More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0600 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0600  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  100 
 
 
392 aa  782    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3878  alanyl-tRNA synthetase  29.1 
 
 
885 aa  99.4  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.785303  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2047  alanyl-tRNA synthetase  27.24 
 
 
889 aa  95.5  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0621427  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5265  alanyl-tRNA synthetase  28.76 
 
 
890 aa  93.6  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  25.38 
 
 
880 aa  92.4  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6094  Alanine--tRNA ligase  27.7 
 
 
890 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0138717  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2070  alanyl-tRNA synthetase  28.3 
 
 
889 aa  91.3  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450401  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2333  phage tail protein I  25.77 
 
 
404 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3075  alanyl-tRNA synthetase  28.77 
 
 
888 aa  88.6  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1193  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  32.48 
 
 
252 aa  87.8  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  26.57 
 
 
876 aa  87.4  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0658  alanyl-tRNA synthetase  24.42 
 
 
889 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  26.06 
 
 
879 aa  82.8  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0730  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  26.96 
 
 
398 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00140336 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2387  alanyl-tRNA synthetase  29.24 
 
 
897 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648952  normal  0.0242506 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2346  alanyl-tRNA synthetase  29.24 
 
 
897 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413447  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2135  alanyl-tRNA synthetase  25.47 
 
 
889 aa  82  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00198775  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2393  alanyl-tRNA synthetase  29.24 
 
 
897 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.545162 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2617  alanyl-tRNA synthetase  27.83 
 
 
879 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00109675  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2640  alanyl-tRNA synthetase  30 
 
 
898 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747101  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00147  alanyl-tRNA synthetase  32.2 
 
 
882 aa  80.1  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328967  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  29.8 
 
 
877 aa  79.7  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  27.31 
 
 
913 aa  79.7  0.00000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0209  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  25.68 
 
 
390 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.468608 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32618  predicted protein  26.48 
 
 
906 aa  79.3  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.63515 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  24.3 
 
 
913 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  25.59 
 
 
876 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1513  alanyl-tRNA synthetase  28.07 
 
 
915 aa  77.8  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3297  alanyl-tRNA synthetase  31.58 
 
 
891 aa  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000320998  normal  0.10569 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1330  alanyl-tRNA synthetase  25.18 
 
 
886 aa  77.4  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0429057  normal  0.324853 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0876  alanyl-tRNA synthetase  25.36 
 
 
899 aa  76.6  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.27264  normal  0.0167096 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17690  alanyl-tRNA synthetase  31.07 
 
 
895 aa  77  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.010603  normal  0.139761 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2407  alanyl-tRNA synthetase  27.01 
 
 
896 aa  76.3  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.714506  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12576  alanyl-tRNA synthetase  29.43 
 
 
904 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.251019  normal  0.0860525 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1819  alanyl-tRNA synthetase  30.58 
 
 
892 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_002936  DET0050  alanyl-tRNA synthetase  30.43 
 
 
871 aa  75.5  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12510  alanyl-tRNA synthetase  29.18 
 
 
893 aa  75.1  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617945  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4712  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.9 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0289109  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1828  alanyl-tRNA synthetase  30.1 
 
 
892 aa  74.3  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222093  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0719  alanyl-tRNA synthetase  28.17 
 
 
926 aa  73.9  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.507157  normal  0.398718 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_50  alanyl-tRNA synthetase  29.95 
 
 
876 aa  73.9  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000334801  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  27.54 
 
 
881 aa  73.9  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  28.27 
 
 
907 aa  73.9  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  31.84 
 
 
882 aa  73.6  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15270  alanyl-tRNA synthetase  31.71 
 
 
888 aa  73.6  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0205422  normal  0.854238 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  24 
 
 
868 aa  73.2  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3763  alanyl-tRNA synthetase  28.52 
 
 
898 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1536  alanyl-tRNA synthetase  26.1 
 
 
856 aa  72.8  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000027092  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4370  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.77 
 
