267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0707 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0707  PEP-utilising protein mobile region  100 
 
 		 866 aa  1709    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.454506 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0705  Pyruvate, water dikinase  34.84 
 
 		 877 aa  267  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440611 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2666  pyruvate, water dikinase  30.57 
 
 		 868 aa  242  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1355  pyruvate, water dikinase  26.56 
 
 		 870 aa  241  5e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.590002  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0649  pyruvate, water dikinase  29.15 
 
 		 893 aa  232  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2339  Pyruvate, water dikinase  32.78 
 
 		 868 aa  226  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0567  pyruvate, water dikinase  32.31 
 
 		 1062 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266468  normal  0.689283 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2045  Pyruvate, water dikinase  30.82 
 
 		 887 aa  223  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0174  pyruvate, water dikinase  34.15 
 
 		 884 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2815  pyruvate, water dikinase  26.36 
 
 		 853 aa  210  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.217826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1886  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  26.52 
 
 		 1037 aa  209  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1565  Pyruvate, water dikinase  32.28 
 
 		 871 aa  203  9e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.747222  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2044  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  28.95 
 
 		 830 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0630  pyruvate, water dikinase  27.97 
 
 		 875 aa  198  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1644  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.8 
 
 		 853 aa  197  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1568  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  31.61 
 
 		 869 aa  192  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1987  Pyruvate, water dikinase  32.37 
 
 		 918 aa  191  7e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0634  pyruvate, water dikinase  32.37 
 
 		 898 aa  190  8e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1988  Pyruvate, water dikinase  30.68 
 
 		 817 aa  190  9e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1990  Pyruvate, water dikinase  31.06 
 
 		 931 aa  180  8e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0151  pyruvate, water dikinase  30.25 
 
 		 887 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.293715  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0604  pyruvate,water dikinase  27.83 
 
 		 828 aa  173  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.722423  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2731  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  30.71 
 
 		 859 aa  172  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2393  pyruvate, water dikinase  29.41 
 
 		 819 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2187  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.42 
 
 		 861 aa  160  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0098  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  27.86 
 
 		 811 aa  155  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.567979 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0708  Pyruvate, water dikinase  30.9 
 
 		 923 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.473538 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  22.99 
 
 		 779 aa  71.6  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2655  phosphoenolpyruvate synthase  28.95 
 
 		 788 aa  70.9  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00600909  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  28.88 
 
 		 791 aa  69.3  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2080  phosphoenolpyruvate synthase  32.09 
 
 		 804 aa  68.9  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1864  phosphoenolpyruvate synthase  29.01 
 
 		 794 aa  68.6  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0751909  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  29.63 
 
 		 794 aa  68.6  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  24.72 
 
 		 758 aa  68.6  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5064  phosphoenolpyruvate synthase  29.29 
 
 		 796 aa  66.6  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.307557 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  30.25 
 
 		 799 aa  65.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809978 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  26.32 
 
 		 769 aa  65.1  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2203  phosphoenolpyruvate synthase  30.14 
 
 		 789 aa  65.1  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000184256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  30.25 
 
 		 799 aa  65.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  30.25 
 
 		 800 aa  65.1  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  30.25 
 
 		 800 aa  65.1  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  30.25 
 
 		 800 aa  65.1  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1274  phosphoenolpyruvate synthase  29.63 
 
 		 799 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  29.63 
 
 		 800 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2009  phosphoenolpyruvate synthase  28.14 
 
 		 791 aa  64.3  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000127973  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  25.96 
 
 		 761 aa  64.3  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2297  phosphoenolpyruvate synthase  29.02 
 
 		 808 aa  63.9  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000505096  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  22.47 
 
 		 758 aa  63.9  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  27.37 
 
 		 795 aa  63.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3011  phosphoenolpyruvate synthase  25.65 
 
 		 795 aa  63.2  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0685  hypothetical protein  22.73 
 
