61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4008 on replicon NC_009957
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009955  Dshi_3699  putative methylase/helicase  91.15 
 
 		 836 aa  1500    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0108  hypothetical protein  47.27 
 
 		 1440 aa  655    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4008  putative methylase/helicase  100 
 
 		 836 aa  1698    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.621017  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3850  putative methylase/helicase  44.44 
 
 		 1536 aa  654    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.829414 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2208  putative methylase/helicase  49.88 
 
 		 1413 aa  681    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2494  putative methylase/helicase  44.1 
 
 		 1529 aa  649    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.207281 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1475  putative methylase/helicase  48.48 
 
 		 1435 aa  636    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3174  methylase/helicase  47.36 
 
 		 1451 aa  636    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0441  putative methylase/helicase  48.71 
 
 		 824 aa  661    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.683443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2784  putative methylase/helicase  46.96 
 
 		 1440 aa  641    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.847517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0535  methylase/helicase  47.28 
 
 		 1444 aa  653    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7413  putative methylase/helicase  47.89 
 
 		 1444 aa  654    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.741196  normal  0.925564 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6191  putative methylase/helicase  45.61 
 
 		 1463 aa  652    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.255382  hitchhiker  0.00747336 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3026  methylase/helicase  47.36 
 
 		 1447 aa  634  1e-180  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5265  putative methylase/helicase  47.71 
 
 		 1412 aa  632  1e-179  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2652  methylase/helicase  48.22 
 
 		 1396 aa  630  1e-179  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0582946 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0377  putative methylase/helicase  47.32 
 
 		 1459 aa  629  1e-179  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.27856  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3828  methylase/helicase  46.4 
 
 		 1449 aa  625  1e-178  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3566  methylase/helicase  46.58 
 
 		 1455 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3065  probably methylase/helicase  45.88 
 
 		 1448 aa  624  1e-177  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0720  putative methylase/helicase  47.36 
 
 		 1440 aa  624  1e-177  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.649111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2128  methylase/helicase  46.35 
 
 		 1446 aa  620  1e-176  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3334  putative methylase/helicase  46.11 
 
 		 1437 aa  613  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0476558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1218  putative methylase/helicase  46.83 
 
 		 1439 aa  615  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3517  putative methylase/helicase  46.83 
 
 		 1439 aa  615  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.646689  normal  0.782963 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7717  putative methylase/helicase  46.56 
 
 		 1474 aa  610  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.256661 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3919  methylase/helicase  46.36 
 
 		 1459 aa  612  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5567  probably methylase/helicase  46.79 
 
 		 1458 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.368773  normal  0.186844 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1533  methylase/helicase  45.35 
 
 		 1440 aa  604  1.0000000000000001e-171  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0293999 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4155  putative methylase/helicase  45.05 
 
 		 1498 aa  602  1e-170  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3921  hypothetical protein  46.12 
 
 		 1425 aa  598  1e-169  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5206  putative methylase/helicase  45.02 
 
 		 1414 aa  566  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5352  methylase/helicase  44.88 
 
 		 1421 aa  535  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.686845 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4601  putative methylase/helicase  40.53 
 
 		 684 aa  320  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4223  putative methylase/helicase  56.08 
 
 		 896 aa  317  4e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.233912  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40550  predicted protein  33.81 
 
 		 950 aa  207  6e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30868  predicted protein  32.03 
 
 		 1487 aa  189  3e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.186936  normal  0.423198 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3082  hypothetical protein  36.21 
 
 		 515 aa  171  6e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4470  hypothetical protein  46.24 
 
 		 397 aa  89  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3582  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  35.86 
 
 		 254 aa  87.8  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  32.4 
 
 		 557 aa  66.2  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5392  helicase domain protein  31.31 
 
 		 2123 aa  62  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3619  methyltransferase type 11  31.87 
 
 		 450 aa  59.7  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  25.23 
 
 		 660 aa  56.2  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  31.32 
 
 		 449 aa  56.2  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0222  hypothetical protein  34.78 
 
 		 451 aa  55.5  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.791587 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4206  methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 658 aa  55.1  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000155925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4148  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  29.69 
 
 		 481 aa  52.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.948867  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  30.05 
 
 		 569 aa  52  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7298  DNA restriction methylase  31.87 
 
 		 548 aa  51.2  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000885633  unclonable  0.0000166631 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0003  helicase. putatve  22.24 
 
 		 2133 aa  50.8  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0073  DNA-methyltransferase-like  28.57 
 
 		 313 aa  50.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.648628 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4362  hypothetical protein  28.33 
 
 		 520 aa  50.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0058  hypothetical protein  30.2 
 
 		 187 aa  48.1  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.546148 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  25.35 
 
 		 481 aa  47  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0063  hypothetical protein  30.2 
 
 		 187 aa  47  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.387558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0032  hypothetical protein  29.53 
 
 		 187 aa  46.6  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  25.82 
 
 		 477 aa  45.8  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3534  EcoEI R domain-containing protein  24.88 
 
 		 481 aa  45.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0122101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3099  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  31.5 
 
 		 365 aa  44.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1845  methyltransferase small  35.51 
 
 		 203 aa  44.7  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>