86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3304 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3304  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 353 aa  738    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1677  Fe-S oxidoreductases-like protein  35.01 
 
 		 349 aa  192  6e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  24.07 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1618  radical SAM domain-containing protein  21.56 
 
 		 472 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.35939  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  25.73 
 
 		 468 aa  62.4  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7109  Fe-S oxidoreductase  22.57 
 
 		 703 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345593  normal  0.70276 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  22.81 
 
 		 501 aa  60.5  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1914  Radical SAM domain protein  22.29 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  22.66 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4243  Radical SAM domain protein  22.64 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  22.64 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1356  radical SAM superfamily protein  27.85 
 
 		 439 aa  56.2  0.0000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0234183  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  22.6 
 
 		 391 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  23.29 
 
 		 401 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  23.29 
 
 		 401 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  23.29 
 
 		 401 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  24.47 
 
 		 333 aa  53.9  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  20.71 
 
 		 379 aa  53.1  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  23.34 
 
 		 335 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  21.12 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2953  Radical SAM domain protein  22.93 
 
 		 439 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2688  Radical SAM domain protein  21.63 
 
 		 423 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  20.06 
 
 		 405 aa  50.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3415  Radical SAM domain protein  21.63 
 
 		 423 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1217  Radical SAM domain protein  25.71 
 
 		 343 aa  49.7  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0163769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  19.87 
 
 		 396 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  20 
 
 		 479 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  21.61 
 
 		 332 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  25.11 
 
 		 565 aa  48.9  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1728  hypothetical protein  19.94 
 
 		 491 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  22.08 
 
 		 330 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1154  radical SAM domain-containing protein  22.84 
 
 		 377 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.812273  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  20.19 
 
 		 395 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1031  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.23 
 
 		 338 aa  47.8  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  21.36 
 
 		 446 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 		 459 aa  47.8  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  24.48 
 
 		 445 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  22.8 
 
 		 366 aa  47  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  21.61 
 
 		 380 aa  47  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  18.93 
 
 		 427 aa  47  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  21.3 
 
 		 429 aa  46.6  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.29 
 
 		 308 aa  46.6  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2919  Fe-S oxidoreductases  19.61 
 
 		 293 aa  46.6  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  19.8 
 
 		 319 aa  46.2  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  21.7 
 
 		 412 aa  46.2  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  20.97 
 
 		 491 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0426  Radical SAM domain protein  21.23 
 
 		 420 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  20.97 
 
 		 491 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  20.63 
 
 		 496 aa  45.4  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3490  Radical SAM domain protein  20.39 
 
 		 346 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  20.97 
 
 		 491 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  20.97 
 
 		 491 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  20.97 
 
 		 491 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  20.97 
 
 		 491 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3820  Radical SAM domain protein  23.38 
 
 		 515 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2664  radical SAM family protein  21.94 
 
 		 383 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.293501 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  19.68 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1300  Radical SAM domain protein  35.82 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.696652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  31.76 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1844  Radical SAM domain protein  21.46 
 
 		 453 aa  45.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115714  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4523  Radical SAM domain protein  25.21 
 
 		 347 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5552  radical SAM domain-containing protein  20.62 
 
 		 482 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.789613 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1348  Radical SAM domain protein  23.21 
 
 		 322 aa  45.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1860  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.37 
 
 		 326 aa  45.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.310247  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2198  radical SAM domain-containing protein  23.14 
 
 		 373 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0314345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5901  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  22.45 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.630073 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  21.23 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3569  radical SAM domain-containing protein  20.8 
 
 		 365 aa  44.3  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  20.25 
 
 		 330 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  20.67 
 
 		 491 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  29.76 
 
 		 332 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2359  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  20 
 
 		 378 aa  44.3  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2660  Fe-S oxidoreductase, putative coenzyme synthesis protein  33.33 
 
 		 344 aa  44.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  23.84 
 
 		 390 aa  44.3  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  19.56 
 
 		 410 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  20.06 
 
 		 491 aa  44.3  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38780  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  17.96 
 
 		 381 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5162  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  20.18 
 
 		 379 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426022 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2766  radical SAM family Fe-S protein  25.29 
 
 		 340 aa  43.5  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  21.33 
 
 		 380 aa  43.5  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1880  Radical SAM domain protein  30.43 
 
 		 359 aa  43.1  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  20.24 
 
 		 379 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.384282  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5119  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  20.24 
 
 		 379 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 361 aa  43.1  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6168  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  20.56 
 
 		 374 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0169631  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0509  coenzyme PQQ synthesis protein E  19.41 
 
 		 389 aa  42.7  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>