261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0612 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0612  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 305 aa  619  1e-176  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0799  hypothetical protein  64.26 
 
 		 309 aa  358  8e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2457  beta-lactamase domain-containing protein  64.26 
 
 		 307 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.047493 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0380  beta-lactamase domain-containing protein  61.72 
 
 		 306 aa  351  8e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  56.23 
 
 		 312 aa  316  4e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  55.56 
 
 		 311 aa  311  7.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  47.96 
 
 		 326 aa  289  4e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  46.18 
 
 		 293 aa  269  5e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  47.16 
 
 		 330 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  44.63 
 
 		 312 aa  266  2.9999999999999995e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  45.49 
 
 		 330 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  44.48 
 
 		 333 aa  259  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  43.19 
 
 		 331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  37.28 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  34.7 
 
 		 329 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  33.22 
 
 		 315 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  33.92 
 
 		 330 aa  158  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  32.69 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  34.88 
 
 		 304 aa  152  8e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  35.41 
 
 		 329 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  31.33 
 
 		 327 aa  149  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  34.13 
 
 		 332 aa  149  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2767  beta-lactamase domain protein  31.89 
 
 		 329 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  36.3 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  33.02 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  31.88 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  31.76 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  31.8 
 
 		 326 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  32.41 
 
 		 315 aa  142  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  30.1 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  30.74 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  30.65 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  31.83 
 
 		 329 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  29.87 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  32.67 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 342 aa  135  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  32.48 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  32.26 
 
 		 322 aa  133  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  32.88 
 
 		 332 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  30.46 
 
 		 324 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  28.75 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  35.77 
 
 		 303 aa  130  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 		 327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  31.38 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  30.31 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  32.97 
 
 		 293 aa  124  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  29.97 
 
 		 335 aa  121  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  30.96 
 
 		 351 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  29.97 
 
 		 334 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  27.49 
 
 		 321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  31.89 
 
 		 328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 		 321 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  29.04 
 
 		 329 aa  119  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  32.16 
 
 		 322 aa  119  7e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  33.45 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  30.55 
 
 		 339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4163  beta-lactamase domain protein  30.68 
 
 		 316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  27.24 
 
 		 324 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  29.93 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  29.41 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  32.72 
 
 		 290 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  29.47 
 
 		 320 aa  112  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  31.22 
 
 		 277 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  33.64 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7585  beta-lactamase domain-containing protein  33.75 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  29.13 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  30.16 
 
 		 315 aa  109  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  29.12 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4084  beta-lactamase-like  34.57 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  29.51 
 
 		 329 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  28.44 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  32.74 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  31.1 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  28.66 
 
 		 344 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  30.77 
 
 		 326 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  28.52 
 
 		 332 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  27.24 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  31.25 
 
 		 348 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 		 348 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1208  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.1 
 
 		 287 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  29 
 
 		 341 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  31.42 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  27.97 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2457  beta-lactamase-like  32.56 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4233  Beta-lactamase-like  33.51 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  30.92 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1157  beta-lactamase domain protein  28.03 
 
 		 279 aa  99.8  5e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062155 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  30.16 
 
 		 318 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  28.67 
 
 		 302 aa  99.4  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1402  glyoxalase II  33.75 
 
 		 277 aa  99  9e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.701553  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4911  beta-lactamase domain protein  31.65 
 
 		 282 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136206  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  27.99 
 
 		 279 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1412  beta-lactamase domain protein  29.14 
 
 		 278 aa  98.2  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270255  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5423  beta-lactamase domain protein  33.69 
 
 		 295 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  28.07 
 
 		 322 aa  97.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  32.84 
 
 		 287 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0118  beta-lactamase-like protein  26.57 
 
 		 339 aa  95.9  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  27.18 
 
 		 305 aa  95.5  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>