  two component LuxR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5672  two component LuxR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1539  two component LuxR family transcriptional regulator  34 
 
 		 230 aa  105  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5451  two component LuxR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 223 aa  105  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.761649  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1646  two component LuxR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 219 aa  105  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5199  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 225 aa  105  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2078  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.41 
 
 		 210 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3052  two component LuxR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 218 aa  104  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5498  two component LuxR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 214 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509748 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.27 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.5 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.58 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3074  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0026  two component LuxR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 214 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7047  two component LuxR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2441  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3055  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327843  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6558  two component LuxR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4946  two component LuxR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0203352 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2071  LuxR family DNA-binding response regulator  35 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2364  LuxR family DNA-binding response regulator  35 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1463  LuxR family DNA-binding response regulator  35 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1762  two component LuxR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5322  two component LuxR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.929677 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1100  LuxR family DNA-binding response regulator  35 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1379  LuxR family DNA-binding response regulator  35 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1595  two component LuxR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 209 aa  102  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167261 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3597  two component LuxR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 214 aa  102  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 214 aa  102  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 215 aa  101  7e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.731747  normal  0.987016 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6403  two component LuxR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 271 aa  101  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0209  LuxR family DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 218 aa  101  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3133  LuxR family DNA-binding response regulator  35 
 
 		 215 aa  101  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  33.51 
 
 		 206 aa  101  8e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0132  two component LuxR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 196 aa  101  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.401597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2180  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 209 aa  101  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000360675 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3186  two component LuxR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.10411 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0242  two component LuxR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 211 aa  101  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000159114 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1336  two component LuxR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 208 aa  101  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7764  two component LuxR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.527093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0043  two component LuxR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0180  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.63 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3248  LuxR family DNA-binding response regulator  35.02 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.780539  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3391  LuxR family DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0243  LuxR family DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0231  LuxR family DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.214964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0425  LuxR family DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0536791  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2955  LuxR family DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0816  two component LuxR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000419268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0709  two component LuxR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.421893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2133  LuxR family DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3576  two component LuxR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4382  two component LuxR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 209 aa  99.8  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0581  two component LuxR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 210 aa  99.8  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4347  two component LuxR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 218 aa  99.8  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3290  LuxR family DNA-binding response regulator  33.01 
 
 		 455 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1565  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.62 
 
 		 214 aa  99.4  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0901  two component LuxR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 235 aa  99.4  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00996  response regulator  35.9 
 
 		 210 aa  99  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0885199  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06170  response regulator  35.9 
 
 		 210 aa  99  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.624626  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2335  LuxR family DNA-binding response regulator  34.55 
 
 		 215 aa  99  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.77 
 
 		 215 aa  99  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2722  two component LuxR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 214 aa  98.6  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3419  LuxR response regulator receiver  37.14 
 
 		 231 aa  98.6  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393456  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0254  LuxR family DNA-binding response regulator  29.76 
 
 		 215 aa  98.2  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0849  two component LuxR family transcriptional regulator  33 
 
 		 209 aa  98.2  9e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1290  two component LuxR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 209 aa  98.2  9e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.542915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1402  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5446  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.31 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.37 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4331  two component LuxR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.748519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2160  LuxR family DNA-binding response regulator  33.17 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.49 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.520546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1390  two component LuxR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 225 aa  96.7  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>