225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2924 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2924  sporulation integral membrane protein YtvI  100 
 
 
354 aa  687    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000157456  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0985  sporulation integral membrane protein YtvI  36.31 
 
 
341 aa  186  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3280  sporulation integral membrane protein YtvI  31.82 
 
 
372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4711  sporulation integral membrane protein YtvI  31.52 
 
 
372 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000506038 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4727  hypothetical protein  31.7 
 
 
365 aa  160  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4325  permease  31.52 
 
 
372 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4337  permease  31.52 
 
 
372 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4722  sporulation integral membrane protein YtvI  31.52 
 
 
372 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2466  sporulation integral membrane protein YtvI  37.35 
 
 
343 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.180742  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4490  hypothetical protein  31.52 
 
 
372 aa  159  8e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0811913  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4841  hypothetical protein  31.52 
 
 
365 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1971  hypothetical protein  30.46 
 
 
362 aa  156  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4706  sporulation integral membrane protein YtvI  31.6 
 
 
372 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0531  sporulation integral membrane protein YtvI  31.29 
 
 
372 aa  153  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.671743 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3372  sporulation integral membrane protein YtvI  32.14 
 
 
353 aa  151  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0024  hypothetical protein  31.28 
 
 
355 aa  145  9e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4426  sporulation integral membrane protein YtvI  31.59 
 
 
372 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2683  sporulation integral membrane protein YtvI  32.22 
 
 
372 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0571053  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1013  hypothetical protein  31.4 
 
 
360 aa  135  8e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000395023  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0888  hypothetical protein  28.21 
 
 
370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000401846  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07720  Sporulation integral membrane protein YtvI  28.53 
 
 
355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1040  hypothetical protein  29.61 
 
 
366 aa  128  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00428171  unclonable  0.0000000129007 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3703  sporulation integral membrane protein YtvI  31.56 
 
 
365 aa  126  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000243637  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0614  hypothetical protein  25.8 
 
 
358 aa  120  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0429  sporulation integral membrane protein YtvI  26.42 
 
 
375 aa  119  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3205  sporulation integral membrane protein YtvI  27.03 
 
 
362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000954806  hitchhiker  0.000000642415 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0189  sporulation integral membrane protein YtvI  25.29 
 
 
383 aa  114  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0779  sporulation integral membrane protein YtvI  39.79 
 
 
372 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3838  sporulation integral membrane protein YtvI  26.99 
 
 
344 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000542228  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0628  sporulation integral membrane protein YtvI  26.24 
 
 
367 aa  106  5e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2662  sporulation integral membrane protein YtvI  25.45 
 
 
354 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2429  hypothetical protein  27.3 
 
 
356 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1173  protein of unknown function UPF0118  25.54 
 
 
386 aa  99  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0115  sporulation integral membrane protein YtvI  23.9 
 
 
356 aa  94  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00027098  hitchhiker  0.00391046 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3488  sporulation integral membrane protein YtvI  23.96 
 
 
374 aa  87.8  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000381599  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0585  sporulation integral membrane protein YtvI  27.2 
 
 
351 aa  86.7  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0427  sporulation integral membrane protein YtvI  26.3 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  24.7 
 
 
373 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  25.7 
 
 
417 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  23.51 
 
 
373 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  23.21 
 
 
376 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  23.21 
 
 
376 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  23.21 
 
 
376 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  23.21 
 
 
376 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  23.49 
 
 
373 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  23.21 
 
 
373 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  23.19 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  23.19 
 
 
373 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  22.77 
 
 
368 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  23.88 
 
 
363 aa  69.3  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  22.66 
 
 
393 aa  69.3  0.00000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  23.03 
 
 
372 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2984  sporulation integral membrane protein YtvI  25.45 
 
 
354 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  22.85 
 
 
351 aa  67.8  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  26.42 
 
 
368 aa  67  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0554  hypothetical protein  25.17 
 
 
366 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0276  protein of unknown function UPF0118  24.31 
 
 
423 aa  63.9  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  25.87 
 
 
390 aa  63.5  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  23.88 
 
 
369 aa  63.5  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0568  hypothetical protein  24.83 
 
 
366 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  24.5 
 
 
382 aa  61.6  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  22.79 
 
 
424 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3442  protein of unknown function UPF0118  26.32 
 
 
397 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.804701 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  27.78 
 
 
339 aa  60.5  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  30.18 
 
 
341 aa  60.1  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  23.47 
 
 
354 aa  60.1  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  23.96 
 
 
344 aa  60.1  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  21.7 
 
 
360 aa  59.7  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1439  hypothetical protein  22.55 
 
 
366 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0335022  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3329  hypothetical protein  21.85 
 
 
365 aa  57.4  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63767  normal  0.12265 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  24.7 
 
 
384 aa  57.4  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  22.04 
 
 
402 aa  57  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  22.04 
 
 
402 aa  57  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0716  hypothetical protein  20.33 
 
 
366 aa  56.6  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.073836  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  25.71 
 
 
329 aa  56.6  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2171  hypothetical protein  25.78 
 
 
366 aa  56.6  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.655201  normal  0.719413 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  25.07 
 
 
354 aa  56.2  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0916  protein of unknown function UPF0118  26.76 
 
 
355 aa  55.8  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.116301  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  22.26 
 
 
369 aa  55.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6357  protein of unknown function UPF0118  21.26 
 
 
363 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  23.93 
 
 
387 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  23.92 
 
 
351 aa  55.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2217  hypothetical protein  22.35 
 
 
351 aa  54.3  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.253249  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  24.15 
 
 
435 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  23.12 
 
 
383 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0707  permease, putative  19.43 
 
 
391 aa  53.9  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  23.36 
 
 
353 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  23.32 
 
 
351 aa  53.5  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2382  membrane protein  23.45 
 
 
355 aa  53.5  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  24.46 
 
 
345 aa  53.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  22.55 
 
 
354 aa  53.1  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  20.94 
 
 
363 aa  52.8  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  22.77 
 
 
367 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  20.07 
 
 
349 aa  52.4  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0409  hypothetical protein  29.07 
 
 
387 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  23.51 
 
 
368 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3310  protein of unknown function UPF0118  23.78 
 
 
354 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  22.75 
 
 
357 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1118  transport protein  29.41 
 
 
339 aa  51.2  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  23.66 
 
 
357 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>