More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1116 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1116  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  100 
 
 		 148 aa  302  9.000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.624499 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0608  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  66.67 
 
 		 147 aa  206  9e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3447  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  58.9 
 
 		 147 aa  191  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1434  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  48.25 
 
 		 151 aa  147  5e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  30.99 
 
 		 900 aa  72  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  32.89 
 
 		 907 aa  70.5  0.000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  30.65 
 
 		 874 aa  70.1  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0478  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  26.95 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3034  alanyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 		 888 aa  68.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.672449  normal  0.0438493 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1499  alanyl-tRNA synthetase  32.84 
 
 		 867 aa  68.6  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  28.87 
 
 		 904 aa  67.4  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  30 
 
 		 881 aa  66.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4881  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.5 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1597  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  29.6 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1549  alanine--tRNA ligase  29.6 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0332631  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  29.37 
 
 		 892 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1720  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  29.6 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.996643  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 		 913 aa  65.9  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4712  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.67 
 
 		 403 aa  65.1  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0289109  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  30.07 
 
 		 892 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  28.67 
 
 		 892 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  28.67 
 
 		 892 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  30.07 
 
 		 883 aa  64.3  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 		 882 aa  63.9  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0493  alanyl-tRNA synthetase  30.89 
 
 		 872 aa  64.3  0.0000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  32.84 
 
 		 859 aa  63.5  0.0000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  29.29 
 
 		 878 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  31.75 
 
 		 878 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0618  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.86 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.920461  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0962  alanyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 		 878 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1536  alanyl-tRNA synthetase  27.34 
 
 		 856 aa  62.4  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000027092  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0600  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  26.71 
 
 		 392 aa  62.4  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2571  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  33.07 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.613801  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  34.46 
 
 		 914 aa  62  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0956  alanyl-tRNA synthetase  25.71 
 
 		 591 aa  62  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.335992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3565  alanyl-tRNA synthetase  30 
 
 		 875 aa  61.6  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000341381  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0971  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.3 
 
 		 293 aa  62  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3568  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.37 
 
 		 408 aa  61.6  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.437121  normal  0.758255 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0730  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  31.82 
 
 		 398 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00140336 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  30.33 
 
 		 876 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  30.33 
 
 		 876 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0533  alanyl-tRNA synthetase  31.78 
 
 		 884 aa  61.2  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000106893  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  30.33 
 
 		 876 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  30.33 
 
 		 876 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2320  alanyl-tRNA synthetase  29.93 
 
 		 900 aa  61.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.871367  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0620  alanyl-tRNA synthetase  29.1 
 
 		 876 aa  60.5  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  30.33 
 
 		 876 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1345  Alanyl-tRNA synthetase, class IIc-like protein  29.73 
 
 		 249 aa  60.5  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  30.33 
 
 		 876 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2490  alanyl-tRNA synthetase  31.72 
 
 		 877 aa  60.5  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000298908  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  30.33 
 
 		 876 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  30.33 
 
 		 876 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 876 aa  60.5  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2617  alanyl-tRNA synthetase  29.85 
 
 		 879 aa  60.5  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00109675  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00511  alanyl-tRNA synthetase  28.77 
 
 		 886 aa  60.1  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2047  alanyl-tRNA synthetase  32.28 
 
 		 889 aa  60.1  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0621427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0934  alanyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 		 877 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  29.51 
 
 		 876 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3075  alanyl-tRNA synthetase  28.89 
 
 		 888 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1052  alanyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 		 877 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.103695 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1560  alanyl-tRNA synthetase  32.84 
 
 		 953 aa  58.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80417  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1193  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  29.08 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  29.71 
 
 		 863 aa  58.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6094  Alanine--tRNA ligase  32.85 
 
 		 890 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0138717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  28.77 
 
 		 864 aa  58.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0941  partial alanyl-tRNA synthetase  26.92 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  30.33 
 
 		 875 aa  58.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  29.51 
 
 		 876 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  29.51 
 
 		 876 aa  57.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  0.00000132365 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  28.67 
 
 		 910 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2431  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  27.61 
 
 		 389 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 		 923 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  29.51 
 
 		 876 aa  57.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  0.0000367228 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3214  alanyl-tRNA synthetase  29.84 
 
 		 881 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0063614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  29.51 
 
 		 876 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  29.23 
 
 		 874 aa  57.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  29.51 
 
 		 876 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1118  alanyl-tRNA synthetase  33.81 
 
 		 857 aa  57.4  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  30.14 
 
 		 913 aa  57.4  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  28.28 
 
 		 877 aa  57.4  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1030  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  33.61 
 
 		 240 aa  57.4  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.08615  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0089  alanyl-tRNA synthetase  31.34 
 
 		 879 aa  57.4  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2509  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  30.16 
 
 		 238 aa  57.4  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2333  phage tail protein I  29.5 
 
 		 404 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0209  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.33 
 
 		 390 aa  57  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.468608 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0418  alanyl-tRNA synthetase  25.9 
 
 		 865 aa  57  0.00000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2628  alanyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 874 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1819  alanyl-tRNA synthetase  29.85 
 
 		 892 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  26.87 
 
 		 860 aa  56.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2070  alanyl-tRNA synthetase  28.89 
 
 		 889 aa  57  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450401  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1848  alanyl-tRNA synthetase domain protein  29.6 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1739  alanyl-tRNA synthetase domain protein  29.6 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1887  alanyl-tRNA synthetase  28.03 
 
 		 872 aa  56.2  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3604  alanyl-tRNA synthetase domain protein  29.6 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1560  alanine--tRNA ligase  29.6 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0033  alanyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 		 925 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  27.61 
 
 		 860 aa  55.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1513  alanyl-tRNA synthetase  31.72 
 
 		 915 aa  56.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0446  alanyl-tRNA synthetase  28.91 
 
 		 871 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1770  alanyl-tRNA synthetase domain protein  29.6 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>