102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4220 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4220  FMN-binding domain protein  100 
 
 		 480 aa  984    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416896  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2342  FMN-binding domain protein  46.42 
 
 		 453 aa  359  8e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.607847  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0694  FMN-binding domain protein  33.69 
 
 		 391 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1638  FMN-binding domain protein  30.34 
 
 		 373 aa  194  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000487572  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0738  FMN-binding domain protein  32.74 
 
 		 392 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000701173  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1598  transcriptional regulator, putative  31.48 
 
 		 396 aa  178  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00672193  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1289  membrane-bound regulatory protein  28.42 
 
 		 389 aa  176  8e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0717  FMN-binding domain protein  32.49 
 
 		 393 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1480  membrane bound regulatory protein, VcrC-like protein  31.47 
 
 		 399 aa  173  5e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1344  hypothetical protein  31.03 
 
 		 383 aa  169  8e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.024992  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3767  sulfite reductase alpha subunit (flavoprotein)-like protein  34.95 
 
 		 969 aa  166  9e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0237  transcriptional regulator, putative  28.82 
 
 		 406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.130282  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0698  FMN-binding domain protein  28.92 
 
 		 360 aa  158  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.911747  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  27.79 
 
 		 572 aa  154  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1479  membrane bound regulatory protein, VcrC-like protein  27.66 
 
 		 397 aa  153  5e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00732489  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1343  FMN-binding domain-containing protein  27.91 
 
 		 397 aa  152  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000579258  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1596  transcriptional regulator, putative  26.46 
 
 		 397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000252282  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2869  FMN-binding domain protein  23.96 
 
 		 382 aa  133  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00242086  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1623  membrane bound regulatory protein, putative  30.49 
 
 		 396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2622  FMN-binding domain protein  25.89 
 
 		 321 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2105  hypothetical protein  28.92 
 
 		 408 aa  97.1  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_881  NapH protein  29.24 
 
 		 480 aa  80.9  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2253  FMN-binding domain-containing protein  27.04 
 
 		 703 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3399  FMN-binding domain-containing protein  29.26 
 
 		 713 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.360952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3079  FMN-binding domain-containing protein  27.59 
 
 		 714 aa  67  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0078  regulator of nitric oxide reductase transcription  30.26 
 
 		 625 aa  65.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.196865 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1429  FMN-binding domain-containing protein  27.4 
 
 		 708 aa  63.9  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.865866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2317  regulatory protein nosR, putative  30.94 
 
 		 713 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.980481  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1739  regulatory protein NosR  25.13 
 
 		 715 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0987  regulatory protein nosR, putative  30.94 
 
 		 710 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.375953  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2263  transcription regulator NosR  30.94 
 
 		 710 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2068  regulatory protein NosR  30.94 
 
 		 710 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.927633  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2123  regulatory protein NosR  30.94 
 
 		 710 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156749  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0427  FMN-binding  28.24 
 
 		 764 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.653996  normal  0.802121 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20230  regulatory protein NosR  25.13 
 
 		 715 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578726 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4731  putative transcriptional regulator NosR  27.51 
 
 		 719 aa  61.6  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2220  FMN-binding  26.21 
 
 		 716 aa  61.6  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000053417  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0686  regulator of nitric oxide reductase transcription  30.18 
 
 		 696 aa  59.3  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0382945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2350  FMN-binding domain protein  27.75 
 
 		 764 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0274  transcriptional regulator NosR, putative  30.06 
 
 		 787 aa  58.9  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.288385  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3141  FMN-binding  26.64 
 
 		 752 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2486  FMN-binding domain-containing protein  28.18 
 
 		 681 aa  58.9  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.821812 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4347  FMN-binding domain-containing protein  29.31 
 
 		 788 aa  58.9  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0250  putative transcriptional regulator NosR  30.23 
 
 		 763 aa  58.5  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3181  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  31.54 
 
 		 687 aa  57.8  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.333663  normal  0.835049 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1390  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  28.79 
 
 		 884 aa  57  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0166  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.72 
 
 		 290 aa  57  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1482  FMN-binding domain-containing protein  24.64 
 
 		 886 aa  57  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2339  FMN-binding domain protein  22.96 
 
