283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1724 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1724  putative segregation and condensation protein B  100 
 
 		 229 aa  459  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.507959 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0907  condensin subunit ScpB  72.97 
 
 		 226 aa  322  3e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2939  condensin subunit ScpB  74.88 
 
 		 211 aa  317  7e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0906  putative transcriptional regulator  76.33 
 
 		 211 aa  317  7e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.195503  normal  0.0577759 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1584  putative transcriptional regulator  74.4 
 
 		 211 aa  315  5e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459505  normal  0.153015 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1511  condensin subunit ScpB  68.28 
 
 		 228 aa  298  4e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.340191 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1866  putative transcriptional regulator  70.59 
 
 		 221 aa  278  7e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00902439  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4418  condensin subunit ScpB  60.12 
 
 		 385 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2346  putative transcriptional regulator  56.85 
 
 		 242 aa  201  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.840999  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0881  segregation and condensation protein B  61.31 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0872  segregation and condensation protein B  61.31 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1803  chromosome segregation and condensation protein ScpB  59.64 
 
 		 248 aa  195  5.000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2746  putative transcriptional regulator  57.99 
 
 		 358 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407346  normal  0.450252 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2791  chromosome segregation and condensation protein ScpB  57.99 
 
 		 389 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00825116  normal  0.0347442 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3190  segregation and condensation protein B  59.01 
 
 		 432 aa  194  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2512  putative transcriptional regulator  57.14 
 
 		 256 aa  194  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.915644  normal  0.474436 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1162  putative transcriptional regulator  52.75 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170122  normal  0.285603 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1762  putative transcriptional regulator  59.64 
 
 		 248 aa  192  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1774  condensin subunit ScpB  50.96 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1808  condensin subunit ScpB  51.21 
 
 		 244 aa  186  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3026  putative transcriptional regulator  57.56 
 
 		 260 aa  185  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4409  putative transcriptional regulator  50.79 
 
 		 242 aa  182  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0902178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1093  condensin subunit ScpB  52.41 
 
 		 215 aa  179  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2182  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  50.45 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1684  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  53.93 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2670  hypothetical protein  54.92 
 
 		 238 aa  171  7.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.801978  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1486  segregation and condensation protein B  53.4 
 
 		 238 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.723984 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0498  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  54.17 
 
 		 254 aa  168  5e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338231 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3120  segregation and condensation protein B  53.12 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.121299  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1142  putative transcriptional regulator  48.22 
 
 		 197 aa  164  6.9999999999999995e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1910  condensin subunit ScpB  57.74 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.954587 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2707  segregation and condensation protein B  44.44 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  51.88 
 
 		 185 aa  156  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3931  condensin subunit ScpB  54.93 
 
 		 195 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2484  segregation and condensation protein B  55.95 
 
 		 218 aa  151  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.429481  normal  0.0103264 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0440  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.24 
 
 		 231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.93 
 
 		 197 aa  125  7e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.29 
 
 		 228 aa  121  7e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  35.53 
 
 		 206 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  38.69 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2690  segregation and condensation protein B  39.88 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  36.9 
 
 		 198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00872  segregation and condensation protein B, putative  39.57 
 
 		 399 aa  115  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  34.13 
 
 		 352 aa  115  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1555  segregation and condensation protein B  37.31 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00574498  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1611  putative transcriptional regulator  37.31 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499077  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  38.18 
 
 		 209 aa  113  3e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  38.18 
 
 		 209 aa  111  7.000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  35.76 
 
 		 245 aa  111  9e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  38.75 
 
 		 184 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3583  hypothetical protein  38.69 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.809895  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  34.48 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  36.56 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1415  putative transcriptional regulator  37.21 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1813  conserved hypothetical protein TIGR00281  38.69 
 
 		 257 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.14 
 
 		 534 aa  109  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  35.19 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  33.51 
 
 		 198 aa  108  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  38.51 
 
 		 360 aa  108  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  33.51 
 
 		 198 aa  109  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  33.51 
 
 		 198 aa  109  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  33.51 
 
 		 198 aa  109  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  38.36 
 
 		 349 aa  108  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  35.83 
 
 		 458 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  36.63 
 
 		 256 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  37.21 
 
 		 277 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  41.51 
 
 		 243 aa  108  9.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  36.63 
 
 		 259 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1490  condensin subunit ScpB  36.9 
 
 		 337 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2824  condensin subunit ScpB  37.89 
 
 		 408 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  35.83 
 
 		 442 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  37.74 
 
 		 340 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  35.83 
 
 		 442 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  35.83 
 
 		 442 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  35.83 
 
 		 456 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  37.74 
 
 		 343 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  35.83 
 
 		 442 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  37.74 
 
 		 345 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  37.74 
 
 		 345 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  37.74 
 
 		 340 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  32.99 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2002  condensin subunit ScpB  37.7 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0508753  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  37.74 
 
 		 345 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  35.83 
 
 		 198 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  35.83 
 
 		 455 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.68 
 
 		 198 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1418  condensin subunit ScpB  38.79 
 
 		 274 aa  106  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  35.83 
 
 		 456 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  33.68 
 
 		 198 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  33.68 
 
 		 198 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  35.76 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.77 
 
 		 269 aa  105  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1084  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.79 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  35.15 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1164  condensin subunit ScpB  38.79 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  39.77 
 
 		 195 aa  105  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  39.33 
 
 		 201 aa  105  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1628  segregation and condensation protein B  37.27 
 
 		 394 aa  104  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189744  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1206  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.57 
 
 		 389 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0850  condensin subunit ScpB  37.29 
 
 		 287 aa  104  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0321676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>