61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1300 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1300  Radical SAM domain protein  100 
 
 
326 aa  681    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.696652  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1943  Radical SAM domain protein  26.19 
 
 
315 aa  122  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.227047  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  22.4 
 
 
332 aa  65.9  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  27.89 
 
 
367 aa  60.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  29.34 
 
 
468 aa  58.2  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2225  Radical SAM domain protein  27.54 
 
 
286 aa  54.3  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  26.77 
 
 
340 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  25.7 
 
 
339 aa  53.5  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3080  Radical SAM domain protein  25.85 
 
 
351 aa  52  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  20.62 
 
 
384 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3304  Radical SAM domain protein  32.61 
 
 
353 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  24.03 
 
 
340 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1677  Fe-S oxidoreductases-like protein  27.21 
 
 
349 aa  50.4  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0182  radical SAM family protein  27.27 
 
 
369 aa  49.3  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2164  radical SAM domain-containing protein  25.15 
 
 
349 aa  49.3  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.295283  normal  0.13164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  24.03 
 
 
341 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  23.36 
 
 
332 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  26.52 
 
 
329 aa  48.9  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2056  Radical SAM domain protein  29.1 
 
 
340 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  26.25 
 
 
396 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1381  radical SAM domain-containing protein  30.63 
 
 
345 aa  47.8  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7109  Fe-S oxidoreductase  22.59 
 
 
703 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345593  normal  0.70276 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  25.18 
 
 
355 aa  47  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2754  radical SAM domain-containing protein  23.23 
 
 
332 aa  47  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  25.56 
 
 
391 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3345  radical SAM domain-containing protein  21.51 
 
 
338 aa  46.2  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4391  Radical SAM domain protein  25.79 
 
 
327 aa  46.2  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  26.77 
 
 
410 aa  46.2  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  26.83 
 
 
446 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3973  radical SAM domain-containing protein  30.49 
 
 
292 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3820  Radical SAM domain protein  21.55 
 
 
515 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  23.28 
 
 
372 aa  45.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5580  hypothetical protein  29.27 
 
 
292 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5552  hypothetical protein  29.27 
 
 
292 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.05586e-17 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2227  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.14 
 
 
271 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5311  hypothetical protein  29.27 
 
 
292 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5642  hypothetical protein  29.27 
 
 
292 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00436698  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5707  hypothetical protein  29.27 
 
 
292 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5153  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  29.27 
 
 
292 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.120302  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5251  radical SAM domain-containing protein  29.27 
 
 
292 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5139  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  29.27 
 
 
292 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.219844  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5597  hypothetical protein  29.27 
 
 
292 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  24.14 
 
 
303 aa  44.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04330  Radical SAM domain protein  21.91 
 
 
336 aa  44.3  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4175  Radical SAM domain protein  26.9 
 
 
342 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0808  Radical SAM domain protein  27.91 
 
 
359 aa  44.3  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  25.49 
 
 
401 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  25.49 
 
 
401 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  25.49 
 
 
401 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4120  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.52 
 
 
326 aa  43.9  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0188  radical SAM family protein  30.59 
 
 
279 aa  43.9  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2743  radical SAM family protein  24.32 
 
 
335 aa  43.5  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  25.15 
 
 
351 aa  43.1  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  27.51 
 
 
429 aa  43.5  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1877  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.06 
 
 
329 aa  43.1  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0135  Radical SAM domain protein  28.92 
 
 
369 aa  42.7  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000054409  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4243  Radical SAM domain protein  23.08 
 
 
360 aa  42.7  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  23.86 
 
 
434 aa  42.7  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  20.47 
 
 
335 aa  42.7  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2991  Radical SAM domain protein  26.24 
 
 
397 aa  42.7  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  22.02 
 
 
459 aa  42.7  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>