More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4061 on replicon NC_009957
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  100 
 
 		 464 aa  948    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  100 
 
 		 464 aa  948    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  47.46 
 
 		 476 aa  415  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  37.9 
 
 		 434 aa  285  8e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  37.9 
 
 		 434 aa  285  8e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  38.56 
 
 		 460 aa  275  9e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1103  multicopper oxidase type 3  35.68 
 
 		 463 aa  251  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29261  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2186  multicopper oxidase type 3  34.64 
 
 		 508 aa  247  4e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0782192  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  37.56 
 
 		 456 aa  243  5e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1250  multicopper oxidase type 3  34.44 
 
 		 463 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.698191  normal  0.0374375 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1589  cu-oxidase multicopper oxidase protein  36.83 
 
 		 470 aa  239  5.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0800  multicopper oxidase type 3  36.76 
 
 		 466 aa  237  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  32.01 
 
 		 460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  32.22 
 
 		 460 aa  235  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  36.73 
 
 		 456 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7403  multicopper oxidase type 3  36.34 
 
 		 465 aa  229  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0857434  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  34.47 
 
 		 463 aa  229  9e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  34.84 
 
 		 461 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  34.47 
 
 		 463 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  33.87 
 
 		 460 aa  224  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  34.45 
 
 		 459 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  34.45 
 
 		 468 aa  223  7e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  33.56 
 
 		 460 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  31.96 
 
 		 437 aa  217  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2677  multicopper oxidase type 3  34.38 
 
 		 479 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5132  multicopper oxidase type 3  34.94 
 
 		 498 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217654  normal  0.660003 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2414  multicopper oxidase type 3  34.15 
 
 		 479 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6581  multicopper oxidase type 3  36.63 
 
 		 478 aa  211  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  33.25 
 
 		 457 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  33.09 
 
 		 457 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2911  multicopper oxidase type 3  32.42 
 
 		 466 aa  208  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  30.27 
 
 		 527 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2369  multicopper oxidase type 3  34.82 
 
 		 500 aa  207  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  28.41 
 
 		 549 aa  195  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  28.94 
 
 		 544 aa  194  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  28.81 
 
 		 546 aa  193  6e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  29.08 
 
 		 546 aa  192  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  27.72 
 
 		 551 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  27.72 
 
 		 551 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  32.86 
 
 		 478 aa  187  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  27.14 
 
 		 554 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  27.14 
 
 		 554 aa  186  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  27.92 
 
 		 551 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  31 
 
 		 477 aa  179  7e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  32.13 
 
 		 511 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  30.5 
 
 		 508 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3196  multicopper oxidase type 2  32 
 
 		 490 aa  170  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.58855  normal  0.965559 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  30.07 
 
 		 489 aa  169  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  31.29 
 
 		 551 aa  166  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  30.68 
 
 		 504 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  28.45 
 
 		 565 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2925  multicopper oxidase, type 3  29.58 
 
 		 536 aa  159  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455185  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  29.57 
 
 		 521 aa  156  7e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  28.57 
 
 		 521 aa  156  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  28.14 
 
 		 498 aa  155  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2296  L-ascorbate oxidase  26.41 
 
 		 705 aa  154  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000773884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  28.38 
 
 		 521 aa  154  5e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1136  multicopper oxidase type 3  26.16 
 
 		 535 aa  153  8e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0174058 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3169  multicopper oxidase type 3  29.64 
 
 		 513 aa  150  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5307  multicopper oxidase, type 2  27.84 
 
 		 518 aa  150  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117713  normal  0.384729 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5702  multicopper oxidase, type 2  27.84 
 
 		 518 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.672954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  31.28 
 
 		 592 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  28.76 
 
 		 506 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  27.67 
 
 		 522 aa  145  2e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  27.07 
 
 		 464 aa  143  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0317  hypothetical protein  27.03 
 
 		 513 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  27.92 
 
 		 513 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  27.36 
 
 		 513 aa  140  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  31.49 
 
 		 533 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  33.89 
 
 		 457 aa  138  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0339  hypothetical protein  27.57 
 
 		 515 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  29.3 
 
 		 496 aa  136  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1040  multicopper oxidase type 3  34.16 
 
 		 609 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172495  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  35.53 
 
 		 373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  27.31 
 
 		 514 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  29.7 
 
 		 535 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  29.7 
 
 		 535 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  30.3 
 
 		 535 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0697  copper-resistance protein CopA  25.31 
 
 		 568 aa  133  6.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0072  multicopper oxidase domain-containing protein  32.51 
 
 		 630 aa  133  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.14066 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.76 
 
 		 586 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.76 
 
 		 536 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.76 
 
 		 536 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.76 
 
 		 536 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  30.4 
 
 		 531 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  29.55 
 
 		 535 aa  131  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0800  copper resistance protein B  24.29 
 
 		 803 aa  130  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  29.55 
 
 		 536 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  29.55 
 
 		 536 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  30.53 
 
 		 532 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  32.64 
 
 		 505 aa  130  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2282  multicopper oxidase  35.43 
 
 		 459 aa  130  6e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  30.63 
 
 		 591 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  28.68 
 
 		 490 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2455  multicopper oxidase type 3  36.09 
 
 		 359 aa  127  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  32.72 
 
 		 664 aa  127  6e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  28.84 
 
 		 492 aa  126  8.000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1969  copper-resistance protein, CopA family protein  27.62 
 
 		 657 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1591  copper-resistance protein CopA  26.08 
 
 		 568 aa  125  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.336299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.17 
 
 		 579 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>