More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1108 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  100 
 
 
252 aa  511  1e-144  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  46.37 
 
 
260 aa  225  4e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  42.74 
 
 
255 aa  216  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  43.65 
 
 
248 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  42.8 
 
 
262 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 
252 aa  210  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  44.8 
 
 
252 aa  206  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  40.16 
 
 
250 aa  204  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  43.6 
 
 
257 aa  203  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  40.16 
 
 
253 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  39.36 
 
 
247 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  41.09 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  41.11 
 
 
258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  41.27 
 
 
248 aa  190  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3028  stationary phase survival protein SurE  38.95 
 
 
271 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  39.38 
 
 
270 aa  188  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  41.27 
 
 
248 aa  188  7e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  38.95 
 
 
281 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  38.95 
 
 
281 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  42 
 
 
253 aa  184  9e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  40.71 
 
 
258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  40.3 
 
 
265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  39.52 
 
 
252 aa  182  7e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  39.52 
 
 
252 aa  181  9.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0546  stationary-phase survival protein SurE  37.5 
 
 
254 aa  181  9.000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  37.75 
 
 
251 aa  181  9.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  40.24 
 
 
265 aa  181  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  37.79 
 
 
265 aa  179  2.9999999999999997e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  42.11 
 
 
255 aa  179  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  38.71 
 
 
255 aa  178  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  42.17 
 
 
259 aa  178  8e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  39.2 
 
 
247 aa  178  9e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  41.53 
 
 
259 aa  177  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  39.43 
 
 
255 aa  176  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0752  stationary-phase survival protein SurE  39.31 
 
 
262 aa  176  2e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00127492  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  39.36 
 
 
247 aa  176  4e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1163  stationary phase survival protein SurE  39.44 
 
 
252 aa  176  5e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3740  stationary-phase survival protein SurE  39.76 
 
 
280 aa  176  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.18688  normal  0.856186 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  40.16 
 
 
247 aa  175  5e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  38.34 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  34 
 
 
251 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  36.08 
 
 
260 aa  174  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  36.76 
 
 
258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  39.92 
 
 
264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1257  stationary-phase survival protein SurE  37.3 
 
 
251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.188641  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  38.78 
 
 
257 aa  172  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  38.02 
 
 
268 aa  171  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  37.25 
 
 
293 aa  169  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  36.22 
 
 
259 aa  169  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1500  stationary phase survival protein SurE  38.55 
 
 
246 aa  169  4e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  34.66 
 
 
257 aa  169  4e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  39.02 
 
 
251 aa  169  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  39.76 
 
 
245 aa  168  8e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  34.14 
 
 
259 aa  168  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  40.55 
 
 
258 aa  167  1e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  37.3 
 
 
255 aa  167  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1168  stationary phase survival protein SurE  36.84 
 
 
256 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.318456  normal  0.0991312 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0405  stationary-phase survival protein SurE  40.32 
 
 
244 aa  166  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  40.55 
 
 
258 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  38.4 
 
 
248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1491  stationary phase survival protein SurE  37.2 
 
 
257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1689  stationary phase survival protein SurE  37.05 
 
 
257 aa  165  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  36.14 
 
 
248 aa  166  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  34.54 
 
 
257 aa  165  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1365  stationary phase survival protein SurE  38.4 
 
 
269 aa  165  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1203  stationary-phase survival protein SurE  38.33 
 
 
244 aa  165  8e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.975594  normal  0.370587 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1299  stationary-phase survival protein SurE  38.04 
 
 
261 aa  165  8e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.108433  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  33.98 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3296  stationary phase survival protein SurE  37.6 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13151  stationary phase survival protein SurE  37.2 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.146893  normal  0.400321 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3428  stationary phase survival protein SurE  37.6 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0539534  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2160  stationary-phase survival protein SurE  39.42 
 
 
244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0961  stationary phase survival protein SurE  38.15 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2664  stationary phase survival protein SurE  36.18 
 
 
256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3031  stationary-phase survival protein SurE  37.21 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0877  stationary phase survival protein SurE  37.85 
 
 
266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0394814  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1536  stationary phase survival protein SurE  38.49 
 
 
264 aa  163  3e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  36.8 
 
 
250 aa  163  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  35.86 
 
 
259 aa  163  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  36.8 
 
 
250 aa  163  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1802  stationary phase survival protein SurE  36.11 
 
 
252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508883  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0199  stationary-phase survival protein SurE  40.68 
 
 
263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.231143  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0886  stationary phase survival protein SurE  37.75 
 
 
255 aa  162  6e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  36.58 
 
 
250 aa  162  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  33.86 
 
 
259 aa  162  7e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  36.9 
 
 
255 aa  162  7e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14561  stationary phase survival protein SurE  37.2 
 
 
269 aa  162  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.934406  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  34.27 
 
 
251 aa  161  9e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1252  stationary phase survival protein SurE  36.08 
 
 
257 aa  161  9e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0507055 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0721  stationary phase survival protein SurE  38.46 
 
 
273 aa  161  9e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14321  stationary phase survival protein SurE  37.2 
 
 
269 aa  161  9e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.34395  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2098  stationary phase survival protein SurE  38.15 
 
 
250 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  37.35 
 
 
249 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  35.18 
 
 
258 aa  161  1e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  37.35 
 
 
249 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0829  stationary phase survival protein SurE  35.2 
 
 
253 aa  161  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.200096 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  34.8 
 
 
254 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14701  stationary phase survival protein SurE  36.4 
 
 
269 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  37.35 
 
 
249 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  35.18 
 
 
258 aa  161  1e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>