 		 638 aa  57  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4220  FMN-binding domain-containing protein  23.32 
 
 		 726 aa  56.2  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3961  regulatory protein, putative  27.59 
 
 		 743 aa  56.2  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857472 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1138  FMN-binding domain-containing protein  28.32 
 
 		 873 aa  56.2  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599326  normal  0.568737 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3193  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  28.9 
 
 		 728 aa  56.2  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0663  nitrous oxide expression regulator, NosR  28.23 
 
 		 727 aa  56.2  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342407  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.73 
 
 		 368 aa  55.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1059  FMN-binding domain protein  28.32 
 
 		 873 aa  55.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602709  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0697  FMN-binding domain protein  29.31 
 
 		 201 aa  55.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.820437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1073  FMN-binding domain-containing protein  25.43 
 
 		 712 aa  54.3  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.537433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.53 
 
 		 580 aa  54.3  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2563  FMN-binding domain protein  26.54 
 
 		 714 aa  54.3  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.132297  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2637  FMN-binding domain-containing protein  30.32 
 
 		 758 aa  53.9  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3198  FMN-binding  25.93 
 
 		 897 aa  53.9  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2862  FMN-binding domain-containing protein  27.65 
 
 		 749 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1873  FMN-binding  27.03 
 
 		 692 aa  53.5  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4916  putative transmembrane regulatory protein nosR  27.48 
 
 		 872 aa  52.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666033 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0601  aminoglycoside phosphotransferase-like protein  29.27 
 
 		 431 aa  53.1  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0545044 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1369  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  27.41 
 
 		 872 aa  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1884  putative regulatory protein NosR  35.23 
 
 		 715 aa  52.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4060  FMN-binding domain protein  28.26 
 
 		 887 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4172  nitrous oxide expression regulator, NosR  28.26 
 
 		 887 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1535  FMN-binding domain protein  28.57 
 
 		 704 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1206  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.45 
 
 		 260 aa  51.2  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2067  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.23 
 
 		 247 aa  50.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0194  ferredoxin-type protein (NapH)  22.51 
 
 		 233 aa  50.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.728865  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4868  FMN-binding domain protein  28.57 
 
 		 701 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153246  normal  0.0739563 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.68 
 
 		 233 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310265  normal  0.576374 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1516  quinol dehydrogenase membrane component  31.54 
 
 		 275 aa  48.5  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000106423  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0496  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.32 
 
 		 177 aa  48.9  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00037002  hitchhiker  0.000327646 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6246  nitrous oxide expression regulator, NosR  29.85 
 
 		 702 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6007  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  27.22 
 
 		 764 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0978  FMN-binding domain protein  29.07 
 
 		 185 aa  47.8  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224949 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0261  NADH:ubiquinone oxidoreductase, RnfG subunit-like  27.37 
 
 		 201 aa  47.4  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0216  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  27.27 
 
 		 334 aa  47  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.417368  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1334  FMN-binding domain-containing protein  28 
 
 		 705 aa  47  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.461369 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3838  quinol dehydrogenase membrane component  31.06 
 
 		 301 aa  46.6  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.497942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0886  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.87 
 
 		 233 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1228  4Fe-4S binding domain protein  27.54 
 
 		 357 aa  45.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3506  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.47 
 
 		 243 aa  45.1  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.98 
 
 		 444 aa  45.1  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2414  FMN-binding domain-containing protein  27.2 
 
 		 699 aa  44.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0642  Polyferredoxin-like protein  29.77 
 
 		 290 aa  44.7  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000712923  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0956  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.81 
 
 		 229 aa  44.3  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0798  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.18 
 
 		 356 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.223587  hitchhiker  0.00276018 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.6 
 
 		 368 aa  44.3  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0573677  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.81 
 
 		 357 aa  43.9  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3163  quinol dehydrogenase membrane component  30.71 
 
 		 302 aa  43.9  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.99 
 
 		 357 aa  43.9  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.31548 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2322  4Fe-4S binding domain protein  26.99 
 
 		 357 aa  43.9  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0668  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  23.81 
 
 		 300 aa  43.5  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.236876  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0576  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.85 
 
 		 258 aa  43.5  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>