More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2582 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2582  ABC transporter related  100 
 
 		 221 aa  456  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000122652 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001783  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  53.99 
 
 		 217 aa  250  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5954  ABC transporter related protein  53.05 
 
 		 218 aa  232  4.0000000000000004e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3903  ABC transporter related  47.69 
 
 		 217 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.106958 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0815  ABC transporter related  52.34 
 
 		 217 aa  228  5e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0774  ABC transporter related  52.34 
 
 		 217 aa  228  5e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00137592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3811  ABC transporter related  50.7 
 
 		 218 aa  226  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0745  ABC transporter related  51.63 
 
 		 222 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5580  ABC transporter related  52.58 
 
 		 217 aa  226  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.819808 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0736  ABC transporter related  51.87 
 
 		 233 aa  225  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0841853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1781  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  48.15 
 
 		 220 aa  225  5.0000000000000005e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1152  ABC transporter related  50.93 
 
 		 217 aa  224  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1335  BexA  51.61 
 
 		 217 aa  223  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0623  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component-like protein  48.15 
 
 		 286 aa  223  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3867  ABC transporter, ATPase subunit  51.64 
 
 		 217 aa  221  9e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1524  ABC transporter related  49.77 
 
 		 216 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2730  ABC transporter related  49.3 
 
 		 216 aa  219  3e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1620  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  46.3 
 
 		 220 aa  218  5e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1440  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  46.3 
 
 		 220 aa  218  5e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0292  ABC transporter related  49.54 
 
 		 218 aa  218  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0776  ABC transporter related  49.54 
 
 		 218 aa  218  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1659  ABC transporter related  49.3 
 
 		 217 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4084  ABC transporter related  46.45 
 
 		 269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.185467  normal  0.229237 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3839  ABC polysaccharide export transporter, ATPase subunit  46.45 
 
 		 273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00536302  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4995  ABC transporter related  45.54 
 
 		 219 aa  212  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0209263 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0434  ABC transporter related  49.3 
 
 		 217 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554012  decreased coverage  0.00307291 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1505  ABC transporter related protein  48.6 
 
 		 224 aa  211  7.999999999999999e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3234  polysialic acid capsule biosynthesis transport protein KpsT  47.71 
 
 		 219 aa  210  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.953201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0712  cell surface polysaccharide export ABC-2 transporter ATP-binding protein  46.01 
 
 		 217 aa  210  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2127  ABC transporter related  47.73 
 
 		 225 aa  208  6e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2182  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  48.86 
 
 		 218 aa  208  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2304  capsule polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  48.86 
 
 		 218 aa  208  7e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3251  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  48.86 
 
 		 218 aa  208  7e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1075  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  48.86 
 
 		 218 aa  208  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.460756  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2576  ABC transporter related  48.13 
 
 		 217 aa  207  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.502206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2963  capsule polysaccharide exporter, ATP-binding protein  48.13 
 
 		 217 aa  207  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.382388  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2607  ABC transporter related  44.95 
 
 		 218 aa  206  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5037  ABC transporter related  47.27 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2758  ABC transporter related  46.79 
 
 		 229 aa  205  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2344  ABC transporter related  49.08 
 
 		 217 aa  204  9e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.268315  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02776  hypothetical protein  44.91 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000456764  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0291  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  42.08 
 
 		 223 aa  204  1e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2077  ABC transporter related  47.62 
 
 		 220 aa  202  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.475401 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0720  ABC transporter related  47.42 
 
 		 215 aa  200  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02827  Polysialic acid transport ATP-binding KpsT  44.76 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0748  ABC transporter related  44.65 
 
 		 232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4077  ABC transporter related  42.38 
 
 		 219 aa  196  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0433978 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3239  ABC transporter related  46.26 
 
 		 216 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1305  polysialic acid transport ATP-binding protein  48.62 
 
 		 220 aa  193  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0660  ABC transporter related  46.48 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.188715  normal  0.0364209 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0585  capsule polysaccharide export  45.87 
 
 		 219 aa  192  4e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3493  ABC transporter related  41.78 
 
 		 220 aa  191  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1235  ABC transporter related  46.54 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000953894  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03060  KpsT protein  43.84 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5731  polysialic acid transport ATP-binding protein KpsT  44.34 
 
 		 221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3656  ABC transporter related  42.52 
 
 		 219 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0655  ABC transporter related  40.65 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4940  ATPase component ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system  37.73 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.687059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  41.62 
 
 		 435 aa  156  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3995  hypothetical protein  46.2 
 
 		 179 aa  156  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.67953  normal  0.524106 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0524  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  49.67 
 
 		 157 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.216602  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0296  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  36.8 
 
 		 264 aa  145  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.184295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0660  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  35.59 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00591854  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  40.93 
 
 		 432 aa  144  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0675  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  35.59 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00100596  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0564  ABC transporter related  40.64 
 
 		 406 aa  143  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  41.75 
 
 		 436 aa  143  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3014  ABC transporter related  36.61 
 
 		 238 aa  142  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0480496  hitchhiker  0.000194399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5670  ABC transporter related protein  39.29 
 
 		 253 aa  142  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0408186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1314  ABC transporter related  38.92 
 
 		 424 aa  142  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.0317706 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1387  ABC transporter related  38.21 
 
 		 402 aa  141  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.928113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3964  ABC transporter related  39.39 
 
 		 416 aa  142  6e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0395  ABC transporter related  34.29 
 
 		 250 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  42.78 
 
 		 429 aa  140  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0877  ABC transporter related  34.29 
 
 		 250 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0767  ABC transporter related  39.59 
 
 		 406 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1731  ABC transporter-related protein  37.27 
 
 		 410 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6240  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  39.58 
 
 		 421 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71940  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  40 
 
 		 421 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0918  ABC transporter  38.86 
 
 		 405 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.441705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  37.63 
 
 		 266 aa  137  8.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0848  ABC transporter related  36.73 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174284 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5685  ABC transporter-like  36.54 
 
 		 416 aa  136  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0795174  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  37.81 
 
 		 247 aa  136  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  36.04 
 
 		 455 aa  135  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1779  lipopolysaccharide ABC export system, ATP-binding protein  35.64 
 
 		 405 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3138  ABC transporter related  37.31 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.303207  normal  0.442523 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4145  ABC transporter-related protein  33.62 
 
 		 429 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179677 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2200  ABC transporter related  38.27 
 
 		 498 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.206971  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  39.23 
 
 		 816 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  37.69 
 
 		 393 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.69 
 
 		 393 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  38.67 
 
 		 438 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  33.92 
 
 		 472 aa  132  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4190  ABC transporter related  39.78 
 
 		 246 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  36.49 
 
 		 870 aa  131  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  41.44 
 
 		 468 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  39.9 
 
 		 472 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1434  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  37.97 
 
 		 400 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.74682  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03166  ABC transporter, ATP binding protein  38.76 
 
 		 437 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>