194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1425 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1425  surface antigen (D15)  100 
 
 
843 aa  1684    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491464  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2265  surface antigen (D15)  34.14 
 
 
839 aa  441  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1684  surface antigen (D15)  32.32 
 
 
862 aa  384  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.434922  normal  0.438103 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  24.35 
 
 
553 aa  124  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1295  surface antigen (D15)  26.97 
 
 
560 aa  122  3.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000151502  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  22.1 
 
 
820 aa  94  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.65 
 
 
793 aa  88.2  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  20.15 
 
 
806 aa  87.8  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  22.89 
 
 
752 aa  87.4  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4497  surface antigen (D15)  25.69 
 
 
688 aa  87.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537472  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  19.88 
 
 
793 aa  86.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  20.96 
 
 
763 aa  86.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0434  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.17 
 
 
821 aa  84.7  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000592139  normal  0.27128 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0073  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23 
 
 
772 aa  83.6  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  5.06207e-17 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0397  surface antigen (D15)  23.11 
 
 
830 aa  84  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00277353  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0815  surface antigen (D15)  20.83 
 
 
961 aa  84  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.59 
 
 
848 aa  82.4  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0254  surface antigen (D15)  22.18 
 
 
683 aa  82.4  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103892  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  22.54 
 
 
769 aa  82.4  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.84 
 
 
802 aa  82  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0432  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.57 
 
 
834 aa  79.7  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  23.93 
 
 
765 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3741  surface antigen (D15)  26.09 
 
 
821 aa  79  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0248  surface antigen (D15)  22.03 
 
 
926 aa  78.6  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.51 
 
 
808 aa  77  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0724  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.4 
 
 
803 aa  75.9  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.000000000000238666  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0623  outer membrane protein assembly factor  21.4 
 
 
803 aa  75.9  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000661464  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0400  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.63 
 
 
827 aa  74.3  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000108596  unclonable  0.0000045929 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.35 
 
 
752 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.36 
 
 
895 aa  73.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.95 
 
 
831 aa  71.2  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000452148  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1796  surface antigen (D15)  22.86 
 
 
818 aa  70.9  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00389709  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01121  outer membrane antigen  20.04 
 
 
788 aa  70.1  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.385807  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0636  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.17 
 
 
775 aa  68.9  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0791016  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1843  outer membrane protein assembly factor YaeT  20.53 
 
 
803 aa  68.6  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000194278  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0362  surface antigen (D15)  23.9 
 
 
752 aa  67.8  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0928  outer envelope membrane protein  24.82 
 
 
721 aa  67  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0355  surface antigen (D15)  23.9 
 
 
752 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0611  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.31 
 
 
920 aa  67  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310998  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  20.78 
 
 
790 aa  66.2  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.91 
 
 
765 aa  66.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0215  conserved hypothetical protein, putative outer membrane protein  20.25 
 
 
738 aa  65.1  0.000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0238562  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  23.9 
 
 
785 aa  63.9  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1590  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.97 
 
 
779 aa  63.9  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281239  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.81 
 
 
895 aa  63.9  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0928  surface antigen (D15)  23.72 
 
 
668 aa  64.3  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.27 
 
 
780 aa  63.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0142  OMP85 family outer membrane protein  22.71 
 
 
739 aa  63.2  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0561822  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0942  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.02 
 
 
751 aa  63.5  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000918625  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2608  surface antigen (D15)  23.88 
 
 
843 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.24 
 
 
765 aa  62.4  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  21.24 
 
 
765 aa  62.4  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  23.52 
 
 
781 aa  62.4  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.52 
 
 
803 aa  62  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  20.61 
 
 
888 aa  61.6  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1757  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.29 
 
 
759 aa  61.2  0.00000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000442418  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.55 
 
 
769 aa  60.8  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0660  surface antigen (D15)  25.06 
 
 
755 aa  60.8  0.00000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.665209  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1501  OMP85 family outer membrane protein  27.21 
 
 
757 aa  60.8  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  21.65 
 
 
896 aa  60.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1751  surface antigen family protein  24.23 
 
 
820 aa  59.7  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0980  surface antigen  20.65 
 
 
802 aa  59.7  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00787602  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.03 
 
 
770 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_002950  PG0191  outer membrane protein, putative  21.7 
 
 
891 aa  59.3  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.796772 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0545  hypothetical protein  21.27 
 
 
770 aa  59.3  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0463  surface antigen family protein  22.75 
 
 
858 aa  58.9  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  21.99 
 
 
763 aa  58.9  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  21.82 
 
 
760 aa  59.7  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  21.74 
 
 
768 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  21.74 
 
 
768 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  21.74 
 
 
768 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  21.74 
 
 
768 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  21.74 
 
 
769 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1766  surface antigen (D15)  20.64 
 
 
766 aa  58.5  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0726033  normal  0.0207518 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.95 
 
 
797 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2607  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.88 
 
 
811 aa  58.2  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.745531  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  21.34 
 
 
769 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  21.34 
 
 
768 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  21.19 
 
 
923 aa  58.2  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  20.68 
 
 
765 aa  57.8  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  21.34 
 
 
769 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  25.95 
 
 
794 aa  57.8  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0554  chloroplast outer envelope membrane protein-like  25.37 
 
 
739 aa  57.8  0.0000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0569  hypothetical protein  21.27 
 
 
770 aa  57  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  21.28 
 
 
767 aa  57.4  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1388  surface antigen (D15)  24.04 
 
 
788 aa  57.4  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156909  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0515  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.05 
 
 
781 aa  57.4  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.404864 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1446  surface antigen (D15)  19.81 
 
 
765 aa  57.4  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.332057 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3794  surface antigen (D15):surface antigen variable number  21.55 
 
 
790 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173749 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  20.05 
 
 
751 aa  57  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2334  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.29 
 
 
763 aa  56.2  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0117402 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0589  OMP85 family outer membrane protein  22.38 
 
 
798 aa  55.8  0.000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00373174  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2040  surface antigen (D15)  22.88 
 
 
909 aa  56.2  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.813925 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3045  surface antigen (D15)  22.34 
 
 
786 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2385  Patatin  22.2 
 
 
894 aa  55.5  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  25.6 
 
 
595 aa  55.1  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.83 
 
 
784 aa  54.7  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1996  surface antigen (D15)  23.89 
 
 
779 aa  54.7  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685861  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  26.91 
 
 
770 aa  54.3  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1388  surface antigen (D15)  26.53 
 
 
795 aa  54.7  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0577653  normal  0.0157833 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>