 
401 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0256503 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1038  alanyl-tRNA synthetase  30.37 
 
 
878 aa  72.4  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.256869  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3635  alanyl-tRNA synthetase  26.67 
 
 
889 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.988674  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1689  alanyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
895 aa  72.4  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.153123  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  23.38 
 
 
860 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1377  alanyl-tRNA synthetase  23.13 
 
 
886 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.522237  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0226  alanyl-tRNA synthetase  22.6 
 
 
880 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821584  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0096  alanyl-tRNA synthetase  32.24 
 
 
894 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.172086  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2745  alanyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
892 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376883  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4881  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.99 
 
 
239 aa  72  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5505  alanyl-tRNA synthetase  26.48 
 
 
886 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195836  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0089  alanyl-tRNA synthetase  25.18 
 
 
879 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  23.93 
 
 
860 aa  71.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12720  alanyl-tRNA synthetase  26.64 
 
 
903 aa  70.9  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3158  alanyl-tRNA synthetase  29.82 
 
 
897 aa  71.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412954  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4806  alanyl-tRNA synthetase  23.78 
 
 
874 aa  70.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00251805  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1760  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  23.6 
 
 
383 aa  70.9  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000600128  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0898  alanyl-tRNA synthetase  21.87 
 
 
881 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1289  alanyl-tRNA synthetase  27.52 
 
 
865 aa  70.5  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1116  alanyl-tRNA synthetase  26.79 
 
 
875 aa  70.5  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0502279  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  22.34 
 
 
892 aa  70.1  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0728  alanyl-tRNA synthetase  24.29 
 
 
880 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00762442  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0883  alanyl-tRNA synthetase  28.71 
 
 
865 aa  70.1  0.00000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000818492  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3376  alanine--tRNA ligase (alanyl-tRNA synthetase)  23.24 
 
 
411 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1136  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  26.27 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000475056  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1432  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  24.58 
 
 
387 aa  69.7  0.00000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4220  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  33.63 
 
 
408 aa  69.7  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.147338  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0616  alanyl-tRNA synthetase  28.41 
 
 
893 aa  69.7  0.00000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3101  alanyl-tRNA synthetase  23.57 
 
 
880 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.438368  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0990  alanyl-tRNA synthetase  28.71 
 
 
865 aa  69.7  0.00000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3211  alanyl-tRNA synthetase  26.79 
 
 
875 aa  69.7  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.277669  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0618  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30 
 
 
265 aa  68.9  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.920461  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4521  alanyl-tRNA synthetase  23.93 
 
 
880 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00304935  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0407  alanyl-tRNA synthetase  29.49 
 
 
881 aa  69.3  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.101567 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4508  alanyl-tRNA synthetase  24.29 
 
 
880 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4471  alanyl-tRNA synthetase  23.93 
 
 
880 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00256411  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4132  alanyl-tRNA synthetase  23.93 
 
 
880 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1287  alanyl-tRNA synthetase  30.63 
 
 
891 aa  68.9  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.178643 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  25 
 
 
864 aa  69.3  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3565  alanyl-tRNA synthetase  30.59 
 
 
875 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000341381  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1299  alanyl-tRNA synthetase  28.85 
 
 
875 aa  68.9  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745017  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3267  alanyl-tRNA synthetase  28.43 
 
 
874 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235906  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4468  alanyl-tRNA synthetase  23.93 
 
 
880 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000190216 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 
874 aa  68.9  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  28.43 
 
 
874 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0357  alanyl-tRNA synthetase  27.94 
 
 
872 aa  69.3  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.160702  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1908  alanyl-tRNA synthetase  26.95 
 
 
926 aa  68.6  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1196  alanyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 
875 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00838926  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3214  alanyl-tRNA synthetase  29.3 
 
 
881 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0063614  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2571  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  30.29 
 
 
236 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.613801  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1198  alanyl-tRNA synthetase  27.59 
 
 
874 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.400961  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  27.48 
 
 
923 aa  68.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>