More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1989 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0903  citrate synthase  66.82 
 
 		 455 aa  644    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1989  citrate synthase  100 
 
 		 453 aa  934    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000399461  normal  0.147998 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3027  citrate synthase  70.5 
 
 		 456 aa  687    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000187967  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1122  citrate synthase  64.56 
 
 		 448 aa  585  1e-166  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3834  citrate synthase  62.41 
 
 		 457 aa  565  1e-160  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000081885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2571  citrate synthase  57.24 
 
 		 450 aa  542  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000324243  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2155  Citrate (Si)-synthase  50.93 
 
 		 441 aa  456  1e-127  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1100  citrate synthase  50.57 
 
 		 450 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28210  citrate synthase  48.13 
 
 		 445 aa  432  1e-120  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0102554  normal  0.648823 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0085  citrate synthase  48.15 
 
 		 448 aa  429  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.691353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12790  citrate synthase  48.82 
 
 		 451 aa  418  9.999999999999999e-116  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0027871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2696  Citrate (Si)-synthase  48.05 
 
 		 447 aa  402  1e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  37.13 
 
 		 383 aa  213  3.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.34 
 
 		 378 aa  209  9e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.63 
 
 		 385 aa  206  6e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.44 
 
 		 379 aa  205  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.13 
 
 		 397 aa  203  5e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.86 
 
 		 380 aa  202  8e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  36.31 
 
 		 378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  37.33 
 
 		 378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  35.54 
 
 		 386 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  35.54 
 
 		 386 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  35.68 
 
 		 381 aa  196  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2105  citrate (Si)-synthase  36.22 
 
 		 397 aa  196  8.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal  0.0115455 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  35.33 
 
 		 375 aa  196  9e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  35.38 
 
 		 381 aa  196  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  35.5 
 
 		 381 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  35.5 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.87 
 
 		 377 aa  194  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  35.33 
 
 		 375 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.97 
 
 		 387 aa  194  4e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35 
 
 		 377 aa  192  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.09 
 
 		 378 aa  192  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  34.68 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  34.78 
 
 		 389 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  30.5 
 
 		 395 aa  190  5e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  34.35 
 
 		 387 aa  190  5e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26921  citrate synthase  34.41 
 
 		 396 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0612  citrate synthase  36.31 
 
 		 386 aa  185  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.148892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.76 
 
 		 382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  34.96 
 
 		 378 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  35.17 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  35.33 
 
 		 382 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0715  citrate synthase  33.7 
 
 		 355 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.35 
 
 		 430 aa  182  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  35.05 
 
 		 382 aa  182  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  34.78 
 
 		 371 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  34.78 
 
 		 371 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  34.78 
 
 		 371 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  34.78 
 
 		 371 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  34.78 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  34.78 
 
 		 371 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2604  2-methylcitrate synthase  33.78 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121252  hitchhiker  0.000290432 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  34.78 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  32.63 
 
 		 373 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0924  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.11 
 
 		 379 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.96 
 
 		 382 aa  180  5.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3511  methylcitrate synthase  32.42 
 
 		 390 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.106101 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.6 
 
 		 382 aa  179  7e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.17 
 
 		 380 aa  179  8e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1586  methylcitrate synthase  34.15 
 
 		 385 aa  179  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000154256  normal  0.49975 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4141  methylcitrate synthase  32.54 
 
 		 379 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2141  Citrate (Si)-synthase  34.16 
 
 		 389 aa  179  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.636674  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  34.51 
 
 		 371 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.65 
 
 		 393 aa  178  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3946  methylcitrate synthase  32.54 
 
 		 375 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.93 
 
 		 379 aa  178  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4022  methylcitrate synthase  32.54 
 
 		 375 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3295  methylcitrate synthase  31.23 
 
 		 378 aa  177  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.85 
 
 		 390 aa  177  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2335  methylcitrate synthase  31.7 
 
 		 375 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218689  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  32.63 
 
 		 373 aa  177  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3435  methylcitrate synthase  31.7 
 
 		 375 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01089  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0463  methylcitrate synthase  34.96 
 
 		 389 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000165686  hitchhiker  0.000000131062 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0401  methylcitrate synthase  34.96 
 
 		 389 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.600733  hitchhiker  0.00000000076827 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0409  methylcitrate synthase  34.96 
 
 		 389 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000027346 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  32.63 
 
 		 373 aa  177  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4048  methylcitrate synthase  32.28 
 
 		 375 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0403  methylcitrate synthase  34.96 
 
 		 389 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3645  methylcitrate synthase  32.28 
 
 		 375 aa  176  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1111  methylcitrate synthase  32.61 
 
 		 379 aa  176  5e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  34.92 
 
 		 391 aa  176  5e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0421  methylcitrate synthase  34.96 
 
 		 389 aa  177  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0258062 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02396  methylcitrate synthase  32.43 
 
 		 380 aa  176  6e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1936  methylcitrate synthase  31.7 
 
 		 375 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686847  hitchhiker  0.000000858753 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0364  methylcitrate synthase  33.94 
 
 		 389 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1198  methylcitrate synthase  32.27 
 
 		 376 aa  176  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03371  methylcitrate synthase  32.08 
 
 		 373 aa  176  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2401  2-methylcitrate synthase  32.05 
 
 		 371 aa  176  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.612256  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0357  methylcitrate synthase  33.94 
 
 		 389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  30.96 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1776  methylcitrate synthase  31.47 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549839  hitchhiker  0.000461346 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003389  2-methylcitrate synthase  31.87 
 
 		 380 aa  174  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00287  2-methylcitrate synthase  34.22 
 
 		 389 aa  173  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0404  methylcitrate synthase  33.25 
 
 		 389 aa  173  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0398  methylcitrate synthase  34.22 
 
 		 389 aa  173  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00291  hypothetical protein  34.22 
 
 		 389 aa  173  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1310  methylcitrate synthase  32.33 
 
 		 375 aa  173  5e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2086  methylcitrate synthase  31.55 
 
 		 375 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440425  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3630  methylcitrate synthase  31.2 
 
 		 375 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>