 		 565 aa  63.2  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.761628  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2366  phosphoenolpyruvate synthase  26.52 
 
 		 796 aa  63.5  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  27.53 
 
 		 795 aa  63.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  29.63 
 
 		 801 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  30.59 
 
 		 782 aa  63.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2243  phosphoenolpyruvate synthase  28.42 
 
 		 789 aa  63.5  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0079831  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1592  phosphoenolpyruvate synthase  28.42 
 
 		 789 aa  63.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000471516  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  25.98 
 
 		 754 aa  63.2  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1736  phosphoenolpyruvate synthase  28.42 
 
 		 789 aa  63.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00335783  normal  0.358822 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2879  phosphoenolpyruvate synthase  26.52 
 
 		 796 aa  63.5  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.286531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  27.53 
 
 		 795 aa  62.4  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  29.01 
 
 		 799 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  27.91 
 
 		 801 aa  62.8  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  29.95 
 
 		 797 aa  62.4  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2644  phosphoenolpyruvate synthase  28.42 
 
 		 789 aa  62  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1535  phosphoenolpyruvate synthase  29.01 
 
 		 799 aa  62  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.116027  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1405  phosphoenolpyruvate synthase  26.67 
 
 		 798 aa  62  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.640066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2561  phosphoenolpyruvate synthase  29.01 
 
 		 799 aa  62  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.424098  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2481  phosphoenolpyruvate synthase  27.96 
 
 		 789 aa  61.6  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0281757  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  29.01 
 
 		 799 aa  62  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1863  phosphoenolpyruvate synthase  27.96 
 
 		 789 aa  61.6  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0183397  hitchhiker  0.0000000630455 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  26.06 
 
 		 796 aa  62  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  29.01 
 
 		 799 aa  62  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  29.01 
 
 		 799 aa  62  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  29.01 
 
 		 812 aa  62  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  29.01 
 
 		 799 aa  62  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  27.96 
 
 		 789 aa  61.6  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  27.96 
 
 		 789 aa  61.6  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2438  phosphoenolpyruvate synthase  27.16 
 
 		 801 aa  61.2  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972203  normal  0.0321023 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  27.12 
 
 		 762 aa  61.2  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2174  phosphoenolpyruvate synthase  27.88 
 
 		 792 aa  60.8  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0176662 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1699  phosphoenolpyruvate synthase  27.16 
 
 		 800 aa  61.2  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.251717  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2549  phosphoenolpyruvate synthase  29.24 
 
 		 789 aa  60.8  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00670387  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3406  phosphoenolpyruvate synthase  29.41 
 
 		 798 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568849  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1972  phosphoenolpyruvate synthase  26.19 
 
 		 805 aa  60.5  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3469  phosphoenolpyruvate synthase  29.41 
 
 		 798 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.171038 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  21.77 
 
 		 758 aa  60.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2164  phosphoenolpyruvate synthase  27.31 
 
 		 812 aa  60.5  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.573318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3417  phosphoenolpyruvate synthase  29.41 
 
 		 798 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0963728  normal  0.277431 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  28.28 
 
 		 800 aa  60.1  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2072  phosphoenolpyruvate synthase  28.57 
 
 		 789 aa  60.1  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.908755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2422  phosphoenolpyruvate synthase  26.34 
 
 		 792 aa  59.3  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.052092 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0867  phosphoenolpyruvate synthase  24.12 
 
 		 795 aa  59.3  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.32 
 
 		 810 aa  59.3  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  25.41 
 
 		 793 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  23.64 
 
 		 809 aa  59.3  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  26.87 
 
 		 795 aa  58.9  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000263208  normal  0.0247077 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00922  phosphoenolpyruvate synthase  29.5 
 
 		 797 aa  58.9  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0899613  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  27.64 
 
 		 765 aa  58.9  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6481  phosphoenolpyruvate synthase  29.82 
 
 		 811 aa  58.5  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237379  normal  0.463412 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>