More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0119 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  99.39 
 
 		 328 aa  663    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  667    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  57.91 
 
 		 337 aa  352  4e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  51.67 
 
 		 327 aa  349  4e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  51.06 
 
 		 326 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5777  hypothetical protein  45.33 
 
 		 334 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  42.53 
 
 		 334 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  41.53 
 
 		 345 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  42.58 
 
 		 366 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  44.11 
 
 		 325 aa  267  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  44.11 
 
 		 327 aa  266  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1607  hypothetical protein  40.33 
 
 		 333 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  44.11 
 
 		 322 aa  262  6.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  40.06 
 
 		 325 aa  261  8e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  41.28 
 
 		 328 aa  259  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  43.29 
 
 		 339 aa  258  9e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4752  twin-arginine translocation pathway signal  41.14 
 
 		 333 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417694  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  42.24 
 
 		 304 aa  257  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  40.67 
 
 		 325 aa  255  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  43.81 
 
 		 330 aa  255  9e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  43.81 
 
 		 330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  42.11 
 
 		 325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  40.59 
 
 		 335 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  41.75 
 
 		 325 aa  252  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  41.54 
 
 		 333 aa  252  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  40.78 
 
 		 335 aa  250  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  41.25 
 
 		 332 aa  251  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5492  hypothetical protein  42 
 
 		 329 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  40.91 
 
 		 322 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  41.06 
 
 		 332 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  43.29 
 
 		 328 aa  249  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  40.98 
 
 		 336 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  41.25 
 
 		 332 aa  249  5e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  42.62 
 
 		 327 aa  248  7e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  43.16 
 
 		 335 aa  248  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  42.95 
 
 		 331 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  40.66 
 
 		 330 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  40.66 
 
 		 330 aa  248  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  42.21 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  40.48 
 
 		 360 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  41.16 
 
 		 325 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  41.72 
 
 		 318 aa  246  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  42.86 
 
 		 349 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  41.1 
 
 		 333 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  39.62 
 
 		 314 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  41.95 
 
 		 323 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1918  hypothetical protein  41.59 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0693  hypothetical protein  40.4 
 
 		 320 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  42.25 
 
 		 334 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  40.26 
 
 		 330 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5277  hypothetical protein  42.95 
 
 		 327 aa  242  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  40.13 
 
 		 335 aa  242  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  43.77 
 
 		 341 aa  241  7.999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  41.19 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  38.41 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  38.93 
 
 		 331 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  38.84 
 
 		 328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  41.9 
 
 		 330 aa  239  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  40.74 
 
 		 327 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  41.95 
 
 		 324 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  38.06 
 
 		 327 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  39.73 
 
 		 321 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  42.18 
 
 		 338 aa  239  5e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  40.81 
 
 		 328 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  41.31 
 
 		 345 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  41.31 
 
 		 345 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  40.14 
 
 		 314 aa  238  6.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  40.13 
 
 		 321 aa  238  6.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  40.84 
 
 		 336 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  41.61 
 
 		 326 aa  238  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  40.2 
 
 		 331 aa  238  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5824  extra-cytoplasmic solute receptor  39.93 
 
 		 330 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  40.46 
 
 		 330 aa  237  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3697  hypothetical protein  41.69 
 
 		 334 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583429  normal  0.151066 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  40.2 
 
 		 331 aa  237  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  39.8 
 
 		 330 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  39.14 
 
 		 332 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  41.95 
 
 		 327 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  37.62 
 
 		 331 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  37.54 
 
 		 332 aa  236  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  42.04 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  43.43 
 
 		 339 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5887  hypothetical protein  40.74 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  40.19 
 
 		 323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  40.07 
 
 		 362 aa  233  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1021  hypothetical protein  37.99 
 
 		 323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.345353  normal  0.559311 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  39.38 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  36.03 
 
 		 328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  39.43 
 
 		 329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  37.77 
 
 		 328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3411  hypothetical protein  38.1 
 
 		 330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0125  hypothetical protein  41.69 
 
 		 331 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  38.73 
 
 		 327 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  35.69 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  38.82 
 
 		 332 aa  233  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  39.51 
 
 		 344 aa  233  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  41.18 
 
 		 325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  39.02 
 
 		 327 aa  232  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  38.32 
 
 		 346 aa  232  6e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  37 
 
 		 341 aa  232  6e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>